; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy1G005180 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy1G005180
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionpectinesterase 3
Genome locationGy14Chr1:3475169..3476235
RNA-Seq ExpressionCsGy1G005180
SyntenyCsGy1G005180
Gene Ontology termsGO:0043086 - negative regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0030599 - pectinesterase activity (molecular function)
GO:0046910 - pectinesterase inhibitor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006501 - Pectinesterase inhibitor domain
IPR035513 - Invertase/pectin methylesterase inhibitor domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652503.1 hypothetical protein Csa_013672 [Cucumis sativus]9.52e-214100Show/hide
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XP_004137577.1 pectinesterase 3 [Cucumis sativus]6.34e-173100Show/hide
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XP_008440324.1 PREDICTED: pectinesterase 3 [Cucumis melo]4.16e-16293.65Show/hide
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XP_023001663.1 pectinesterase 3 [Cucurbita maxima]6.16e-11172.33Show/hide
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         +ESCL+G+EEMD+TSF EVK RM+KS EYVSN LAIVANIHVIL+KF MPLH
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XP_038895980.1 pectinesterase 3 [Benincasa hispida]9.57e-11875.79Show/hide
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        +ESCLEG+EEMD+TSF+EVK RMKKSIEYVSNSLAIVANIHVIL  F+MPLH
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVF4 PMEI domain-containing protein3.07e-173100Show/hide
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A0A1S3B0W1 pectinesterase 32.01e-16293.65Show/hide
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A0A5A7T3U1 Pectinesterase 32.01e-16293.65Show/hide
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A0A6J1EDL6 pectinesterase 37.00e-10971.83Show/hide
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        FTSI SLNSSP+PDPELIL LSLQVSLNELSN+SR LK++   G G    ALKDC+SQIEDAIS VNDS AEM  G+GEKTLTESKIGNIQTWMSSAMT+
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        +ESCL+G+EEMD+TSF EVK RM+KS EYVSN LAIVANIHVIL+KF MPLH
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A0A6J1KR63 pectinesterase 32.98e-11172.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q43111 Pectinesterase 37.8e-3333.84Show/hide
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        TRYP+SCF+SI SL  S   DPEL+  LSL+V+++ELS+    L++   E D     A+  C S   DA+ ++NDS++ + G    +  + + + N++TW
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Query:  MSSAMTNEESCLEGVEEMDAT----SFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
        +S+A+T++++CL+ V E+++T    + +E++  M+ S E+ SNSLAIV  I  +L +F  P+H
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Q43867 Pectinesterase 11.7e-2732.58Show/hide
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        MD +N+ KGYGK+     DL             K  T     LL     +IS ++L A+II+ +V   +H   N +  +       + ++  +C+VTR+P
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Query:  NSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSS
         SC +SI  L SS   DPE +  LSL+V ++EL ++S   + +  E  D    +AL+ C   IEDA+ ++ND+V+ +     +KTL+ SKI +++TW+S+
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Query:  AMTNEESCLEGVEEM--------DATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
         +T+ E+C + ++E+        ++T  + +K  M +S E+ SNSLAIV+ I   L    +P+H
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Q8GX86 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 218.9e-1324.14Show/hide
Query:  ISALLLTALIISLIVGVYI--HNSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGG-EGDGG
        IS++LL ++++++ VGV +  H+     K+  N +   +  VC  T Y  +C  ++   N     DP  ++  +  V++ ++++ ++  +++   + D  
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Query:  AAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKF
           AL  C+  ++ A+ ++++S  E+  G  E  L +  + N++ W+S+A+++EE+CLEG +     + E +K+ +K +IE   N LAI++ +   + + 
Subjt:  AAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKF

