| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_022944676.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X1 [Cucurbita moschata] | 1.7e-269 | 100 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Subjt: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Subjt: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Query: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Subjt: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Query: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
Subjt: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
|
|
| XP_022944679.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X2 [Cucurbita moschata] | 9.4e-268 | 100 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Subjt: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Subjt: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Query: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Subjt: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Query: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
Subjt: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
|
|
| XP_022986138.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like [Cucurbita maxima] | 6.1e-267 | 99.16 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS-
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS-
Query: -PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
Subjt: -PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
Query: NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
Subjt: NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
Query: NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNS NHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
Subjt: NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
Query: PPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
PP SSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
Subjt: PPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
|
|
| XP_023513357.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 5.0e-269 | 99.79 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Subjt: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Subjt: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Query: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNS NHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Subjt: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Query: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
Subjt: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
|
|
| XP_023513360.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.7e-267 | 99.79 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Subjt: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Subjt: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Query: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNS NHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Subjt: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Query: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
Subjt: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TS95 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 1.2e-257 | 92.71 | Show/hide |
Query: ILYIHFLDCLSIQI--RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRA
+++ H D S+ + RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYF+A+G+VVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRA
Subjt: ILYIHFLDCLSIQI--RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRA
Query: VPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKR
VPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKR
Subjt: VPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKR
Query: AVPKELSPGPSRSPLGGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLS
AVPKELSPGPSRSPLGGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPF SGYGMGVNF+IGLNPGYGG+SNF NNLNYGRGLS
Subjt: AVPKELSPGPSRSPLGGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLS
Query: PYYTGNSDRFGNIGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGID
PYYTGNSDRFGNIGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSAS GG IGGT FANSGV+WGSSGI SQGGGNNVFSNS N NYGG+D
Subjt: PYYTGNSDRFGNIGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGID
Query: SSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
SSYS+GAGGYGRNSGT LPPTSSFPTSTVGFDGPFADFY+A YGD TWRSSNFERD SGPFGYGLG+AASDVS+RSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
Subjt: SSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
|
|
| A0A5D3CKF6 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 4.3e-258 | 92.91 | Show/hide |
Query: ILYIHFLDCLSIQI--RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRA
+++ H D S+ + RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYF+A+G+VVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRA
Subjt: ILYIHFLDCLSIQI--RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRA
Query: VPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKR
VPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKR
Subjt: VPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKR
Query: AVPKELSPGPSRSPLGGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLS
AVPKELSPGPSRSPLGGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPF SGYGMGVNF+IGLNPGYGG+SNF NNLNYGRGLS
Subjt: AVPKELSPGPSRSPLGGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLS
Query: PYYTGNSDRFGNIGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGID
PYYTGNSDRFGNIGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSAS GG IGGT FANSGV+WGSSGI SQGGGNNVFSNS N NYGG+D
Subjt: PYYTGNSDRFGNIGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGID
Query: SSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
SSYS+GAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFY+A YGD TWRSSNFERD SGPFGYGLG+AASDVS+RSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
Subjt: SSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
|
|
