; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh20G001460 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh20G001460
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionPectinesterase
Genome locationCmo_Chr20:719470..720545
RNA-Seq ExpressionCmoCh20G001460
SyntenyCmoCh20G001460
Gene Ontology termsGO:0042545 - cell wall modification (biological process)
GO:0045490 - pectin catabolic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0030599 - pectinesterase activity (molecular function)
GO:0045330 - aspartyl esterase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000070 - Pectinesterase, catalytic
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold
IPR033131 - Pectinesterase, Asp active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6570446.1 Pectinesterase PPME1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-13799.58Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHP+FDKTVFFGEYKSSGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

KAG6570448.1 Pectinesterase PPME1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-13799.58Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHP+FDKTVFFGEYKSSGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

XP_022944179.1 pectinesterase PPME1-like isoform X1 [Cucurbita moschata]8.8e-138100Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

XP_023512286.1 probable pectinesterase 48 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-13092.86Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLT+EAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKF+GFQDTLCDDDGMHVYKDC IEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        SLYLNSQLNV+GEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCS+TGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIAD+LHPEGWDDMN+P FDKTVFFGE+K SGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETS R+KFSKQLS+A+ KPF++LDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

XP_023512569.1 pectinesterase PPME1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.7e-13698.74Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEA+YFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKD FIEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCS+TGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1FW87 Pectinesterase4.3e-138100Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

A0A6J1FYI4 Pectinesterase2.5e-13092.44Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MPKLTFDGD+KKYGTVYSGTLT+E+EYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDC IEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        +LYLN+QLNV+GEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIAD+LHPEGWDDMN+P FDKTVFFGEYK SGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETS R+KFSKQL++A+VKPF++LDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

A0A6J1J5H3 Pectinesterase2.6e-12790.34Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MP LTFDGD+KKYGTVYS TL +EAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDG+HVYKDCFI+GTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        +LYLNSQLNV+G GGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYL RSWRPWSRVVFAYTTIAD+LHPEGWDDMN+P FDKTVFFGE+K SGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETS R+KFSKQLS+A+ KPF++LDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

A0A6J1J8V7 Pectinesterase2.6e-12790.34Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MP LTFDGD+KKYGTVYS TL +EAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDG+HVYKDCFI+GTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        +LYLNSQLNV+G GGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYL RSWRPWSRVVFAYTTIAD+LHPEGWDDMN+P FDKTVFFGE+K SGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETS R+KFSKQLS+A+ KPF++LDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

A0A6J1JE99 Pectinesterase1.5e-13094.96Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT
        MP LTFDGD+KKYGTVYS TL +EAEYFVAANLVIEN+SPRPD R+GG ALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKD FIEGTVDFIFGKAT
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKAT

Query:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
        SLYLNSQLNVVG GGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYL RSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA
Subjt:  SLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGA

Query:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
Subjt:  ETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q84WM7 Pectinesterase PPME12.2e-7553.97Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA
        MP +T+DG + KYGTV S +L + ++YF+A N+V++NT+P PD + KG  AL+ RI GN AA YNCKF GFQDT+CDD G H +KDC++EGT DFIFG  
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA

Query:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG
        TS+YL +QL+VVG+ G+ VIAAH+ +  ++ SGY F HC +TGTGG   YL R+W    +VV+AYT +  V++P GW +   P  DKTVF+GEYK SGPG
Subjt:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG

Query:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        +  + R+ F++ + D E   FLSL Y+Q  KWLLPPP L
Subjt:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

Q9FKF3 Putative pectinesterase 631.0e-7253.16Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDA-RKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA
        MP LTFDG + +YGTV S TL + ++YF+A N++++N++P PD  RKG  AL+ RI GNKAA YNCKF G+QDT+CDD G H +KDC+IEGT DFIFG  
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDA-RKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA

Query:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG
         SLYL +QLNVVG+ G+ VI AH+ +   + SGY F HC +TGT G   YL RSW    +VV+AYT ++ V++P GW +      DKTVF+GEYK +G G
Subjt:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG

Query:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP
        +    R+K+++ + D E K F+SL Y+Q   WLLPPP
Subjt:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP

Q9LY17 Probable pectinesterase 504.5e-6851.71Show/hide
Query:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY
        LT+ G + +YGTV S TL + AEYF AA+L I+NT+P P     G ALA RI  +KAA Y+C+F GFQDTLCDD G H +KDC+IEGT DFIFG+  SLY
Subjt:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY

Query:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS
        LN+QL+ VG+ GL VI A  R+   + +GY F HC +TGT G   YL RSW    +VV+A+T +  V++P GW +  +  +DKTVF+GEYK  GPG+   
Subjt:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS

