| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_008439477.1 PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 4, mitochondrial-like isoform X1 [Cucumis melo] | 7.85e-102 | 88.89 | Show/hide |
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| XP_011649648.1 organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.21e-115 | 100 | Show/hide |
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| XP_011649654.1 organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus] | 4.22e-96 | 100 | Show/hide |
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| XP_031743837.1 organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic isoform X3 [Cucumis sativus] | 3.94e-96 | 100 | Show/hide |
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| XP_038895072.1 organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida] | 5.43e-98 | 86.11 | Show/hide |
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MTAGL FTV AAPKPFFQ Q THH++I STET RI SI+S+LAYSSTPLPFFS RKT SISDS LFS+AC SSSPS S PRRYTPSTRLY+SGLSFRT
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TEESLRNAFKSFGQLVEVNLVMD++ANRPRGFAFLRYA+EEESQKAIEGMHGKFLDGRVIFVEVAKSRSELRQGL+ENSS
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQB8 RRM domain-containing protein | 5.87e-116 | 100 | Show/hide |
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| A0A1S3AYF6 glycine-rich RNA-binding protein 4, mitochondrial-like isoform X1 | 3.80e-102 | 88.89 | Show/hide |
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MTAGLSFTVTAAPKPFF LQTTHH++I STET MR +S QSKLAYSSTPLPFFSARKTQSIS+S LFSVACVSSSPS PRRY+PSTRLY+SGLSFRT
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| A0A5A7SXY0 Glycine-rich RNA-binding protein 4 | 3.37e-85 | 89.03 | Show/hide |
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MTAGLSFTVTAAPKPFFQLQTTHH++I STET MR +S QSKLAYSSTPLPFFSARKTQSIS+S LFSVACVSSSPS PRRY+PSTRLY+SGLSFRT
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TEESLRNAFKSFGQLVEVNLVMDR+ANRPRGFAFLRYASEEESQKAIEGMHGK L
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|
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| A0A6J1GCJ4 organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic | 1.29e-88 | 81.67 | Show/hide |
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MTAGL F+ AAP PFFQLQ+ ++ I ST TRMRI+SIQSKLAYS+TP PFFS +KT+SISDS LFSV CVSSSPS S PRRY+PSTRLY+SGLSFRT
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TEESLRNAF SFGQLVEVNLVMD++ANRPRGFAFLRYA+EEESQKAIEGMHGKFLDGRVIFVEVAKS+ ELRQGL+ENSS
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| A0A6J1KDG6 organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic-like | 1.49e-90 | 82.22 | Show/hide |
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MTAGL F+ A P PFFQLQ+T +++I ST TRMRI+SIQSKLAYS+TPLPFFS +KT+SISDS LFSV CVSSSPS S PRRY+PSTRLY+SGLSFRT
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TEESLRNAF SFGQLVEVNLVMD++ANRPRGFAFLRYA+EEESQKAIEGMHGKFLDGRVIFVEVAKS+ ELRQGL+ENSS
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|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| C0HFE5 Organelle RRM domain-containing protein 1, chloroplastic | 2.7e-17 | 48.19 | Show/hide |
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RL+++GLSF T+E++LR AF+ FG+LVEV ++MDR++ R +G+AF+ Y +EE A++ M+G+ ++G +I V+VAK+RS R
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|
|
| Q6YWP9 Organelle RRM domain-containing protein 1, chloroplastic | 2.1e-17 | 43.75 | Show/hide |
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SS + + + RL+++GLSF T+E++LR AF+ FG+LVEV ++MD+++ R +G+AF+ Y +EE A++ M+G+ ++G +I V+VAK RS RQ
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|
|
| Q9FFZ6 Small RNA-binding protein 11, chloroplastic | 2.1e-17 | 45.87 | Show/hide |
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L SV ++SS S + RR S +L+I GLSF TTE+ L AF GQ+VE +VMDR+++R +GF F+ +AS +E+QKA+ +G+ L+GR IFV+ A
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Query: KSRSELRQG
K++ L G
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|
|
| Q9FIU6 Organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial | 1.5e-18 | 46.3 | Show/hide |
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S + S +P R PST L++SGLS RTT E LR AF FG++ + +V DR++ +GF F+RYA+ E+S K I GM GKFLDG VIF E A+ R +
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Query: RQGLEENS
+ +N+
Subjt: RQGLEENS
|
|
| Q9FX45 Organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic | 3.9e-32 | 59.32 | Show/hide |
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SAR+ + I L+ S C+S+ SSS P T+LY+SGLSFRTTE++LR+ F+ FG L+ +N+VMD++ANRP+GFAFLRY +EEE+ KAI+GMHGK
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Query: FLDGRVIFVEVAKSRSEL
FLDGRVIFVE AK+RS++
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G73530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.8e-33 | 59.32 | Show/hide |
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Query: FLDGRVIFVEVAKSRSEL
FLDGRVIFVE AK+RS++
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|
|
| AT3G20930.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.2e-17 | 43.75 | Show/hide |
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S S SP + +L+I+GLSF T+E++LR AF+ FG+LVEV ++MD+++ R +G+AFL Y +EE + A++ M+GK ++G +I V+VAK++
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|
|
| AT3G46020.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.0e-19 | 45.16 | Show/hide |
Query: STRLYISGLSFRTTEESLRNAFKSFGQLVEVNLVMDRLANRPRGFAFLRYASEEESQKAIEGMHGKFLDGRVIFVEVAKSRSELRQGLEENSS
S +L++S LS TT++SLR F FGQ+ E L+ D RP+GF F+ + SE++++KA++ + GK +DGR+IFVEVAK+ E+R G+ N +
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|
|
| AT5G06210.1 RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.5e-18 | 45.87 | Show/hide |
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L SV ++SS S + RR S +L+I GLSF TTE+ L AF GQ+VE +VMDR+++R +GF F+ +AS +E+QKA+ +G+ L+GR IFV+ A
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Query: KSRSELRQG
K++ L G
Subjt: KSRSELRQG
|
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| AT5G54580.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.0e-19 | 46.3 | Show/hide |
Query: SSPSSSSSPRR--YTPSTRLYISGLSFRTTEESLRNAFKSFGQLVEVNLVMDRLANRPRGFAFLRYASEEESQKAIEGMHGKFLDGRVIFVEVAKSRSEL
S + S +P R PST L++SGLS RTT E LR AF FG++ + +V DR++ +GF F+RYA+ E+S K I GM GKFLDG VIF E A+ R +
Subjt: SSPSSSSSPRR--YTPSTRLYISGLSFRTTEESLRNAFKSFGQLVEVNLVMDRLANRPRGFAFLRYASEEESQKAIEGMHGKFLDGRVIFVEVAKSRSEL
Query: RQGLEENS
+ +N+
Subjt: RQGLEENS
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