| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6600088.1 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.44e-152 | 78.34 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS--PRGRSRSPMDEAEDFNGGGS
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS PRGRSRSRSPRGRSRSRS PRGRSRSPMDEAEDFNGGGS
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS--PRGRSRSPMDEAEDFNGGGS
Query: RNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGG
RNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGG
Subjt: RNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGG
|
|
| XP_022942535.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 8.65e-151 | 76.99 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS PRGRSRSRS RSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Query: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
Subjt: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| XP_022992885.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita maxima] | 8.76e-154 | 76.79 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRS----------RSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEA
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRSRSRS R RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEA
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRS----------RSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEA
Query: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| XP_022993050.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 [Cucurbita maxima] | 1.08e-153 | 78.17 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRSRSRSRSRS PRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Query: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| XP_023541883.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 6.47e-163 | 81.12 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Query: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
Subjt: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1FWH1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 | 4.19e-151 | 76.99 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS PRGRSRSRS RSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Query: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
Subjt: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1GWY2 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 | 1.00e-138 | 72.36 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDV GSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRL
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKR+RSLERS+KRSRSPRG R
Subjt: ------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRL
Query: SPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRS-RSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSP--------------MD
SPKRHSLSPPPSKA+KRS TPD RSPEEAR S SPGNRDSPRG SRS R RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSP MD
Subjt: SPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRS-RSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSP--------------MD
Query: EAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
E EDFNGGGS+NYR+EENGYSRSPSPLPREE SPVNDED NGSPRG SESA
Subjt: EAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1JVG4 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 | 6.75e-141 | 72.57 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRSR RSRS RSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Query: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1JXF9 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 | 5.21e-154 | 78.17 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRSRSRSRSRS PRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Query: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1JYX0 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 | 4.24e-154 | 76.79 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGA------------------
Query: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
+CQ P L RGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: ---------------------------------------SCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRS----------RSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEA
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRSRSRS R RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEA
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRS----------RSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEA
Query: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q10021 Probable splicing factor, arginine/serine-rich 5 | 8.0e-16 | 40.47 | Show/hide |
Query: RLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS--RIIVEIAKG---ASCQYFPSSLLRGS-----YSRSPS
RLY+G++ R RD++ YG++ ++ MK +AFV+F D RDA+DA + L+G+ + GS R++VE+A+G + ++ S R S SR+P
Subjt: RLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS--RIIVEIAKG---ASCQYFPSSLLRGS-----YSRSPS
Query: PRRGRSRSRS---YSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSR
RR RSR R SR RS SRSRSPV+ R RSE RS SP+ S SP P+K R+ RS SP R RS SR RS
Subjt: PRRGRSRSRS---YSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSR
Query: SRSRSPRGRSRSRSP
SR S R SRS SP
Subjt: SRSRSPRGRSRSRSP
|
|
| Q16629 Serine/arginine-rich splicing factor 7 | 3.1e-15 | 42.19 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG-----------ASCQ
M RY RYGG T++YVG L + +L+ FS YG +R V + R+ +AFVEF DPRDA+DA L+G+ + GSR+ VE++ G A
Subjt: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG-----------ASCQ
Query: YFPSSLL-----RGSYS----RSPSPRRGRSRSRSY--SRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEE
+ P+ +G Y+ R RR RSRSRS+ SRGR YSRSRS + RS S +RSRS SL S +L+RS + ++
Subjt: YFPSSLL-----RGSYS----RSPSPRRGRSRSRSY--SRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEE
Query: ARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSP-RGRSRSRSPRGRSRSP
+R SP RSRSRSRS SR RS R +SRS SP R RS S SPR RS SP
Subjt: ARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSP-RGRSRSRSPRGRSRSP
|
|
| Q3T106 Serine/arginine-rich splicing factor 7 | 8.0e-16 | 42.19 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG-----------ASCQ
M RY RYGG T++YVG L + +L+ FS YG +R V + R+ +AFVEF DPRDA+DA L+G+ + GSR+ VE++ G A
Subjt: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG-----------ASCQ
Query: YFPSSLL-----RGSYS----RSPSPRRGRSRSRSY--SRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEE
+ P+ +G Y+ R RR RSRSRS+ SRGR YSRSRS + RS S +RSRS SL S +L+RS + ++
Subjt: YFPSSLL-----RGSYS----RSPSPRRGRSRSRSY--SRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEE
Query: ARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSP-RGRSRSRSPRGRSRSP