Query:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPK
         R+ +++ +   EV PFL+L Y++   WLLPPPK
Subjt:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPK

Q9LY18 Probable pectinesterase 499.3e-6651.07Show/hide
Query:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY
        LT+ G + KYGTV S TL + A  F+AANL I NTSP P     G ALA RI G+KAA YNC+F GFQDTLCDD G H +K+C+IEGT DFIFG+  SLY
Subjt:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY

Query:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS
        L +QL+ VG+ GL VIAAH+R+   + +GY F HC +TG  G   YL R+W    +VV++YT ++ V++P GW +      DKTVF+GEY  +GPG+  +
Subjt:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS

Query:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP
         R+  ++ + + E   FL+L Y++  KWLLPPP
Subjt:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP

Q9LY19 Probable pectinesterase 482.9e-7553.97Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA
        MP +T+DG + KYGTV S +L + ++YF+A N+V++NT+P PD + KG  AL+ RI GN AA YNCKF GFQDT+CDD G H +KDC++EGT DFIFG  
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA

Query:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG
        TS+YL +QL+VVG+ G+ VIAAH+ +  ++ SGY F HC +TGTGG   YL R+W    +VV+AYT +  V++P GW +   P  DKTVF+GEYK SGPG
Subjt:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG

Query:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        +  + R+ F++ + D E   FLSL Y+Q  KWLLPPP L
Subjt:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G69940.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.6e-7653.97Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA
        MP +T+DG + KYGTV S +L + ++YF+A N+V++NT+P PD + KG  AL+ RI GN AA YNCKF GFQDT+CDD G H +KDC++EGT DFIFG  
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA

Query:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG
        TS+YL +QL+VVG+ G+ VIAAH+ +  ++ SGY F HC +TGTGG   YL R+W    +VV+AYT +  V++P GW +   P  DKTVF+GEYK SGPG
Subjt:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG

Query:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        +  + R+ F++ + D E   FLSL Y+Q  KWLLPPP L
Subjt:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

AT5G07410.1 Pectin lyase-like superfamily protein2.1e-7653.97Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA
        MP +T+DG + KYGTV S +L + ++YF+A N+V++NT+P PD + KG  AL+ RI GN AA YNCKF GFQDT+CDD G H +KDC++EGT DFIFG  
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDAR-KGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA

Query:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG
        TS+YL +QL+VVG+ G+ VIAAH+ +  ++ SGY F HC +TGTGG   YL R+W    +VV+AYT +  V++P GW +   P  DKTVF+GEYK SGPG
Subjt:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG

Query:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL
        +  + R+ F++ + D E   FLSL Y+Q  KWLLPPP L
Subjt:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPKL

AT5G07420.1 Pectin lyase-like superfamily protein6.6e-6751.07Show/hide
Query:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY
        LT+ G + KYGTV S TL + A  F+AANL I NTSP P     G ALA RI G+KAA YNC+F GFQDTLCDD G H +K+C+IEGT DFIFG+  SLY
Subjt:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY

Query:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS
        L +QL+ VG+ GL VIAAH+R+   + +GY F HC +TG  G   YL R+W    +VV++YT ++ V++P GW +      DKTVF+GEY  +GPG+  +
Subjt:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS

Query:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP
         R+  ++ + + E   FL+L Y++  KWLLPPP
Subjt:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP

AT5G07430.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.2e-6951.71Show/hide
Query:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY
        LT+ G + +YGTV S TL + AEYF AA+L I+NT+P P     G ALA RI  +KAA Y+C+F GFQDTLCDD G H +KDC+IEGT DFIFG+  SLY
Subjt:  LTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLY

Query:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS
        LN+QL+ VG+ GL VI A  R+   + +GY F HC +TGT G   YL RSW    +VV+A+T +  V++P GW +  +  +DKTVF+GEYK  GPG+   
Subjt:  LNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETS

Query:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPK
         R+ +++ +   EV PFL+L Y++   WLLPPPK
Subjt:  SRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPPK

AT5G61680.1 Pectin lyase-like superfamily protein7.3e-7453.16Show/hide
Query:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDA-RKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA
        MP LTFDG + +YGTV S TL + ++YF+A N++++N++P PD  RKG  AL+ RI GNKAA YNCKF G+QDT+CDD G H +KDC+IEGT DFIFG  
Subjt:  MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDA-RKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKA

Query:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG
         SLYL +QLNVVG+ G+ VI AH+ +   + SGY F HC +TGT G   YL RSW    +VV+AYT ++ V++P GW +      DKTVF+GEYK +G G
Subjt:  TSLYLNSQLNVVGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPG

