; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh20G006830 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh20G006830
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr20:3358201..3363089
RNA-Seq ExpressionCmoCh20G006830
SyntenyCmoCh20G006830
Gene Ontology termsGO:0010228 - vegetative to reproductive phase transition of meristem (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6570949.1 Protein NOI4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.1e-16994.57Show/hide
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KAG7010788.1 hypothetical protein SDJN02_27584 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-19599.12Show/hide
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XP_022943893.1 uncharacterized protein LOC111448482 [Cucurbita moschata]6.4e-198100Show/hide
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XP_022985722.1 uncharacterized protein LOC111483692 [Cucurbita maxima]7.5e-19197.07Show/hide
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XP_023511914.1 uncharacterized protein LOC111776784 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-19598.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA76 Uncharacterized protein1.1e-15882.22Show/hide
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A0A1S3CKU4 uncharacterized protein LOC1035021036.9e-15881.38Show/hide
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           GGGNGGEGRDWTTSILLFVLWAGLMFYVF LAPNQTPSTDLYFLKKLLNLK+DDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPL+YSMLLLPSGRSSNSNVPVWPFL
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A0A6J1CIN4 uncharacterized protein LOC1110113189.7e-15279.01Show/hide
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        MI N NLISCN  SPS P R  KLGI H+ QT+    QIIPFK+   V P  N RRDSS  ++ LLQK R+      AGDP GEK+T VE+ER    GGG
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        NGGEGRDWTTSILLFV WA LM+YVF LAPNQTPSTDLYFLKKLL LK+DDGFKMNEVLVSLWY+MGLWPL+Y MLLLPSGRSSNSNVPVWPFL LS FL
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        Y+QGSWLLPFSL+P LGPALYLVLRP PTTTPVP++ A SEPK
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A0A6J1FXH1 uncharacterized protein LOC1114484823.1e-198100Show/hide
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A0A6J1J5P7 uncharacterized protein LOC1114836923.6e-19197.07Show/hide
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        QGSWLLP SLVPFLGPALYLVLRPMPTTTPVPLD AASEPK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04360.1 unknown protein8.5e-10053.33Show/hide
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        M+ +I+LISCN         FS+L  L K  TR PQ +    S+S+   + +R  SS  ++ L  K+            ++ +P   + T ++       
Subjt:  MIPNINLISCNSFSPSPPSRFSKLGILHKTQTRNPQIIPFKYSTSVCPRINTRRDSSYRKVGLLQKWRSASG-----TQNAGDPVGEKATPVESERGGSS

Query:  GGGNGGEGRDWTTSILLFVLWAGLMFYVFILAPNQTPSTDLYFLKKLLNLKNDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLIYSMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLGLS
              EGRDW++SILLF LW  L++Y F LAP+QTP+ DLYFLKKLLNLK DDGF+MN++LV LWYIMGLWPL+Y+MLLLP+G    S  P WPF+ LS
Subjt:  GGGNGGEGRDWTTSILLFVLWAGLMFYVFILAPNQTPSTDLYFLKKLLNLKNDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLIYSMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLGLS

Query:  FFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDELERWPLNFLESKFTAGITFAAGLGLLFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHATSIDFMLLSSFAPFWVYNDMSA
        FF G Y LLPYF LW PP PPV E EL +WPLN LESK TAG+T  AGLG++ Y+ +     W EFYQYFRES+FIH TS+DF LLS+FAPFWVYNDM+ 
Subjt:  FFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDELERWPLNFLESKFTAGITFAAGLGLLFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHATSIDFMLLSSFAPFWVYNDMSA

Query:  RKWYDQGSWLLPFSLVPFLGPALYLVLRPMPTTTPVPLDRAASEP
        RKW+D+GSWLLP S++PFLGP+LYL+LRP  + T  P D A+S+P
Subjt:  RKWYDQGSWLLPFSLVPFLGPALYLVLRPMPTTTPVPLDRAASEP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATACCCAATATCAATCTTATCTCCTGCAACTCTTTCTCACCGTCTCCTCCTTCAAGATTTTCAAAGCTTGGAATTCTCCATAAAACCCAAACTCGAAACCCCCAAAT
CATCCCCTTCAAGTATTCGACATCGGTCTGCCCCCGCATCAACACTCGTCGAGATTCAAGCTACAGAAAAGTGGGTCTGCTCCAAAAATGGCGGAGTGCATCGGGAACTC
AGAATGCGGGTGACCCAGTTGGGGAAAAAGCGACGCCGGTGGAAAGTGAGCGCGGCGGTAGCAGCGGCGGCGGGAATGGTGGGGAGGGAAGAGACTGGACGACTTCGATT
TTACTGTTTGTATTGTGGGCTGGTCTTATGTTTTATGTGTTCATTCTCGCTCCAAATCAGACTCCGTCAACGGACTTGTATTTCTTGAAGAAGCTTCTGAACTTGAAAAA
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GCAATGTTCCTGTCTGGCCTTTCCTAGGACTGTCTTTCTTTTTGGGTGCTTATGGTCTTCTTCCATATTTTGTACTTTGGAAGCCGCCGCCGCCCCCCGTTGAGGAAGAT
GAGCTCGAGAGATGGCCTTTGAATTTTCTCGAGTCGAAATTTACTGCTGGGATAACATTTGCTGCAGGACTAGGCTTATTATTCTATGCTGGATTAGCTGGTGAGAGTGC
GTGGAAGGAATTCTATCAGTACTTCAGAGAAAGCAGATTTATCCATGCTACGAGCATTGATTTCATGCTGTTATCTTCATTTGCTCCATTTTGGGTTTACAATGACATGT
CTGCTCGAAAATGGTATGACCAAGGTTCTTGGCTTCTTCCATTTTCGTTGGTGCCGTTCTTGGGTCCTGCCTTGTATCTCGTCCTACGACCAATGCCAACGACGACTCCC
GTTCCACTCGACCGTGCTGCTTCTGAACCGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGAATGTGTGGTTCGACACTTGTTTTTCTATAATCAAGTTCAAGTCGGCCATGAATTGGTGACGGAAAAAGCTTCGGATTCTTATGTTTCTTCATCCGCTCCCGCCACCG
TTCTAAAACCCACAAAACTTGTCGCCAATTCCTAATCAAAATCCAAATCCAAATTCAAACATGATACCCAATATCAATCTTATCTCCTGCAACTCTTTCTCACCGTCTCC
TCCTTCAAGATTTTCAAAGCTTGGAATTCTCCATAAAACCCAAACTCGAAACCCCCAAATCATCCCCTTCAAGTATTCGACATCGGTCTGCCCCCGCATCAACACTCGTC
GAGATTCAAGCTACAGAAAAGTGGGTCTGCTCCAAAAATGGCGGAGTGCATCGGGAACTCAGAATGCGGGTGACCCAGTTGGGGAAAAAGCGACGCCGGTGGAAAGTGAG
CGCGGCGGTAGCAGCGGCGGCGGGAATGGTGGGGAGGGAAGAGACTGGACGACTTCGATTTTACTGTTTGTATTGTGGGCTGGTCTTATGTTTTATGTGTTCATTCTCGC
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