CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh20G005370
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like
Genome location	Cmo_Chr20:2610647..2612534
RNA-Seq Expression	CmoCh20G005370
Synteny	CmoCh20G005370
Gene Ontology terms	GO:0042026 - protein refolding (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR001844 - Chaperonin Cpn60 IPR002423 - Chaperonin Cpn60/TCP-1 family IPR018370 - Chaperonin Cpn60, conserved site IPR027409 - GroEL-like apical domain superfamily IPR027410 - TCP-1-like chaperonin intermediate domain superfamily IPR027413 - GroEL-like equatorial domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6570801.1 hypothetical protein SDJN03_29716, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.4e-243

99.15

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

KAG7010643.1 hypothetical protein SDJN02_27438 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.1e-243

98.93

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKL+ERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

XP_022943380.1 ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like [Cucurbita moschata]

1.1e-243

99.36

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

XP_022985565.1 ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like isoform X1 [Cucurbita maxima]

3.4e-242

98.5

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFEN RVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENT+IEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

XP_023511889.1 ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.2e-242

98.72

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENT+IEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3CNM2 ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha

3.4e-240

97.44

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLI+ELE KARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIG+MIADAI KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVL+TDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        S+WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP AAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

A0A4Y5WS72 RuBisCO1

1.0e-239

97.22

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLI+ELE KARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIG MIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAED+TGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKAMLQDIAILTGAEFQA+DLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGG ALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADI+QKALVAPASLIAQNAG+EGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP AAPQGLTV
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

A0A5D3DFR6 RuBisCO large subunit-binding protein subunit alpha

3.4e-240

97.44

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLI+ELE KARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIG+MIADAI KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVL+TDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        S+WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP AAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

A0A6J1FXR2 ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like

5.1e-244

99.36

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

A0A6J1JBN6 ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like isoform X1

1.6e-242

98.5

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFEN RVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENT+IEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV
        SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P08823 RuBisCO large subunit-binding protein subunit alpha, chloroplastic (Fragment)

5.0e-212

83.8

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTA VLAREIIKLG+L+VTSGANPVSLK+GIDKTVQGLI+ELE KAR ++G  DIKAVASISAGNDELIG MIADAI+KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTV+VEEGM IDRGYISPQFVTN EK I EFENARVL+TDQKI++IK+IIP+LE+TTQLR PL I+AED+TGEALATLVVNKLRGI+NV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAPSFGERRKA+LQDIAI+TGAE+ A DLGLLVEN T++QLG ARK+TI + TTT+IADAASKDE+QAR+AQLKKEL+ETDS+YD+EKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGA TETELEDR+LRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAA VHLST VPAIK+ +ED +E+LGADI+QKAL APASLIA NAG+EGEVV+EKIK 
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAP
        SEWE+GYNAMTDKYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASV+GMVLTTQAIVVEKPKPK   A P
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAP

P08824 RuBisCO large subunit-binding protein subunit alpha (Fragment)

1.5e-213

90.8

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLL+VTSGANPVS+KRGIDKTVQGLI+ELE KAR ++GRDDIKAVASISAGNDELIG MIADAI+KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGM IDRGYISPQFVTNPEKLI EFENARVLVTDQKI+AIKDIIP+LEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNK+RGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKA+LQDIAILTGAEFQA+DLGLLVENT++EQLG+ARKVTI+KD+TT+IADAASKDELQARIAQLK+ELAETDSVYD+EKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLST+VPAI  + +DA+E+LGADI+QKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEK+K+
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQN
         EWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQN
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQN

P08926 RuBisCO large subunit-binding protein subunit alpha, chloroplastic

3.3e-224

88.7

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTAS+LAREIIKLGLLNVTSGANPVS+K+GIDKTV  L++ELE  AR ++G DDIKAVA+ISAGNDELIG MIA+AI+KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESS+SFETTVEVEEGM IDRGYISPQFVTNPEK I EFENARVL+TDQKISAIKDIIP+LEKTTQLRAPLLII+ED+TGEALATLVVNKLRGILNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AAIKAP FGERRKA+LQDIAILTGAEFQA+DLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKD+TTIIADAASKDELQ+R+AQLKKEL+ETDS+YD+EKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGG ALVHLS  VPAIK+KLEDA+E+LGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKIK+
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP-TAAPQGLTV
         EWE+GYNAMTD YENLVE+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKA   AAPQGLT+
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP-TAAPQGLTV

P21238 Chaperonin 60 subunit alpha 1, chloroplastic

3.4e-221

87.63

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTAS+LAREIIK GLL+VTSGANPVSLKRGIDKTVQGLI+EL+ KAR ++GRDDI+AVASISAGND+LIG MIADAI+KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGM IDRGYISPQFVTNPEKL+AEFENARVL+TDQKI+AIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRG+LNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
         A+KAP FGERRKAMLQDIAILTGAE+ A D+ LLVEN TI+QLG+ARKVTISKD+TT+IADAASKDELQARIAQLKKEL ETDSVYD+EKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLST++PAIK+  EDA+E+LGADIVQKAL++PA+LIAQNAG+EGEVVVEKI  
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP-TAAPQGLTV
        S+WE GYNAMTD YENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKPKAP  AAP+GL V
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP-TAAPQGLTV

P21239 RuBisCO large subunit-binding protein subunit alpha, chloroplastic (Fragment)

2.5e-224

88.91

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIK GLL+VTSGANPVSLKRGIDKTVQ LI+ELE +AR ++G  DIKAVA+ISAGNDEL+G MIADAI+KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGM IDRGYISPQFVTNPEKL+ EFENARVL+TDQKI+AIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRG+LNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
         A+KAP FGERRKAMLQDIAILTGAE+QA D+GLLVENTTI+QLG+ARKVTISKD+TT+IADAASKDELQARI+QLKKEL+ETDSVYD+EKLAERIAKL+
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLST++PAIK+KLEDA+E+LGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKI  
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAA-PQGLTV
        SEWEIGYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKPKAPTAA PQGL V
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAA-PQGLTV

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G55490.1 chaperonin 60 beta

7.1e-121

51.75

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        V + A+KTND AGDGTTT+ VLA+  I  G+  V +GANPV + RGI+KT + L+ EL+  ++ +E   ++  VA++SAGN++ IG MIA+A+ KVG  G
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        V+++E   S E  + V EGM  DRGYISP FVT+ EK+  EF+N ++L+ D+KI+  +D++ +LE   +   P+LIIAED+  EALATLVVNKLRG L +
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AA++AP FGER+   L DIAILTGA     ++GL ++    E LG A KV ++K+T+TI+ D +++D ++ R+ Q+K  + + +  Y+ EKL ERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVI+VGA TETEL+++KLR+EDA NAT AA+EEGIV GGG  L+ L++ V AIK  L++ EEK+GADIV++AL  P  LIA+NAG+ G VV EK+ S
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SE-WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPK
        ++  + GYNA T KYE+L+ AG+IDP KV RC L++AASVA   L +  +VVE  +P+
Subjt:  SE-WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPK

AT2G28000.1 chaperonin-60alpha

2.4e-222

87.63

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VASKTNDSAGDGTTTAS+LAREIIK GLL+VTSGANPVSLKRGIDKTVQGLI+EL+ KAR ++GRDDI+AVASISAGND+LIG MIADAI+KVGPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        VLSIESSSSFETTVEVEEGM IDRGYISPQFVTNPEKL+AEFENARVL+TDQKI+AIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRG+LNV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
         A+KAP FGERRKAMLQDIAILTGAE+ A D+ LLVEN TI+QLG+ARKVTISKD+TT+IADAASKDELQARIAQLKKEL ETDSVYD+EKLAERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLST++PAIK+  EDA+E+LGADIVQKAL++PA+LIAQNAG+EGEVVVEKI  
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP-TAAPQGLTV
        S+WE GYNAMTD YENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKPKAP  AAP+GL V
Subjt:  SEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAP-TAAPQGLTV