| A0A6J1FV25 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X1 | 8.3e-270 | 100 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Subjt: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Subjt: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Query: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Subjt: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Query: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
Subjt: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
|
|
| A0A6J1FX47 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X2 | 4.6e-268 | 100 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Subjt: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Subjt: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Query: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Subjt: GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVLPP
Query: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
Subjt: TSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
|
|
| A0A6J1JFM3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like | 3.0e-267 | 99.16 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS-
MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS-
Query: -PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
Subjt: -PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
Query: NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
Subjt: NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
Query: NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNS NHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
Subjt: NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
Query: PPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
PP SSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
Subjt: PPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O94432 Uncharacterized RNA-binding protein C660.15 | 6.5e-46 | 44.2 | Show/hide |
Query: DSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPG
+ GK+F+GG++W+T +D L++YF FGEV++ +M+D TTGR RGFGF+ F +P + V+ ++H++DG++++ KRA+PR +Q
Subjt: DSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPG
Query: RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPK
+T K+FVGG+ TE EF+N+F+QFG + D +M D +T RPRGFGF+TY++E AVE + + + ++GK VEVKRA PK
Subjt: RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPK
|
|
| Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 7.4e-66 | 40.23 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
M +D GKLFVGGISW+TDED+L+E+F+ +GEV +A++M+D+ TGR RGFGF++F+DPSV DRV++EKH+ID R V+ KRA+ R +Q + GRT G++N S
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPG-----RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPL
G +T+KIFVGGL T+T+ EF+ YF+ +G +TDV +MYD T RPRGFGF+++DSE+AV+ VL KTFH+L+GK VEVKRA+PK+ +PG +
Subjt: GPG-----RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPL
Query: GGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGR--FSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLN-PGYGGSSNFTNNL-NYGRGLSPYYTGNSDRFG
GG G GY QGY + Y RMD S G + + SSGYG G + G N GYG +T + YG G + Y +
Subjt: GGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGR--FSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLN-PGYGGSSNFTNNL-NYGRGLSPYYTGNSDRFG
Query: NIGYESGNG---------------GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNS--------------ANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQG
GY S G GN + S A + +G G T S + S++ G+ + G +GG N GS G + G
Subjt: NIGYESGNG---------------GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNS--------------ANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQG
Query: GGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGR
G+ + + + YGG Y+ G G G+
Subjt: GGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGR
|
|
| Q96EP5 DAZ-associated protein 1 | 1.5e-45 | 38.62 | Show/hide |
Query: GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGP--
GKLFVGG+ W T ++ L+ YFS +GEVV+ VIMKD+TT + RGFGF+ F DP+ V+ + H +DGR ++ K PR Q RT GP
Subjt: GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGP--
Query: --GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
++ KIFVGG+ E+E + YF +FG +T+VV++YD RPRGFGFIT++ E++V++ + FH++ GK VEVKRA P++ P G +
Subjt: --GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYT--------QGY--------SSSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP
G V + NG+ QGY + IGGYG GR +P VS+ F P F GYG F G P
Subjt: GQSRVNSFLNGYT--------QGY--------SSSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP
|
|
| Q98SJ2 DAZ-associated protein 1 | 3.8e-46 | 40.28 | Show/hide |
Query: GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGR-TSGSINVSPGP-
GKLFVGG+ W T ++ L+ YFS +GEVV+ VIMKD+TT + RGFGF+ F DP+ V+ + H +DGR ++ K PR Q R G P
Subjt: GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGR-TSGSINVSPGP-
Query: -GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNYG
R+ KIFVGG+ E+E K YF++FG +T+VV++YD RPRGFGFIT++ E++V++ + FH++ GK VEVKRA P++ S + P G +G
Subjt: -GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNYG
Query: QSRVNSFLNGYT-------QGYS--------SSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP
+ S NG+T QGYS TIGGYG + GR P VS+ F P F GY F G P
Subjt: QSRVNSFLNGYT-------QGYS--------SSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP
|
|
| Q9C652 RNA-binding protein 1 | 2.9e-46 | 48.24 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRND-----------QNIV
M D KLFVGGI+ +T E+ LK+YFS +G V+EAV+ K++ TG+ RGFGF+ FA+ + +R+ H I G+ V+ ++A+ +++ + V
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRND-----------QNIV
Query: GRTSGSINVSPGPG---RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKE
+ +G + G RT+KIFVGGL+S TE EFK+YF++FG TDVVVM+D T RPRGFGF+TYDSE++VE V+ FHEL+ K VEVKRA+PKE
Subjt: GRTSGSINVSPGPG---RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G07810.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.5e-162 | 63.93 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
MQ+D+GKLF+GGISWDT+E+RLKEYFS+FGEV+EAVI+KDRTTGR RGFGF+VFADP+VA+ VI EKHNIDGR+VEAK+AVPR+DQN+V R+ S SI S
