; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh20G004660 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh20G004660
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscription factor MYB59-like
Genome locationCmo_Chr20:2156339..2156806
RNA-Seq ExpressionCmoCh20G004660
SyntenyCmoCh20G004660
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR044676 - MYB-like transcription factor EOBI/EOBII-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6570729.1 Transcription factor MYB48, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-81100Show/hide
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KAG7010573.1 Transcription factor MYB59, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.1e-80100Show/hide
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XP_022943941.1 transcription factor MYB59-like [Cucurbita moschata]2.2e-81100Show/hide
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XP_023511995.1 myb-related protein MYBAS1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-81100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3DL17 Transcription factor MYB48-like isoform X28.3e-5073.96Show/hide
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A0A6J1D2K9 transcription factor MYB59 isoform X15.3e-6586.88Show/hide
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        SEEDC NFSCPALTS +PWDYYCGDSLWRM EEEESKLIFSGYDHNGRPRLAQ NQNFFY
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A0A6J1D513 transcription factor MYB59 isoform X25.3e-6586.88Show/hide
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A0A6J1FT29 transcription factor MYB59-like1.1e-81100Show/hide
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A0A6J1JHY1 transcription factor MYB59-like7.7e-8098.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4JL84 Transcription factor MYB591.6e-0536.03Show/hide
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           + P L SPT W+    +S+W M+ +E     F+
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Q53NK6 Myb-related protein MYBAS15.8e-0837.41Show/hide
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        MRKKAQE+R  +S SSSSSS    +        DT P+   D  G +I    S   + +   Q + D  G++MD IWK+I+     SL +  D   ++ C
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        +N  CP LTS T  DY C +  W+++ EE   L   SGY
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Q9LX82 Transcription factor MYB481.3e-0734.78Show/hide
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        +D+YSE+  +  S P L SP+ W+    DS+W M+ ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G46130.1 myb domain protein 489.2e-0934.78Show/hide
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        +D+YSE+  +  S P L SP+ W+    DS+W M+ ++
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AT3G46130.2 myb domain protein 489.2e-0934.78Show/hide
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        +D+YSE+  +  S P L SP+ W+    DS+W M+ ++
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AT3G46130.3 myb domain protein 489.2e-0934.78Show/hide
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AT3G46130.4 myb domain protein 489.2e-0934.78Show/hide
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        +D+YSE+  +  S P L SP+ W+    DS+W M+ ++
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AT5G59780.1 myb domain protein 591.1e-0636.03Show/hide
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        MRKKAQEK+R +S +SSSS+  SS+                D+GGS           KM  NQE  D   +SMDDIW++ID S    +   +D Y  E  
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           + P L SPT W+    +S+W M+ +E     F+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGTGAAGTTTTTCGACTCAGGGGGGTCTGAAATCTCAGCTTCATCATCATCAACAAAGAAGAAGATGGTGGAGAATCAAGAACTGGGTGATCCAAATGGATTCTCCATGG
ATGATATATGGAAAGATATTGATCTATCGGATCATGAGAGCTTGACTATGAATCAAGATGTGTACAGTGAAGAAGACTGCAACAACTTTTCTTGCCCTGCCCTGACATCT
CCTACTCCTTGGGACTATTATTGTGGGGATTCTCTGTGGAGGATGGAGGAGGAGGAAGAGAGTAAGCTAATTTTCTCTGGGTATGATCATAACGGGAGGCCACGCCTTGC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGAAGAAGGCACAGGAGAAAAGAAGGGCTTTGTCTTCATCTTCCTCCTCCTCGTCCTCTTATTCATCCAACAACCCAGCTGTGGAGTTCCCTGCAGACACTGGACC
AGTGAAGTTTTTCGACTCAGGGGGGTCTGAAATCTCAGCTTCATCATCATCAACAAAGAAGAAGATGGTGGAGAATCAAGAACTGGGTGATCCAAATGGATTCTCCATGG
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CCTACTCCTTGGGACTATTATTGTGGGGATTCTCTGTGGAGGATGGAGGAGGAGGAAGAGAGTAAGCTAATTTTCTCTGGGTATGATCATAACGGGAGGCCACGCCTTGC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PTPWDYYCGDSLWRMEEEEESKLIFSGYDHNGRPRLAQPNQNFFY