AT5G18820.1 TCP-1/cpn60 chaperonin family protein

4.1e-153

60.26

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        + +VA K N+SAGDGTTTA +LARE+IK G L +  GAN VS+K G++KTV+ L++ L+ K+  ++G++DIKAVASISAGNDE +G +IA+ +EK+GPDG
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        V+SIESSS+ ET+V VEEGM  D+GY+SP F+TN EK   EF+ A++LVTDQKI++ K+++P+LEKT+QL  PLLIIAED++ E L  LVVNK +G++NV
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        A +K P   + +KA+LQDIA++TGA++ + DLG+ +   T +QLG++R+V I+ ++TTI+ADA++K E+QARIAQ+KK+LAETD+ Y ++K+AERIAKL+
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKL-EDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIK
        GGVAVIKVG  TETELEDRKLRIEDAKNATFAA+ EGIVPGGGA  +HL   +P IK  L ED+ E++GADIV  AL APA  IA NAG++G VVV+K +
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKL-EDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIK

Query:  SSEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEK---PKPKAP
          EW  GYNAM+ KYE+L+ AG+ DP +V+R ALQNA SVAG++LTTQA++VEK   PKP  P
Subjt:  SSEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEK---PKPKAP

AT5G56500.1 TCP-1/cpn60 chaperonin family protein

1.1e-121

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        V + ASKTND AGDGTTT+ VLA+ +I  G+  V +GANPV + RGI+KT + L+ EL+  ++ +E   ++  VA++SAGN+  +G MIA+A+ KVG  G
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        V+++E   S E ++ V EGM  DRGYISP FVT+ EK+ AE+EN ++ + D+KI+  +DII ILE   +   PLLIIAED+  E LATLVVNKLRG + V
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AA+KAP FGER+   L DIA LTGA     ++GL +E    E LG A KV ++KDTTTI+ D ++++ ++ R+ Q+K  +   +  Y+ EKL ERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVI+VGA TETEL+++KLR+EDA NAT AA+EEGIV GGG  L+ L++ V AIK+ L + EEK+GADIV+KAL  P  LIA+NAG+ G VV EK+ S
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SE-WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQG
        S+  + GYNA T KYE+L+ AG+IDP KV RC L++A+SVA   L +  +VVE  +P+  +AAP G
Subjt:  SE-WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQG

AT5G56500.2 TCP-1/cpn60 chaperonin family protein

1.1e-121

Show/hide

Query:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG
        V + ASKTND AGDGTTT+ VLA+ +I  G+  V +GANPV + RGI+KT + L+ EL+  ++ +E   ++  VA++SAGN+  +G MIA+A+ KVG  G
Subjt:  VMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDG

Query:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV
        V+++E   S E ++ V EGM  DRGYISP FVT+ EK+ AE+EN ++ + D+KI+  +DII ILE   +   PLLIIAED+  E LATLVVNKLRG + V
Subjt:  VLSIESSSSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNV

Query:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS
        AA+KAP FGER+   L DIA LTGA     ++GL +E    E LG A KV ++KDTTTI+ D ++++ ++ R+ Q+K  +   +  Y+ EKL ERIAKLS
Subjt:  AAIKAPSFGERRKAMLQDIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLS

Query:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS
        GGVAVI+VGA TETEL+++KLR+EDA NAT AA+EEGIV GGG  L+ L++ V AIK+ L + EEK+GADIV+KAL  P  LIA+NAG+ G VV EK+ S
Subjt:  GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKS