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
Query: P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
P GPGRTRKIFVGGL S+VTES+FK YF+QFGT TDVVVMYDHNT RPRGFGFITYDSEEAVEKVL+KTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG G
Subjt: P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
Query: YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
Y+YG +RVN+ LNGY QG++ + +GGYG+RMDGRFSPV +GRS F +SSGYGM VNF+ GL G+ G +N+ N++YGRG+SPYY GN++RFG +GYE
Subjt: YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
Query: SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSN-SANHNYGGI-DSSYSIGAGGY
GN GGNSSFFSS T+NLWG+ G NN ++NSN ++G +S G F NSGVNWG + GGGNN SN + YGG +S + +G GGY
Subjt: SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSN-SANHNYGGI-DSSYSIGAGGY
Query: -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
RN G P+SSF T+ G+D A+FY A Y D TWRS E + PF YG+G +SDVS+R SSPG++G +SVN+RQ NRG T
Subjt: -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
|
|
| AT3G07810.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.5e-162 | 64.11 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
MQ+D+GKLF+GGISWDT+E+RLKEYFS+FGEV+EAVI+KDRTTGR RGFGF+VFADP+VA+ VI EKHNIDGR+VEAK+AVPR+DQN+V R+ S SI S
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
Query: P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
P GPGRTRKIFVGGL S+VTES+FK YF+QFGT TDVVVMYDHNT RPRGFGFITYDSEEAVEKVL+KTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG G
Subjt: P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
Query: YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
Y+YG +RVN+ LNGY QG++ + +GGYG+RMDGRFSPV +GRS F +SSGYGM VNF+ GL G+ G +N+ N++YGRG+SPYY GN++RFG +GYE
Subjt: YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
Query: SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSN-SANHNYGGI-DSSYSIGAGGY
GN GGNSSFFSS T+NLWG+ G NN ++NSN ++G +S G F NSGVNWG + GGGNN SN + YGG +S + +G GGY
Subjt: SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSN-SANHNYGGI-DSSYSIGAGGY
Query: -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRG
RN G P+SSF T+ G+D A+FY A Y D TWRS E + PF YG+G +SDVS+R SSPG++G +SVN+RQ NRG
Subjt: -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRG
|
|
| AT4G26650.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.2e-104 | 48.02 | Show/hide |
Query: RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSI
+K + +D GKLF+GGISWDTDE+RL+EYF +G++VEAVIM+DRTTGR RGFGFIVFADPSVA+RVI +KH IDGR VEAK+AVPR+DQ ++ R + +
Subjt: RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSI
Query: N-VSP------GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SP
+ +SP G RT+KIFVGGL S++TE+EFKNYFDQFGTI DVVVMYDHNT RPRGFGFIT+DSEE+V+ VL KTFHELNGKMVEVKRAVPKEL S
Subjt: N-VSP------GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SP
Query: GPSRSPLGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLS
P+RSPL GY NYG +S NS+ N + GY+++ +G GRFSP+ SGR+ F S +G+G+N E+ LN + G N L Y R G
Subjt: GPSRSPLGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLS
Query: PYYTGNSDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGI
+ + + +R+ + IGY G+ S ++ + ++LWG N ++S+ +LG SVG G NWG S ++S N+ YG
Subjt: PYYTGNSDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGI
Query: DSSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQ
SY G+G G SF +T GFDG + Y S Y D TW +SSN +S +G+G+ N SD S+ +S G+ G ++V RQ
Subjt: DSSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQ
Query: SNRG
++RG
Subjt: SNRG
|
|
| AT4G26650.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.2e-104 | 48.02 | Show/hide |
Query: RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSI
+K + +D GKLF+GGISWDTDE+RL+EYF +G++VEAVIM+DRTTGR RGFGFIVFADPSVA+RVI +KH IDGR VEAK+AVPR+DQ ++ R + +
Subjt: RKRKMQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSI
Query: N-VSP------GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SP
+ +SP G RT+KIFVGGL S++TE+EFKNYFDQFGTI DVVVMYDHNT RPRGFGFIT+DSEE+V+ VL KTFHELNGKMVEVKRAVPKEL S
Subjt: N-VSP------GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SP
Query: GPSRSPLGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLS
P+RSPL GY NYG +S NS+ N + GY+++ +G GRFSP+ SGR+ F S +G+G+N E+ LN + G N L Y R G
Subjt: GPSRSPLGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLS
Query: PYYTGNSDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGI
+ + + +R+ + IGY G+ S ++ + ++LWG N ++S+ +LG SVG G NWG S ++S N+ YG
Subjt: PYYTGNSDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGI
Query: DSSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQ
SY G+G G SF +T GFDG + Y S Y D TW +SSN +S +G+G+ N SD S+ +S G+ G ++V RQ
Subjt: DSSYSIGAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQ
Query: SNRG
++RG
Subjt: SNRG
|
|
| AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.7e-97 | 46.33 | Show/hide |
Query: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
M+ +S KLF+GGISW+T EDRL++YF +FGEV+EAVIMKDR TGR RGFGF+VFADP+VA+RV+ KH IDG++VEAK+AVPR+D + +++ S+ SP
Subjt: MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Query: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
GP ++KIFVGGLAS+VTE+EFK YF QFG ITDVVVMYDH T RPRGFGFI+YDSEEAV+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+++ R+ + ++
Subjt: GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Query: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
G SR++S LN YTQG+S S I GYGV+ + R+SP R F+PF GYG+ +NFE YG S+ +GR SP Y + RFG+ ESG
Subjt: GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
Query: --GNSSFFSSATQN-LWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTV
GN S ++A +N LWG+GGL SN+ + +S G G ++ + G NWG+ S G+++ + GGY +SG+
Subjt: --GNSSFFSSATQN-LWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSANHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTV
Query: LPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
+ S Y D W S + + GLG D SR G+I RQ N G
Subjt: LPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
|
|
