; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh20G005670 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh20G005670
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionlysosomal Pro-X carboxypeptidase-like
Genome locationCmo_Chr20:2753177..2754409
RNA-Seq ExpressionCmoCh20G005670
SyntenyCmoCh20G005670
Gene Ontology termsGO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR029058 - Alpha/Beta hydrolase fold
IPR042269 - Serine carboxypeptidase S28, SKS domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6570833.1 Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-3864.66Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPIGTDNDTMFP YTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

XP_022944258.1 lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like [Cucurbita moschata]2.0e-3965.41Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

XP_022986300.1 lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like [Cucurbita maxima]2.9e-3863.91Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLVKQRETEVSIIKEW+RKYYADLKE KQ
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

XP_023513392.1 lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-3763.64Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPIG DNDTMFPPYTFDL SFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESK
        TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESK
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESK

XP_038901952.1 lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like [Benincasa hispida]1.5e-3155.64Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPI T NDTMFPPYTFDL SF++ C QLYG+SPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLVKQRETEVSIIK W+ KYYADL+ESK+
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C8D9 lysosomal Pro-X carboxypeptidase2.0e-2952.63Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MP+ T NDTMFPP TFDLRSFI++C QLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLV+QRE EVSII+ W+ +YYADL++SK+
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

A0A5A7SW17 Lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like2.0e-2952.63Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MP+ T NDTMFPP TFDLRSFI++C QLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLV+QRE EVSII+ W+ +YYADL++SK+
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

A0A6J1CGA8 lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like3.1e-3054.14Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPI T NDTMFPPYTFDLRSF N+C+Q Y V PRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLV+QRETEVSIIK W+ +YYADL+ SKQ
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

A0A6J1FXV8 lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like9.7e-4065.41Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

A0A6J1JDP7 lysosomal Pro-X carboxypeptidase-like1.4e-3863.91Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE
        MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY                                              GSHCLDILRANE
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRANE

Query:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ
        TDPQWLVKQRETEVSIIKEW+RKYYADLKE KQ
Subjt:  TDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P42785 Lysosomal Pro-X carboxypeptidase8.0e-0727.27Show/hide
Query:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ
        MP  T+  D MF P++++L+   + C Q +GV PRP W+TT Y                                         G+H LD+   N  DP 
Subjt:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ

Query:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYY
         ++  R  EV  +K W+R +Y
Subjt:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYY

Q2TA14 Lysosomal Pro-X carboxypeptidase8.8e-0623.81Show/hide
Query:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ
        MP  +D  D MF P++++++ + + C + +GV PRP W+ T Y                                         G+H LD+  +N  DP 
Subjt:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ

Query:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKE
         +   R  EV  +K+W+  +Y  L++
Subjt:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKE

Q5RBU7 Lysosomal Pro-X carboxypeptidase1.0e-0627.27Show/hide
Query:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ
        MP  T+  D MF P++++L+   + C Q +GV PRP W+TT Y                                         G+H LD+   N  DP 
Subjt:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ

Query:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYY
         ++  R  EV  +K W+R +Y
Subjt:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYY

Q7TMR0 Lysosomal Pro-X carboxypeptidase7.2e-0827.2Show/hide
Query:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ
        MP  T+  D MF P+ +DL  + N C   +GV PRPHW+TT Y                                         G+H LD+   N  DP 
Subjt:  MPIGTDN-DTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY-----------------------------------------GSHCLDILRANETDPQ

Query:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLK
         ++  R  EV  +K+W+  +Y++++
Subjt:  WLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24280.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein2.6e-0848.84Show/hide
Query:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYYG
        MP+   N +M PPY  D  +F   C   YGV PRPHW+TT +G
Subjt:  MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYYG

AT5G22860.1 Serine carboxypeptidase S28 family protein2.3e-1733.59Show/hide
Query:  MPIGTD-NDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRAN
        MP+G D  DTMFP   F++ S+I+ C   +GV+PRPHW+TTY+                                              GSHCLDI   +
Subjt:  MPIGTD-NDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRAN

Query:  ETDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKE
        + DP+WLV QRE E+ +I  W+  Y  DL++
Subjt:  ETDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKE

AT5G22860.2 Serine carboxypeptidase S28 family protein3.6e-1054.55Show/hide
Query:  MPIGTD-NDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYYG
        MP+G D  DTMFP   F++ S+I+ C   +GV+PRPHW+TTY+G
Subjt:  MPIGTD-NDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYYG

AT5G65760.1 Serine carboxypeptidase S28 family protein6.7e-0927.07Show/hide
Query:  MPIGTDND-TMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRAN
        MP+ ++ + +MFP Y F+  S+   C   + V+PRP WVTT +                                              G+H LD+  + 
Subjt:  MPIGTDND-TMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYY----------------------------------------------GSHCLDILRAN

Query:  ETDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESK
          DP+WLV QRE E+ +I+ W+  Y  + KE+K
Subjt:  ETDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAATAGGCACAGACAATGATACTATGTTTCCACCATACACTTTTGACCTTAGAAGCTTCATAAATCACTGCAATCAGTTATACGGCGTCTCTCCCAGGCCTCACTG
GGTCACCACCTATTATGGGTCCCATTGTTTGGACATTTTACGGGCAAATGAAACCGATCCACAGTGGTTAGTGAAACAAAGAGAAACAGAAGTTAGCATCATTAAAGAAT
GGATGAGGAAGTACTATGCTGATCTTAAGGAGTCTAAACAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCAATAGGCACAGACAATGATACTATGTTTCCACCATACACTTTTGACCTTAGAAGCTTCATAAATCACTGCAATCAGTTATACGGCGTCTCTCCCAGGCCTCACTG
GGTCACCACCTATTATGGGTCCCATTGTTTGGACATTTTACGGGCAAATGAAACCGATCCACAGTGGTTAGTGAAACAAAGAGAAACAGAAGTTAGCATCATTAAAGAAT
GGATGAGGAAGTACTATGCTGATCTTAAGGAGTCTAAACAATAGCTAAAAAGAACACGAAAAGGGTGATGAAGGGGCACCCTACTTTGAACATAAATTTATGAACTTGTA
TTGAATCCATCAAAGAATGTGGTGAAAAGCCCTTTTCAGAGTTATGAAAGACTCTTAATAAATGGTGGTGGTGCCCTTTCTCTTCTTCCCTACTTGGAACAACATAAGAA
AATGATTGTGTAGAAGATAGTGTTGAAAGTGTCCTTTACTTGCCACTTGAAGAAACATGACCACAAGCAAGTCAACTATTCCACTATTTTTAATGGGTGTTTCTTGTTGG
AGGATGACTCATGAAACCAAATCAATTGATTATCGGTATCTGAATGTTTAGGTTTGTGTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPIGTDNDTMFPPYTFDLRSFINHCNQLYGVSPRPHWVTTYYGSHCLDILRANETDPQWLVKQRETEVSIIKEWMRKYYADLKESKQ