G+R R RSRSRSRS SR RS R +SRS SP R RS S SPR RS SP
Subjt: ARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSP-RGRSRSRSPRGRSRSP
|
|
| Q8VYA5 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z33 | 5.2e-31 | 44.66 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSY---S
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD GSRI VE ++GA RGS S
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSY---S
Query: RSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS
R P P G R + ++R + R +R R + SPK+ S S++ RS +P RRSPS R R RS SRSRS
Subjt: RSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS
Query: RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAE------DFNGGGSRNYRKE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVNDE-DAN
R R RSRSP+ S SPR R RSP+ + E D + S +KE +NG + SP+ +E+RSPV+D+ + N
Subjt: RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAE------DFNGGGSRNYRKE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVNDE-DAN
Query: GSPRGGSES
+ GSES
Subjt: GSPRGGSES
|
|
| Q9FYB7 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32 | 1.5e-33 | 46.89 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSP
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD GSRI VE ++GA P R + SR P
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSP
Query: SPRRGR--------SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSR
P GR +R + G ++ +R +ER+ K S SP+ R +S SP S++ +R RRSPS +R RGRS
Subjt: SPRRGR--------SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSR
Query: SRSRS--------RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGR--SRSPMDEAEDFNG-----GGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPR-
SRSRS RSRSP+ RS SP+GR +S SP + SP D++G G RN G SP L ++RSP++DE P
Subjt: SRSRS--------RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGR--SRSPMDEAEDFNG-----GGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPR-
Query: GGSES
GSES
Subjt: GGSES
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G37340.1 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 33 | 3.7e-32 | 44.66 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSY---S
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD GSRI VE ++GA RGS S
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSY---S
Query: RSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS
R P P G R + ++R + R +R R + SPK+ S S++ RS +P RRSPS R R RS SRSRS
Subjt: RSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS
Query: RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAE------DFNGGGSRNYRKE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVNDE-DAN
R R RSRSP+ S SPR R RSP+ + E D + S +KE +NG + SP+ +E+RSPV+D+ + N
Subjt: RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAE------DFNGGGSRNYRKE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVNDE-DAN
Query: GSPRGGSES
+ GSES
Subjt: GSPRGGSES
|
|
| AT2G37340.3 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 33 | 8.8e-10 | 37.69 | Show/hide |
Query: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSY---SRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRS
MKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD GSRI VE ++GA RGS SR P P G R + ++R + R +R
Subjt: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSY---SRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRS
Query: RSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAE----
R + SPK+ S S++ RS +P RRSPS R R RS SRSRS R R RSRSP+ S SPR R RSP+ + E
Subjt: RSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPMDEAE----
Query: --DFNGGGSRNYRKE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVNDE-DANGSPRGGSES
D + S +KE +NG + SP+ +E+RSPV+D+ + N + GSES
Subjt: --DFNGGGSRNYRKE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVNDE-DANGSPRGGSES
|
|
| AT3G53500.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain | 3.2e-12 | 40.15 | Show/hide |
Query: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGR--------SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLER
MKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD GSRI VE ++GA P R + SR P P GR +R + G ++ +R +ER
Subjt: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRRGR--------SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLER
Query: SEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS--------RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGR
+ K S SP+ R +S SP S++ +R RRSPS +R RGRS SRSRS RSRSP+ RS SP+GR +S SP +
Subjt: SEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS--------RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGR
Query: --SRSPMDEAEDFNG-----GGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPR-GGSES
SP D++G G RN G SP L ++RSP++DE P GSES
Subjt: --SRSPMDEAEDFNG-----GGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPR-GGSES
|
|
| AT3G53500.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain | 1.0e-34 | 46.89 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSP
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD GSRI VE ++GA P R + SR P
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSP
Query: SPRRGR--------SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSR
P GR +R + G ++ +R +ER+ K S SP+ R +S SP S++ +R RRSPS +R RGRS
Subjt: SPRRGR--------SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSR
Query: SRSRS--------RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGR--SRSPMDEAEDFNG-----GGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPR-
SRSRS RSRSP+ RS SP+GR +S SP + SP D++G G RN G SP L ++RSP++DE P
Subjt: SRSRS--------RSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGR--SRSPMDEAEDFNG-----GGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPR-
Query: GGSES
GSES
Subjt: GGSES
|
|
| AT4G02430.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.0e-10 | 35.29 | Show/hide |
Query: LYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMK-----RDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRR---
+YVG L R R+++DLFS+YG V +D+K YAFVEF D RDADDA Y +G D G + VE+A G S RGSYS R
Subjt: LYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMK-----RDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGASCQYFPSSLLRGSYSRSPSPRR---
Query: -GRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRL------------------------------SPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPE
G R R SR Y S + S + + R +GG + + R++ S + + D RSP
Subjt: -GRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRL------------------------------SPKRHSLSPPPSKALKRSPTPDVRSPE
Query: EARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRS
R +R RSRSRSRSRS+SRSP+ +S RSP +S SRSPR RSRS
Subjt: EARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRS
|
|