Query:  SE-WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQG
        S+  + GYNA T KYE+L+ AG+IDP KV RC L++A+SVA   L +  +VVE  +P+  +AAP G
Subjt:  SE-WEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTATTTGTCATGAAGGTTGCAAGTAAAACTAATGATTCTGCTGGTGATGGGACGACAACTGCCTCAGTCCTCGCTAGGGAAATTATCAAGCTAGGCCTGCTTAATGT
TACCTCCGGAGCAAATCCAGTATCACTGAAGAGAGGAATTGACAAGACCGTGCAAGGATTGATCCAAGAGCTTGAGAACAAGGCTAGGGCTATAGAAGGCAGAGATGATA
TAAAAGCTGTTGCTTCTATTTCTGCTGGAAATGACGAGCTTATAGGGATGATGATCGCTGATGCCATTGAAAAAGTGGGGCCTGATGGTGTCTTATCCATTGAGTCATCA
TCTTCCTTTGAGACCACTGTTGAAGTTGAAGAAGGGATGGCGATTGACAGAGGCTATATTTCTCCTCAGTTTGTTACAAACCCTGAAAAGTTAATTGCTGAATTTGAGAA
TGCACGAGTGTTAGTTACAGACCAGAAAATTTCGGCCATAAAGGATATAATCCCTATATTGGAGAAAACCACGCAATTGAGAGCTCCTTTGCTTATCATTGCAGAGGATG
TTACTGGTGAGGCTTTGGCTACCCTTGTTGTGAACAAGTTGCGGGGGATTCTAAATGTTGCTGCCATTAAAGCTCCGAGCTTTGGAGAAAGGAGAAAGGCGATGCTTCAA
GACATTGCCATTTTGACAGGTGCTGAGTTTCAAGCCAATGATCTTGGATTGCTAGTAGAAAATACTACAATTGAACAGCTTGGTTTGGCCCGAAAAGTGACCATCTCCAA
GGACACTACCACCATCATTGCTGACGCTGCTTCAAAAGACGAGCTACAAGCCAGGATTGCACAGCTAAAGAAGGAATTGGCGGAGACAGATTCTGTGTATGACACAGAGA
AACTCGCTGAAAGAATTGCCAAACTATCTGGTGGTGTTGCTGTCATTAAAGTAGGAGCTGCAACAGAGACTGAACTTGAGGACCGGAAGCTCCGTATTGAAGATGCAAAG
AATGCAACTTTCGCTGCCATAGAGGAAGGCATTGTACCTGGTGGTGGTGCTGCACTGGTTCACCTCTCAACTCTTGTCCCTGCAATCAAGGACAAGCTCGAAGATGCCGA
AGAGAAGCTCGGTGCCGATATTGTCCAAAAGGCGCTGGTAGCACCGGCATCCTTAATTGCCCAAAATGCTGGAATTGAAGGGGAAGTAGTGGTGGAGAAGATAAAGTCGA
GTGAATGGGAAATTGGTTACAACGCAATGACAGACAAGTACGAGAATCTAGTAGAGGCCGGCGTTATTGACCCAGCCAAGGTGACCAGATGTGCCTTGCAGAATGCAGCT
TCAGTTGCTGGGATGGTCCTAACCACACAGGCTATTGTAGTTGAAAAGCCCAAGCCCAAGGCACCCACCGCTGCACCACAAGGCCTTACTGTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLFVMKVASKTNDSAGDGTTTASVLAREIIKLGLLNVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLIQELENKARAIEGRDDIKAVASISAGNDELIGMMIADAIEKVGPDGVLSIESS
SSFETTVEVEEGMAIDRGYISPQFVTNPEKLIAEFENARVLVTDQKISAIKDIIPILEKTTQLRAPLLIIAEDVTGEALATLVVNKLRGILNVAAIKAPSFGERRKAMLQ
DIAILTGAEFQANDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDTTTIIADAASKDELQARIAQLKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAK
NATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTLVPAIKDKLEDAEEKLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKIKSSEWEIGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAA
SVAGMVLTTQAIVVEKPKPKAPTAAPQGLTV

CmoCh20G005370 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome