; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cp4.1LG20g04470 (gene) of Cucurbita pepo (MU-CU-16) v4.1 genome

Gene IDCp4.1LG20g04470
OrganismCucurbita pepo var. pepo MU-CU-16 (Cucurbita pepo (MU-CU-16) v4.1)
Descriptiondof zinc finger protein DOF1.4-like
Genome locationCp4.1LG20:2535449..2536345
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG20g04470
SyntenyCp4.1LG20g04470
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003851 - Zinc finger, Dof-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583986.1 Dof zinc finger protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.54e-20497.01Show/hide
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A0A0A0LV58 Dof-type domain-containing protein2.05e-12870.34Show/hide
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A0A1S3B763 dof zinc finger protein DOF1.4-like9.18e-12869.7Show/hide
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A0A6J1KHG1 dof zinc finger protein DOF1.4-like1.25e-20597.99Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80928 Dof zinc finger protein DOF2.41.9e-2354.55Show/hide
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Q9FM03 Dof zinc finger protein DOF5.65.0e-2437.07Show/hide
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Q9FZA4 Dof zinc finger protein DOF1.41.4e-3436.99Show/hide
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Q9M161 Dof zinc finger protein DOF4.11.8e-2648.51Show/hide
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Q9ZV33 Dof zinc finger protein DOF2.21.9e-2341.76Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28310.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein9.9e-3636.99Show/hide
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        S  +++   H Q+ Q +  Q  P L+CPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGG  RKNKR+KRPS+ TTTT +T +TT ++
Subjt:  SSGLVMDKQHDQKTQLKQHQQDP-LRCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKRPSSTTTTTTTTTTTTTTA

Query:  AVTSPAPDSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFA------HNPSSSTSISSLLASKFTNGV
        +  +P   S  SS    P +FY  +  ++   +   + P      S     +  + +G  S  L SG+S+L A      H  S   +I+    +  T   
Subjt:  AVTSPAPDSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFA------HNPSSSTSISSLLASKFTNGV

Query:  GFKSTDPNLFGNNLASPAFGHHHQQQVDHVMGSNGGDQLGL----------------NVKDVKLEDG-MKRLNWDDQQNQADEIATQSNDHNPLYGNWS-
         F  +   LFG++++S +    H     H   +NGGD LG                 N +D+K ++G + +++ +     +   +   +++N ++ N S 
Subjt:  GFKSTDPNLFGNNLASPAFGHHHQQQVDHVMGSNGGDQLGL----------------NVKDVKLEDG-MKRLNWDDQQNQADEIATQSNDHNPLYGNWS-

Query:  -SQTWHDP--ENLASSITS
         +  W DP   N+ SS+TS
Subjt:  -SQTWHDP--ENLASSITS

AT1G28310.2 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein9.9e-3636.99Show/hide
Query:  SSGLVMDKQHDQKTQLKQHQQDP-LRCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKRPSSTTTTTTTTTTTTTTA
        S  +++   H Q+ Q +  Q  P L+CPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGG  RKNKR+KRPS+ TTTT +T +TT ++
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Query:  AVTSPAPDSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFA------HNPSSSTSISSLLASKFTNGV
        +  +P   S  SS    P +FY  +  ++   +   + P      S     +  + +G  S  L SG+S+L A      H  S   +I+    +  T   
Subjt:  AVTSPAPDSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFA------HNPSSSTSISSLLASKFTNGV

Query:  GFKSTDPNLFGNNLASPAFGHHHQQQVDHVMGSNGGDQLGL----------------NVKDVKLEDG-MKRLNWDDQQNQADEIATQSNDHNPLYGNWS-
         F  +   LFG++++S +    H     H   +NGGD LG                 N +D+K ++G + +++ +     +   +   +++N ++ N S 
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Query:  -SQTWHDP--ENLASSITS
         +  W DP   N+ SS+TS
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AT2G28810.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein1.3e-2441.76Show/hide
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        PSS +G     Q  ++ +L ++ Q P   L+CPRCDS+NTKFCY+NNY+L+QPRHFCKAC+RYWTRGG LRNVPVGGGCR+NK+ K  +S +++++    
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Query:  TTTTAAVTSPAPDSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFAHNPS
        +T+    TSP   S     T+    F  +  +L        L  +GL   + N ++     NG  SSS L+        N S
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AT4G00940.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein1.3e-2748.51Show/hide
Query:  SSSSGLVMDKQHDQKTQLKQHQQDPLRCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKRPSSTTTTTTTTTTTTTT
        ++++ ++MD +    T +    Q+P  CPRC+SSNTKFCYYNNYSL+QPR+ CK+C+RYWT GG+LRNVPVGGG RKNK+L  P+S+T+++T        
Subjt:  SSSSGLVMDKQHDQKTQLKQHQQDPLRCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKRPSSTTTTTTTTTTTTTT

Query:  AAVTSPAPDSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFS
            +P    TSS+S+S P+  + +N+DL++ FS
Subjt:  AAVTSPAPDSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFS

AT5G62940.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein3.5e-2537.07Show/hide
Query:  DQKTQLKQHQQDPLRCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKRPSSTTTTTTTTTTTTTTAAVTSPAPDSTS
        D   +L+     P +CPRC+S++TKFCYYNNYSLSQPR+FCK C+RYWT+GGTLRN+PVGGGCRKN   K+PSS+ ++++T                   
Subjt:  DQKTQLKQHQQDPLRCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKRPSSTTTTTTTTTTTTTTAAVTSPAPDSTS

Query:  SSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFAHNPSSSTSISSLLASKFTNGVGFKSTDPNLFG---NNL
        SS     N+  A+ SDL           + L     N  H     + F    ++  YST    N     S    L S+    + F  +  +L G   +NL
Subjt:  SSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFAHNPSSSTSISSLLASKFTNGVGFKSTDPNLFG---NNL

Query:  ASPAFG----HHHQQQVDHVMGSNGGDQLGLN
             G    HHH    +H MG N G  +GLN
Subjt:  ASPAFG----HHHQQQVDHVMGSNGGDQLGLN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCTCTTCTTCCTCTGGATTAGTAATGGACAAACAACATGATCAGAAAACTCAACTCAAACAACACCAACAAGACCCTCTCCGGTGCCCTCGTTGTGACTCTTCAAA
CACCAAATTTTGTTACTACAACAACTACAGCTTGTCTCAGCCTCGCCACTTTTGCAAGGCTTGTAAGCGCTACTGGACCCGCGGTGGCACCTTGAGGAATGTCCCTGTCG
GTGGCGGCTGCCGGAAAAACAAGCGCCTCAAAAGACCTTCTTCTACGACGACGACAACAACTACGACGACGACTACTACTACTACTGCCGCCGTCACCTCCCCGGCCCCG
GATTCCACTTCCTCGTCTTCAACTTCTTGTCCCAATATGTTTTATGCCTCCAACTCCGATCTCAACGTTCCATTTTCCGGGTATGATTTAAATCCACTTGGGTTAGGGTT
TTGTTCTCCTAATATTGATCATAGGGACTTTAATCTTAATGGGTTCAATTCAAGTTCGCTCCTTTCGGGCTATTCTACCTTATTTGCTCATAACCCATCTTCTTCAACCT
CCATTTCTTCATTGCTTGCTTCCAAGTTCACCAATGGTGTTGGGTTCAAATCCACTGATCCGAATCTATTTGGTAATAACCTAGCTTCTCCAGCGTTTGGTCACCATCAT
CAACAACAAGTTGATCATGTGATGGGATCCAACGGTGGAGATCAATTAGGGCTGAATGTGAAAGATGTGAAATTGGAAGATGGGATGAAGAGGCTAAATTGGGATGATCA
GCAGAATCAAGCGGATGAAATTGCTACCCAATCTAATGATCATAATCCACTCTACGGTAATTGGAGCTCTCAAACATGGCACGATCCCGAAAATCTTGCTTCATCTATCA
CTTCTTCTCTCATCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCCTCTTCTTCCTCTGGATTAGTAATGGACAAACAACATGATCAGAAAACTCAACTCAAACAACACCAACAAGACCCTCTCCGGTGCCCTCGTTGTGACTCTTCAAA
CACCAAATTTTGTTACTACAACAACTACAGCTTGTCTCAGCCTCGCCACTTTTGCAAGGCTTGTAAGCGCTACTGGACCCGCGGTGGCACCTTGAGGAATGTCCCTGTCG
GTGGCGGCTGCCGGAAAAACAAGCGCCTCAAAAGACCTTCTTCTACGACGACGACAACAACTACGACGACGACTACTACTACTACTGCCGCCGTCACCTCCCCGGCCCCG
GATTCCACTTCCTCGTCTTCAACTTCTTGTCCCAATATGTTTTATGCCTCCAACTCCGATCTCAACGTTCCATTTTCCGGGTATGATTTAAATCCACTTGGGTTAGGGTT
TTGTTCTCCTAATATTGATCATAGGGACTTTAATCTTAATGGGTTCAATTCAAGTTCGCTCCTTTCGGGCTATTCTACCTTATTTGCTCATAACCCATCTTCTTCAACCT
CCATTTCTTCATTGCTTGCTTCCAAGTTCACCAATGGTGTTGGGTTCAAATCCACTGATCCGAATCTATTTGGTAATAACCTAGCTTCTCCAGCGTTTGGTCACCATCAT
CAACAACAAGTTGATCATGTGATGGGATCCAACGGTGGAGATCAATTAGGGCTGAATGTGAAAGATGTGAAATTGGAAGATGGGATGAAGAGGCTAAATTGGGATGATCA
GCAGAATCAAGCGGATGAAATTGCTACCCAATCTAATGATCATAATCCACTCTACGGTAATTGGAGCTCTCAAACATGGCACGATCCCGAAAATCTTGCTTCATCTATCA
CTTCTTCTCTCATCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPSSSSGLVMDKQHDQKTQLKQHQQDPLRCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKRPSSTTTTTTTTTTTTTTAAVTSPAP
DSTSSSSTSCPNMFYASNSDLNVPFSGYDLNPLGLGFCSPNIDHRDFNLNGFNSSSLLSGYSTLFAHNPSSSTSISSLLASKFTNGVGFKSTDPNLFGNNLASPAFGHHH
QQQVDHVMGSNGGDQLGLNVKDVKLEDGMKRLNWDDQQNQADEIATQSNDHNPLYGNWSSQTWHDPENLASSITSSLI