; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy0G002130 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy0G002130
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionDNA topoisomerase 2-binding protein 1 isoform X2
Genome locationGy14Chr0:4443394..4443857
RNA-Seq ExpressionCsGy0G002130
SyntenyCsGy0G002130
Gene Ontology termsGO:0016853 - isomerase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_031739410.1 DNA topoisomerase 2-binding protein 1-like [Cucumis sativus]1.36e-5585.71Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARKGC NE+LYPVGS+SGTSNKLTR CLTAHNSQEK I N + VPSSFL DSKFTAVAGP FSD+DVEVTLSQST MFSDAS+FINEVDVEVPV MGRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

XP_031740436.1 LOW QUALITY PROTEIN: DNA topoisomerase 2-binding protein 1 [Cucumis sativus]3.77e-6192.86Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARKGC NEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEK  GNLEAVPSSFL DSKFT VAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDAS+FINEVD+EVPVTMGRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

XP_031745842.1 LOW QUALITY PROTEIN: DNA topoisomerase 2-binding protein 1-A-like, partial [Cucumis sativus]2.17e-6595.54Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAG GFSDMDVEVTLSQSTSMF DASNFINEVDVEVPVTMGRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EE   NCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

XP_031745859.1 LOW QUALITY PROTEIN: DNA topoisomerase 2-binding protein 1-A [Cucumis sativus]9.23e-6597.32Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDV+ TLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

XP_038898757.1 DNA topoisomerase 2-binding protein 1 isoform X3 [Benincasa hispida]3.99e-5583.04Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARK C NEELYPVGSVSGTSNK+TRGCLTAHNSQEK  GNL+AVPSSF+ DS F+AV+GPGFSDMD E TLSQSTSMFSDAS+FINEVDVEVPV MG+N
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENT NC+ANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAL1 DNA topoisomerase 2-binding protein 1 isoform X36.94e-5583.93Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARK C +EELYPVG VSGTSNKLTR CLTAHNSQEK  GNL+A PSSF  DS FTAV+GPGFSDMDVE TLSQSTSMFSDAS+FINEVDVEVPV  GRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

A0A1S4DV57 DNA topoisomerase 2-binding protein 1 isoform X18.44e-5583.93Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARK C +EELYPVG VSGTSNKLTR CLTAHNSQEK  GNL+A PSSF  DS FTAV+GPGFSDMDVE TLSQSTSMFSDAS+FINEVDVEVPV  GRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

A0A1S4DV59 DNA topoisomerase 2-binding protein 1 isoform X28.36e-5583.93Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARK C +EELYPVG VSGTSNKLTR CLTAHNSQEK  GNL+A PSSF  DS FTAV+GPGFSDMDVE TLSQSTSMFSDAS+FINEVDVEVPV  GRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

A0A5A7U8G5 DNA topoisomerase 2-binding protein 1 isoform X28.31e-5583.93Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARK C +EELYPVG VSGTSNKLTR CLTAHNSQEK  GNL+A PSSF  DS FTAV+GPGFSDMDVE TLSQSTSMFSDAS+FINEVDVEVPV  GRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

A0A5D3BRP8 DNA topoisomerase 2-binding protein 1 isoform X28.87e-5583.93Show/hide
Query:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN
        +ARK C +EELYPVG VSGTSNKLTR CLTAHNSQEK  GNL+A PSSF  DS FTAV+GPGFSDMDVE TLSQSTSMFSDAS+FINEVDVEVPV  GRN
Subjt:  MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRN

Query:  EENTVNCLANDF
        EENTVNCLANDF
Subjt:  EENTVNCLANDF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAGAAAAGGATGTTTTAATGAGGAGCTGTACCCTGTTGGTAGCGTTTCTGGAACTTCAAATAAATTGACAAGGGGTTGCTTGACTGCTCACAATAGCCAAGAAAA
GGATATTGGGAACTTGGAAGCTGTACCGTCCTCATTTCTTACCGATTCAAAATTCACAGCAGTTGCTGGTCCTGGGTTTTCAGACATGGATGTTGAAGTTACTCTTTCAC
AGAGCACGTCTATGTTTTCAGATGCTTCTAATTTTATAAATGAGGTTGATGTTGAAGTGCCAGTCACGATGGGAAGGAATGAAGAAAACACTGTTAATTGTCTTGCAAAT
GACTTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCAGAAAAGGATGTTTTAATGAGGAGCTGTACCCTGTTGGTAGCGTTTCTGGAACTTCAAATAAATTGACAAGGGGTTGCTTGACTGCTCACAATAGCCAAGAAAA
GGATATTGGGAACTTGGAAGCTGTACCGTCCTCATTTCTTACCGATTCAAAATTCACAGCAGTTGCTGGTCCTGGGTTTTCAGACATGGATGTTGAAGTTACTCTTTCAC
AGAGCACGTCTATGTTTTCAGATGCTTCTAATTTTATAAATGAGGTTGATGTTGAAGTGCCAGTCACGATGGGAAGGAATGAAGAAAACACTGTTAATTGTCTTGCAAAT
GACTTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARKGCFNEELYPVGSVSGTSNKLTRGCLTAHNSQEKDIGNLEAVPSSFLTDSKFTAVAGPGFSDMDVEVTLSQSTSMFSDASNFINEVDVEVPVTMGRNEENTVNCLAN
DF