; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cp4.1LG20g04410 (gene) of Cucurbita pepo (MU-CU-16) v4.1 genome

Gene IDCp4.1LG20g04410
OrganismCucurbita pepo var. pepo MU-CU-16 (Cucurbita pepo (MU-CU-16) v4.1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationCp4.1LG20:2519217..2520794
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG20g04410
SyntenyCp4.1LG20g04410
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583990.1 VQ motif-containing protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.77e-16999.6Show/hide
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XP_023520333.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.95e-169100Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]1.47e-14388.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B685 VQ motif-containing protein 4 isoform X13.78e-13785.48Show/hide
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A0A1S3B6X5 VQ motif-containing protein 4 isoform X22.95e-13785.48Show/hide
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A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X23.05e-13785.48Show/hide
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A0A6J1EII3 VQ motif-containing protein 4-like2.22e-16898.79Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like5.82e-16797.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 132.5e-3246.67Show/hide
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        + L+P P    +    TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       +P   P +S       IPP+K++  K+Q S F+L ERRNS+ + 
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        L INP        THSG     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL 
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        LFPMT    P
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Q5M750 VQ motif-containing protein 44.8e-6057.44Show/hide
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        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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          IPP+K++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
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        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 336.2e-3143.19Show/hide
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        S+S + S   +M +     SS  +  Q + P  H  H           NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS         + A +P +N++  S   I
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Query:  PPVKSLPKRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD
        PP+K     + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF+
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Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        +S     S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.3e-1237.7Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPVKSLPKRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSP
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E       N AAA +   +V KT      ++ KR  S  KL+ERR  + + K+  V P             KP   +P
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Query:  SILDFPALALSPVTPLIPDPF--DRSGLANCSYLKN--GNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S       + S  T L+  P     S  +N S ++    +   + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFP+TSP
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 193.2e-3547.19Show/hide
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        SSSS+S     +    HH      ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S  P   PS   +     IPP+K+   ++ SG KLYE
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Query:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE
        RR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                    EE+ I +
Subjt:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE

Query:  KGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein3.4e-6157.44Show/hide
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        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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Query:  THIPPVKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL
          IPP+K++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
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Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein3.4e-6157.44Show/hide
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        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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          IPP+K++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
Subjt:  THIPPVKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL

Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein1.8e-3346.67Show/hide
Query:  QQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPVKSLP-KRQQSGFKLYERRNSL-NK
        + L+P P    +    TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       +P   P +S       IPP+K++  K+Q S F+L ERRNS+ + 
Subjt:  QQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPVKSLP-KRQQSGFKLYERRNSL-NK

Query:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLP
        L INP        THSG     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL 
Subjt:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLP

Query:  LFPMTSPRVP
        LFPMT    P
Subjt:  LFPMTSPRVP

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.2e-3647.19Show/hide
Query:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPVKSLPKRQQSGFKLYE
        SSSS+S     +    HH      ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S  P   PS   +     IPP+K+   ++ SG KLYE
Subjt:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPVKSLPKRQQSGFKLYE

Query:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE
        RR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                    EE+ I +
Subjt:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE

Query:  KGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  KGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein4.4e-3243.19Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI
        S+S + S   +M +     SS  +  Q + P  H  H           NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS         + A +P +N++  S   I
Subjt:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI

Query:  PPVKSLPKRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD
        PP+K     + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF+
Subjt:  PPVKSLPKRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD

Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        +S     S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATCCTCTTCAGTTTTACAAGAAAACCCATGCCCTTCTTCTTCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAAGTAGCCGCATGACTCACAGTACTACCAGTAGTAGCAGCACCAG
CTATGGACTCCAACAACTCATGCCTCCACCGCATCACTTGCACTCGCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTTAACCCTTACCCCACTACCTTTGTTCAAGCTGATA
CCTCTTCTTTCAAGCAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCTGTTAACCCTGCTGCTGCGCCTTCCAACTCTGATTCTGTGTCCAAA
ACGCACATTCCTCCCGTTAAATCTTTACCCAAAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCGGTGTTTCCCGT
TTTTGGTTCCACTACTCATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCTCCGAGTATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCTGTCACGCCGCTGATTC
CCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTACTTGAAGAATGGGAATGCCAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTAC
TTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGTGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTGCCAGACTATGATTTTGGCATTGGCAAAGC
AATTAGTGTGGTGCAGGTGAATGAGGAAAAAGGAAGGGTGGTGTGGGGGAGGGTTATGAAAAGCGGCCTCGACCCTGCTCTAACTTTCAACGATAGGAGTAAAAGCTGGG
CGTGGAATCTTGACCTTTTGTTACCTTTTGTGTTGTATCTTGTAAGCTTTTGTCATTGGATTAGAAAATTGATTCTGGAAGAAGATTTAGGTGAGATGGAAGTGAATCTG
GTCAACACTTTTAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAATCCTCTTCAGTTTTACAAGAAAACCCATGCCCTTCTTCTTCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAAGTAGCCGCATGACTCACAGTACTACCAGTAGTAGCAGCACCAG
CTATGGACTCCAACAACTCATGCCTCCACCGCATCACTTGCACTCGCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTTAACCCTTACCCCACTACCTTTGTTCAAGCTGATA
CCTCTTCTTTCAAGCAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCTGTTAACCCTGCTGCTGCGCCTTCCAACTCTGATTCTGTGTCCAAA
ACGCACATTCCTCCCGTTAAATCTTTACCCAAAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCGGTGTTTCCCGT
TTTTGGTTCCACTACTCATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCTCCGAGTATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCTGTCACGCCGCTGATTC
CCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTACTTGAAGAATGGGAATGCCAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTAC
TTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGTGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTGCCAGACTATGATTTTGGCATTGGCAAAGC
AATTAGTGTGGTGCAGGTGAATGAGGAAAAAGGAAGGGTGGTGTGGGGGAGGGTTATGAAAAGCGGCCTCGACCCTGCTCTAACTTTCAACGATAGGAGTAAAAGCTGGG
CGTGGAATCTTGACCTTTTGTTACCTTTTGTGTTGTATCTTGTAAGCTTTTGTCATTGGATTAGAAAATTGATTCTGGAAGAAGATTTAGGTGAGATGGAAGTGAATCTG
GTCAACACTTTTAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESSSVLQENPCPSSSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSK
THIPPVKSLPKRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFY
LHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPDYDFGIGKAISVVQVNEEKGRVVWGRVMKSGLDPALTFNDRSKSWAWNLDLLLPFVLYLVSFCHWIRKLILEEDLGEMEVNL
VNTFS