; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G011040 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G011040
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionglucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like
Genome locationCmo_Chr19:9432254..9435022
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G011040
SyntenyCmoCh19G011040
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044965 - Glycoside hydrolase family 17, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572453.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.3e-13499.21Show/hide
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XP_023554113.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-13398.03Show/hide
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XP_031744909.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 isoform X1 [Cucumis sativus]1.9e-11487.2Show/hide
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XP_038887351.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.8e-11790Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3M5 X8 domain-containing protein2.3e-9786.57Show/hide
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A0A0A0K8Y4 X8 domain-containing protein1.6e-11486.8Show/hide
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A0A1S4DWJ2 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like5.4e-11587.2Show/hide
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A0A5A7SSE1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like1.5e-9392.35Show/hide
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A0A6J1D2V3 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like6.8e-11086.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q84V39 Major pollen allergen Ole e 104.2e-1641.32Show/hide
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Q8VYE5 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 121.0e-1735.75Show/hide
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        N T  S T S T  SP  SS P+   +               WCIAS  AS T LQ ALD+ACG G  DCSA+Q  Q C+ P+T+ +HASYAFN+YYQ++
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           +  C+F G +V    DPS   C Y     +     T       + G + +  SP A+        +Q+++   V L
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Q9FJU9 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 133.3e-1642.74Show/hide
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        S  SWCIAS  AS+  L+ ALD+ACG G  DC+AIQ  Q C+ P+T+ +HAS+ FNSY+Q+N   + +C+FGG  V  + DPS   C Y +        N
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Query:  TTNSKGSTVFGGVPSSP
         T +  +T      S+P
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 17.7e-1842.4Show/hide
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        S ASWC+     S T LQ  LDYACG+ G DC+  +  Q C+NP+ + +H +YA NS++Q K   P SCNF GTA  T++DPS   C + ++++ SS   
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             TTN KGS     +P S + S
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Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 32.9e-1737.76Show/hide
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        ++CIA +   +  LQ ALD+ACG G  DCSA+  G+ CY P+ +  H++YAFN+YYQK      SC+F G A +T+TDPS   C +  ++ S+  L N T
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Query:  N----SKGSTVFGGVPSSPSPSAATCQEINVVQQLLLVTMVSL
        +    S  ST  G +P       A+  ++ ++  LL++ +V L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.6e-2643.33Show/hide
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        PV T      TP  T P   ++NP    P   P+ T     P +  P  S SP +SG SWC+A   ASQ +LQ ALDYACG    DCS +Q G  CY+P 
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        ++ +HAS+AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +T+PST +C Y   +STST  +   TT +  +      P + +P   T
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein5.0e-2852.85Show/hide
Query:  LSGASWCIASQSASQTALQVALDYACGHGGTDCSAIQTGQRCYNPNTIHNHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSILN
        +    WCIA  +AS T+LQVALDYACG+GG DC  IQ G  CY PNTI +HAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TSTDPS  +C ++S+S + S  +
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Query:  TTNSKGSTVFGGVPSSPSPSAAT
          +      F   PSS  P   T
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AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein7.6e-3750Show/hide
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        ++DITTP+ T PT   + PT   P  +  +++   +P T+ S           SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G  CYNPN++  H
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        AS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS  +C + STSTS SILN T+  G  +FG +PS P+P
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AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein6.5e-2850Show/hide
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Query:  ASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPS
        AS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS
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AT5G55180.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein5.9e-2151.09Show/hide
Query:  PPLSGASWCIASQSASQTALQVALDYACGHGGTDCSAIQTGQRCYNPNTIHNHASYAFNSYYQKNP-VPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQY
        P L G +WC+A+   ++  LQ  LDYACG GG DC  IQ G  CYNP ++  HASYAFNSYYQKN     +CNFGG A + S  P    C++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTGCAG
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