Query:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP
        +    R+K+++ + D E K F+SL Y+Q   WLLPPP
Subjt:  AETSSRIKFSKQLSDAEVKPFLSLDYVQAQKWLLPPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAAAATTGACATTTGATGGAGATTCCAAAAAATACGGCACCGTGTACAGTGGAACTTTGACCATGGAGGCTGAGTATTTTGTTGCTGCCAATCTCGTGATCGAGAA
CACTTCTCCAAGACCGGATGCGAGAAAAGGAGGTCCGGCATTGGCGGCGAGAATCAGAGGTAATAAAGCCGCAATTTACAACTGCAAGTTCATAGGGTTTCAAGACACCC
TTTGCGACGACGATGGGATGCATGTGTACAAGGATTGCTTCATCGAAGGCACCGTGGACTTCATCTTCGGGAAGGCAACGTCCCTGTATTTGAACAGTCAGCTGAATGTG
GTGGGAGAAGGGGGATTGGGAGTGATTGCAGCGCATTCAAGAGAAAAGGAAGACGACCCGAGTGGGTATGTGTTTGCGCATTGCAGCATTACAGGCACGGGCGGGCCTAA
CACTTATTTGGCAAGATCCTGGAGGCCTTGGTCCAGAGTTGTGTTTGCGTACACCACCATTGCCGACGTCCTTCATCCTGAAGGCTGGGACGACATGAACCACCCTGATT
TCGACAAGACGGTTTTCTTCGGAGAATATAAGAGTTCGGGGCCGGGAGCGGAGACGAGCAGCCGCATAAAATTCAGCAAACAGCTGAGTGATGCAGAAGTGAAACCGTTC
CTCAGCCTTGATTACGTGCAGGCCCAAAAGTGGCTGCTTCCTCCCCCCAAGCTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGAAAAGTCGCAATTAGAAGCTTGGTTTTCCGAAAACGTGAAGCCCTTAAGCGCTCGCAAGGCGGAGCTTGATCCAGCCCTTGTGGCCGCTGAAGAAAACGCCACCGTG
GTCAAAGTAAGGGCCGACGGAAGTGGAGATTTCAAGACTGTCACCGAAGCCATCGCCAGCGTTCCAGCCGGTAACACCCACCGCGTCGTGATTTGGATTGGAGAAGGAGT
TTACAAGGAGAAGCTTACTATCGAGAGAAATAAACCATTCATTACCCTTTACGGTTCCCCTAAGAATATGCCAAAATTGACATTTGATGGAGATTCCAAAAAATACGGCA
CCGTGTACAGTGGAACTTTGACCATGGAGGCTGAGTATTTTGTTGCTGCCAATCTCGTGATCGAGAACACTTCTCCAAGACCGGATGCGAGAAAAGGAGGTCCGGCATTG
GCGGCGAGAATCAGAGGTAATAAAGCCGCAATTTACAACTGCAAGTTCATAGGGTTTCAAGACACCCTTTGCGACGACGATGGGATGCATGTGTACAAGGATTGCTTCAT
CGAAGGCACCGTGGACTTCATCTTCGGGAAGGCAACGTCCCTGTATTTGAACAGTCAGCTGAATGTGGTGGGAGAAGGGGGATTGGGAGTGATTGCAGCGCATTCAAGAG
AAAAGGAAGACGACCCGAGTGGGTATGTGTTTGCGCATTGCAGCATTACAGGCACGGGCGGGCCTAACACTTATTTGGCAAGATCCTGGAGGCCTTGGTCCAGAGTTGTG
TTTGCGTACACCACCATTGCCGACGTCCTTCATCCTGAAGGCTGGGACGACATGAACCACCCTGATTTCGACAAGACGGTTTTCTTCGGAGAATATAAGAGTTCGGGGCC
GGGAGCGGAGACGAGCAGCCGCATAAAATTCAGCAAACAGCTGAGTGATGCAGAAGTGAAACCGTTCCTCAGCCTTGATTACGTGCAGGCCCAAAAGTGGCTGCTTCCTC
CCCCCAAGCTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPKLTFDGDSKKYGTVYSGTLTMEAEYFVAANLVIENTSPRPDARKGGPALAARIRGNKAAIYNCKFIGFQDTLCDDDGMHVYKDCFIEGTVDFIFGKATSLYLNSQLNV
VGEGGLGVIAAHSREKEDDPSGYVFAHCSITGTGGPNTYLARSWRPWSRVVFAYTTIADVLHPEGWDDMNHPDFDKTVFFGEYKSSGPGAETSSRIKFSKQLSDAEVKPF
LSLDYVQAQKWLLPPPKL