CuGenDBv2

Gene ID	CsGy1G004380
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Unknown protein
Genome location	Gy14Chr1:2790595..2795627
RNA-Seq Expression	CsGy1G004380
Synteny	CsGy1G004380
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR021562 - Protein of unknown function DUF3007

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137355.1 uncharacterized protein LOC101203378 [Cucumis sativus]

1.18e-139

100

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_008453500.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494194 [Cucumis melo]

4.94e-132

95.71

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT GCSN RIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYG FARERGTSRRLSKKEQ+DFPRKGFF TRKVVLTVPKDSSSSNTSSSN+D TNQ+EQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYD MQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_022925672.1 uncharacterized protein LOC111433018 [Cucurbita moschata]

6.88e-123

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVYGHFARERG+S RLSKKE+IDFP KGFFGT++VV+TVP+DSSSSNTSSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_023529460.1 uncharacterized protein LOC111792315 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.98e-122

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVYGHFARERG+S+R+SKKE IDFP KGFFGT+KVVLTV +DSSSSNTSSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_038880733.1 uncharacterized protein LOC120072335 [Benincasa hispida]

3.33e-130

92.86

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT GCSNSRIF EREGTLFLGISAAPVLPQ ARVYGHFARERGTSRRLSKKEQ+DFPRKGFF TRKVVLTVP+DSSSSNTS+S +D TNQ+E+TPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLK+GLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAEL+ALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LPZ9 Uncharacterized protein

5.71e-140

100

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

A0A1S3BX71 uncharacterized protein LOC103494194

2.39e-132

95.71

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT GCSN RIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYG FARERGTSRRLSKKEQ+DFPRKGFF TRKVVLTVPKDSSSSNTSSSN+D TNQ+EQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYD MQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

A0A6J1E245 uncharacterized protein LOC111430086

1.24e-115

86.34

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MA+FT GCS SR F EREGTL LGI AA  LPQ A VYGHFARE GTSR+LSK+E +DFPRKGFF TRKVVLTVP+DSSSSNTSSS DD T++ EQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAEL+ LLEQV+EEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSAS
        SQS S
Subjt:  SQSAS

A0A6J1EFX7 uncharacterized protein LOC111433018

3.33e-123

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVYGHFARERG+S RLSKKE+IDFP KGFFGT++VV+TVP+DSSSSNTSSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

A0A6J1IDW5 uncharacterized protein LOC111471752

5.52e-122

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVY HFARERG+S+RLSKKE IDFP KGFFGT+KVVLTVP+DSSSSN SSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G17930.1 unknown protein

1.7e-45

73.17

Show/hide

Query:  SSNTSSSNDDSTNQTEQTPFGYTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQK
        SSN++ + DDS  +T+ TPFGYTRKDV+LIG+GVT LG GL+SGLEY G DP+QAGN VQL+LVLGLTLGWISTY+FRV +K+MTYAQQLRDYE +VMQK
Subjt:  SSNTSSSNDDSTNQTEQTPFGYTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQK

Query:  RLESLTEAELVALLEQVEEEKSQ
        RLESL+EAEL AL+ QV+EEK++
Subjt:  RLESLTEAELVALLEQVEEEKSQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGTTTTTACTCTTGGATGCTCCAATTCCAGAATTTTTTCTGAAAGGGAAGGGACCTTGTTTTTAGGTATTTCGGCAGCTCCTGTTTTGCCACAGAGTGCGAGAGT
TTACGGACATTTTGCGAGAGAGAGAGGAACTAGTCGACGGTTGTCAAAAAAGGAACAAATTGATTTCCCAAGGAAAGGATTTTTTGGCACAAGGAAAGTTGTCCTCACAG
TCCCTAAGGACAGTAGCTCTTCAAACACAAGCAGCAGCAATGACGACTCTACAAATCAAACCGAGCAAACACCTTTTGGTTACACGAGGAAGGATGTTTTATTAATTGGT
TTAGGTGTCACAGTTCTTGGATTTGGATTGAAAAGTGGATTAGAGTATGCTGGATATGATCCTATGCAAGCAGGTAACGTCGTTCAGCTTGTTCTAGTTTTGGGTTTAAC
GCTAGGATGGATTTCCACGTACATGTTCAGAGTTTCAAGCAAGGACATGACATATGCTCAACAACTACGTGACTATGAAGACAAAGTCATGCAGAAACGCCTTGAAAGCC
TTACAGAAGCAGAGCTCGTAGCATTACTCGAACAGGTCGAGGAAGAAAAGAGTCAATCAGCAAGCAGCGAGCAGGTTAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCCAAATTAAACAGATTTTTCAAAATGAGATATGAATTAAGAGACGATTTTAGATTTTTTACTCCACAAGCTAAGTTGGATTGATCAATTTCCTGCAACCACTCCTCTTC
TGATACGTGACAAGCGTTCCGGAATGGCTGTTTTTACTCTTGGATGCTCCAATTCCAGAATTTTTTCTGAAAGGGAAGGGACCTTGTTTTTAGGTATTTCGGCAGCTCCT
GTTTTGCCACAGAGTGCGAGAGTTTACGGACATTTTGCGAGAGAGAGAGGAACTAGTCGACGGTTGTCAAAAAAGGAACAAATTGATTTCCCAAGGAAAGGATTTTTTGG
CACAAGGAAAGTTGTCCTCACAGTCCCTAAGGACAGTAGCTCTTCAAACACAAGCAGCAGCAATGACGACTCTACAAATCAAACCGAGCAAACACCTTTTGGTTACACGA
GGAAGGATGTTTTATTAATTGGTTTAGGTGTCACAGTTCTTGGATTTGGATTGAAAAGTGGATTAGAGTATGCTGGATATGATCCTATGCAAGCAGGTAACGTCGTTCAG
CTTGTTCTAGTTTTGGGTTTAACGCTAGGATGGATTTCCACGTACATGTTCAGAGTTTCAAGCAAGGACATGACATATGCTCAACAACTACGTGACTATGAAGACAAAGT
CATGCAGAAACGCCTTGAAAGCCTTACAGAAGCAGAGCTCGTAGCATTACTCGAACAGGTCGAGGAAGAAAAGAGTCAATCAGCAAGCAGCGAGCAGGTTAATTGAAGTC
ATTTCTATACCTGTTTTTTAGAAGTTCTCGGACTAGAAATTGAGGAGCAGGGTCTTGTGCATAGTATTCTATATGGGAACAGTGTAGAATAAGTTTGAGTAGCTTAAATA
ATGCATTTTAGATAGCTGTAAGAAAGTACAAAATAATGTAATCTATTCTTAGGATAATAAATCAAAACTACCTTATGACAAATATTCTTTAAACTATTTTTTTAGTACAA
ATAGGAAATGAGAGATTAAACTTCTTACTTATGGGTATAAGGTTGTGAATAGCATCGAACTAAATTCATTTTAACCTTTTATAAAAAGTTTTGTGAAACTGAAATTGCAG
TAAGATATTAAAGCC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFGYTRKDVLLIG
LGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEKSQSASSEQVN

CsGy1G004380 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome