; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh20G008980 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh20G008980
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1645)
Genome locationCmo_Chr20:4555109..4556415
RNA-Seq ExpressionCmoCh20G008980
SyntenyCmoCh20G008980
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012442 - Protein of unknown function DUF1645, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571155.1 hypothetical protein SDJN03_30070, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.7e-18398.53Show/hide
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KAG7010965.1 hypothetical protein SDJN02_27763, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.0e-18197.93Show/hide
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XP_022944215.1 uncharacterized protein LOC111448731 [Cucurbita moschata]7.2e-186100Show/hide
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XP_022986568.1 uncharacterized protein LOC111484268 [Cucurbita maxima]4.8e-17494.96Show/hide
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XP_023513132.1 uncharacterized protein LOC111777661 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-18097.63Show/hide
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        SADELF GGKIRPLKPPPGF+SNMSSPRSPHNSRIS RKTKNSS+MNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTEEISYISSNF RKPTRSVS
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        PYRISSRTPIHGDGD CT AGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRDLLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMEND+KISSFRSADSVGPRRHFTAANR
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LII3 Uncharacterized protein1.3e-12472.24Show/hide
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        MEV V   PAG D+FNFGSPCSSHYLSAPSTPFSSLSAPTSPSSL  NFFR  HD DVPIGSPSAVPF WEEKPGIPKSP+C+A   +  FEF  SR S 
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         +K SLSADELF  GKI+PLKPPPGF+SN+SSP+SPHN R+S RKTK N    NINDDPFEAAL+KET   R NYEL D  + N   RGRT++I+YISSN
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        FARK TRS+SP+R+SS + +H D        KSKS SFLSAISFSK NRKWRLRDLLFRS SEGRATEKAD LRSTYVVMSE++++DMKISSFRS DS G
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         R  FTAANR VSEE  KK       SFLGRCLRFNRSGMQEISR IGSLTRG
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A0A1S3CA74 uncharacterized protein LOC1034984036.5e-12472.08Show/hide
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        V V V P G D+FNFGSPCSSHYLSAPSTPFSSLSAPTSP+SL  NFFR  +D DVPIGSPSAVPF WEEKPGIPKSP NC++  + DFEF  SR S  +
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        K S+SADELF  GKI+PLKPPPGF+SNMSSPRSPHN R+S RK+K N    NINDDPFEAAL+KET  HR NYEL D    N   RGRT++ISYI SNF+
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        RK TRS+SP+R+SS + +HGD     GA KSKS SFLSAISFSK NRKWRLRDLLFRS SEGRATEKADKLRSTYVVMSE++++D+KISSFRS DS GPR
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          +TAANR VSEE  KK        FLGRCLRFNRSG+QEISR IGSLTRG
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A0A6J1D4I9 uncharacterized protein LOC111017234 isoform X24.5e-9361.76Show/hide
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        MEV + + PAGD FNF +P SSHY +APSTP       +S+SAPTSPS +A NFF   D D+PI SPS VPFRWEE+PGIPKSP CS E DFEFDFS QS
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           KASLSADELFDGGKI+PLKPPPGF+S++SSPRSP        K    ++ +I++DPFEAAL+KET +H +NYEL D   +NRGR + +ISYISSNFA
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        RK TRS+SP+RIS +T    DG     A K KS    SAISF KANR KWRLRD LFRS SEGRATEK     + YVVMS+++++D+K SSFRSAD  G 
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           HF   NR VSEE  KK        FLGRCLRFNRSG+QE+SR IGSLTRG
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A0A6J1FYJ1 uncharacterized protein LOC1114487313.5e-186100Show/hide
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        TVSEEFMKKRSFLGRCLRFNRSGMQEISRDIGSLTRG
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A0A6J1JGW7 uncharacterized protein LOC1114842682.3e-17494.96Show/hide
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        MEVAVGVSPAGDLFNFGSPCSSHYLSAPSTPFSSLSAPTSPSS AVNFFRHDDDVPIGSPSAVPFRWEEKPGIPKSPNCSAEQDFEFDFSRQSL  KASL
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        SADELFDGGKIRPLKPPPGFKSN+SSPRSPHNSRIS RKTKNSS+MNINDDPFEAALMKETL+HRTN ELADKQSKNRGRTEEISYISS+FARKPTRS+S
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        PYRISSRTPIHGD D  TGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRDLLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMEND+KISSFRSADSV PRRHFTAANR
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Query:  TVSEEFMKKRSFLGRCLRFNRSGMQEISRDIGSLTRG
        TVSEE MKK+SFLGRCLRFNRSGMQEISRDIGSLTRG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G15760.1 Protein of unknown function (DUF1645)7.3e-2733.78Show/hide
Query:  MEVAVGVSPAGDLFNFGSPCSSHYLSAPSTPF----SSLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPSAVPFRWEEKPGIPKSPNC-SAEQDFEFDFSRQSLC
        ME+ V  + A +L NF S  SS Y++APS+P     +  SAPTSPS                + S +PF W+++P  PK  +    E DFEF+FS Q   
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Query:  TKASLSADELFDGGKIRPLKPPPGFKSNMSSPRSPHNSRISQRKTKNSSEMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTEEISYISSNFARKP
        T  S +ADELFDGGKIRPL+ P      +SSPRS               E+  +DD                        K+RGR       SS + RK 
Subjt:  TKASLSADELFDGGKIRPLKPPPGFKSNMSSPRSPHNSRISQRKTKNSSEMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTEEISYISSNFARKP

Query:  TRSVSPYRIS-----SRTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISF-SKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMENDMKISSFRSADS
        +RS+SP R+S         +       +     KS  FLSAI F  +A +KW+L+D LLFRS S+GR     + L + Y +++++   +++ SS RS +S
Subjt:  TRSVSPYRIS-----SRTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISF-SKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMENDMKISSFRSADS

Query:  V----------------GPRRHFTAANRTVSEEFMKKRSFLG------RCLRFNRSGMQEISRDIGSLTR
                             H+T  NR VSEE +K+++FL        CL FN   + EI+R +GSL+R
Subjt:  V----------------GPRRHFTAANRTVSEEFMKKRSFLG------RCLRFNRSGMQEISRDIGSLTR

AT2G26530.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.2e-2132.61Show/hide
Query:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSPNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP
        L+APS+P       LSAPTSP      F+R  ++    + S    VPF WEE PG P+      + D +F F         SL A+ELFDGGKI+PLKPP
Subjt:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSPNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP

Query:  P------GFKSNMSSPRSP-----HNSRISQRKTKNSSEMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTEEISYISSNFARKPTRSVSPYRISS
        P        +  + SPRSP     H   I  RK  +  +   N DPFE A+ K              + + RGR +       N  R+  RS+SP+R+S+
Subjt:  P------GFKSNMSSPRSP-----HNSRISQRKTKNSSEMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTEEISYISSNFARKPTRSVSPYRISS

Query:  -------------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMENDMKISSFRSADSVGPR
                     +  +     G   +  S S S   +   S +++KWRL+D LLFRS SEGRA    D +++   +   R + D K SS R   S    
Subjt:  -------------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMENDMKISSFRSADSVGPR

Query:  RH-FTAANRTVSEEFMKKRSFL
         H F   ++    + +KK++FL
Subjt:  RH-FTAANRTVSEEFMKKRSFL

AT2G26530.2 Protein of unknown function (DUF1645)3.6e-1830.28Show/hide
Query:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSPNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP
        L+APS+P       LSAPTSP      F+R  ++    + S    VPF WEE PG P+      + D +F F         SL A+ELFDGGKI+PLKPP
Subjt:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSPNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP

Query:  P------GFKSNMSSPRSPHNSRISQRKTKNSSEMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTEEISYISSNFARKPTRSVSPYRISS-----
        P        +  + SPRSP                            +  + H  N      + + RGR +       N  R+  RS+SP+R+S+     
Subjt:  P------GFKSNMSSPRSPHNSRISQRKTKNSSEMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTEEISYISSNFARKPTRSVSPYRISS-----

Query:  --------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMENDMKISSFRSADSVGPRRH-FT
                +  +     G   +  S S S   +   S +++KWRL+D LLFRS SEGRA    D +++   +   R + D K SS R   S     H F 
Subjt:  --------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATEKADKLRSTYVVMSERMENDMKISSFRSADSVGPRRH-FT

Query:  AANRTVSEEFMKKRSFL
          ++    + +KK++FL
Subjt:  AANRTVSEEFMKKRSFL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCCCACCAGCCCCTCCTCTCTCGCCGTCAACTTCTTCCGCCACGACGACGACGTTCCGATTGGCTCTCCCTCCGCCGTCCCCTTCCGCTGGGAGGAGAAACCCGGCATTC
CCAAATCCCCCAATTGCTCCGCCGAGCAGGATTTTGAATTTGATTTCAGCCGCCAGTCGCTCTGCACTAAAGCTTCTCTCTCCGCCGATGAGCTCTTCGACGGCGGTAAA
ATCCGGCCGCTCAAACCCCCTCCCGGATTCAAGTCGAACATGTCGTCGCCGAGATCGCCGCACAATTCGAGGATTTCCCAACGTAAAACGAAGAACAGCTCCGAAATGAA
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GGAGAAAGCTGATAAGCTGAGGTCTACGTACGTTGTAATGTCGGAAAGAATGGAGAACGACATGAAAATTTCGAGTTTCCGATCAGCCGACAGCGTCGGTCCAAGGAGGC
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CCAGCCCCTCCTCTCTCGCCGTCAACTTCTTCCGCCACGACGACGACGTTCCGATTGGCTCTCCCTCCGCCGTCCCCTTCCGCTGGGAGGAGAAACCCGGCATTCCCAAA
TCCCCCAATTGCTCCGCCGAGCAGGATTTTGAATTTGATTTCAGCCGCCAGTCGCTCTGCACTAAAGCTTCTCTCTCCGCCGATGAGCTCTTCGACGGCGGTAAAATCCG
GCCGCTCAAACCCCCTCCCGGATTCAAGTCGAACATGTCGTCGCCGAGATCGCCGCACAATTCGAGGATTTCCCAACGTAAAACGAAGAACAGCTCCGAAATGAACATCA
ACGACGACCCATTTGAAGCGGCGCTAATGAAAGAGACTCTTAACCATCGAACCAATTATGAGCTCGCTGATAAACAGAGCAAAAACAGAGGAAGAACAGAGGAAATCTCA
TACATTTCCTCTAATTTTGCTCGCAAACCCACTCGATCCGTTTCCCCTTACAGAATCTCTTCTCGAACTCCAATTCACGGCGACGGCGACGGCTGCACGGGCGCCGGAAA
ATCAAAGTCGTTGTCGTTCTTGTCGGCGATTTCGTTCTCTAAGGCCAATAGAAAATGGAGGCTCAGAGACTTATTGTTTCGTAGCACTTCCGAAGGCCGAGCGACGGAGA
AAGCTGATAAGCTGAGGTCTACGTACGTTGTAATGTCGGAAAGAATGGAGAACGACATGAAAATTTCGAGTTTCCGATCAGCCGACAGCGTCGGTCCAAGGAGGCATTTC
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GTCGTTGACACGTGGATGAACCGGCAGATTTTTAATTTTGATTTTTTTTTGTTTGGATTGATAAATGTAAGAGAATGTTTTTTTTTTCAGTATTTTATATATAAATAAAT
AATAAAGAATTTAAGTTTTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IGSLTRG