Query:  NMP
         +P
Subjt:  NMP

Q9LUL8 Putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 261.3e-2436.87Show/hide
Query:  FAAAISALLLTALIISLIVGVYIH-------NSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKS
        +   IS  +L A+IIS  V + IH       + TP +      AA ++  VC+VT YP SCF+SI  L  S   DPE+I  LSLQV ++EL+++    K 
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Query:  VGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFE---EVKRRMKKSIEYVSNSLA
        +  E  D G  +AL  C+  ++ AI +VN++V+ M    G+K L  + I ++ TW+S+A+T   +CL+ ++E+  T+     ++K  M  S E+ SNSLA
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Query:  IVANIHVILDKFNMPLH
        IVA I   +  F +P+H
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Q9SB38 Pectinesterase inhibitor 41.8e-1326.15Show/hide
Query:  LLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSS-----NNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAA
        +L  +++SL + V+I++S     +++      N    +   CN T YP  C+  + S +S+ + DP  +   SL +++    N +  + ++  +     +
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Query:  ---AALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEE--MDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVAN
           + LKDC  +++D I ++  +VAEM+   G    TE  + N++TW+SSA+T+E +C +G EE  ++  + ++VK+ + +  +  SN+LA++ +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53840.1 pectin methylesterase 11.2e-2832.58Show/hide
Query:  MDQINALKGYGKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFAAAISALLLTALIISLIVGVYIH---NSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYP
        MD +N+ KGYGK+     DL             K  T     LL     +IS ++L A+II+ +V   +H   N +  +       + ++  +C+VTR+P
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Query:  NSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSS
         SC +SI  L SS   DPE +  LSL+V ++EL ++S   + +  E  D    +AL+ C   IEDA+ ++ND+V+ +     +KTL+ SKI +++TW+S+
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Query:  AMTNEESCLEGVEEM--------DATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
         +T+ E+C + ++E+        ++T  + +K  M +S E+ SNSLAIV+ I   L    +P+H
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AT2G01610.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein5.0e-1932.42Show/hide
Query:  PDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNE-------LSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQV
        P   +++ N    I   CN T YP+ CFTS+    S+ Q  P  +  L++ VSL++       LS +SR      G+G   A+A ++DC S +EDA+ ++
Subjt:  PDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNE-------LSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQV

Query:  NDSVAEMR------GGSGEKTLTES---KIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSF--EEVKRRMKKSIEYVSNSLAIV
          S+ ++R      GG+  +   E+   ++ N+QTWMS+A+T+E++C +G E+MD        V  R+++     SN+LA+V
Subjt:  NDSVAEMR------GGSGEKTLTES---KIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSF--EEVKRRMKKSIEYVSNSLAIV

AT3G14300.1 pectinesterase family protein9.4e-2636.87Show/hide
Query:  FAAAISALLLTALIISLIVGVYIH-------NSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKS
        +   IS  +L A+IIS  V + IH       + TP +      AA ++  VC+VT YP SCF+SI  L  S   DPE+I  LSLQV ++EL+++    K 
Subjt:  FAAAISALLLTALIISLIVGVYIH-------NSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKS

Query:  VGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFE---EVKRRMKKSIEYVSNSLA
        +  E  D G  +AL  C+  ++ AI +VN++V+ M    G+K L  + I ++ TW+S+A+T   +CL+ ++E+  T+     ++K  M  S E+ SNSLA
Subjt:  VGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFE---EVKRRMKKSIEYVSNSLA

Query:  IVANIHVILDKFNMPLH
        IVA I   +  F +P+H
Subjt:  IVANIHVILDKFNMPLH

AT3G47670.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein2.8e-3035.11Show/hide
Query:  FPFANLKGTNFLPSFLPSLNLN--RNRSICKIMDQINALKGYGKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFA-AAISALLLTALIISLIVGV
        F F  L    F P    S + N  R+++    M+ IN LKGY K++     + H    P  KP+S       FS     A  ++ +LLL   +++L  G 
Subjt:  FPFANLKGTNFLPSFLPSLNLN--RNRSICKIMDQINALKGYGKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFA-AAISALLLTALIISLIVGV

Query:  YIHNSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSI-FSLNSSPQP-DPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQ
        + H S P +   S   + ++  +C+VTRYP +CF S+  SLN S    +PE IL LSL+V+  E+SN+S   +S+    D    AA+ DC     DA+SQ
Subjt:  YIHNSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSI-FSLNSSPQP-DPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQ

Query:  VNDSVAEM---RGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVIL
        +NDS+ E+   +   G   LTE  +G+++TW+S+AMT+ E+C +G+EEM      E+K++M+ + + +S SLAIV+ +  +L
Subjt:  VNDSVAEM---RGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVIL

AT4G25250.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein1.3e-1426.15Show/hide
Query:  LLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSS-----NNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAA
        +L  +++SL + V+I++S     +++      N    +   CN T YP  C+  + S +S+ + DP  +   SL +++    N +  + ++  +     +
Subjt:  LLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSS-----NNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAA

Query:  ---AALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEE--MDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVAN
           + LKDC  +++D I ++  +VAEM+   G    TE  + N++TW+SSA+T+E +C +G EE  ++  + ++VK+ + +  +  SN+LA++ +
Subjt:  ---AALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEE--MDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVAN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTACAATAAATGAAAACTGTGGGTTTATCTTTGACTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTCGCAAACTTGAAAGGAACGAACTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC
TCTAAATTTGAACAGAAACCGATCAATTTGTAAAATCATGGATCAAATCAATGCTCTCAAAGGCTATGGCAAACTCACTCACCTCAACCTCGACCTCGAACATCAAATTC
CCCCACCCCCCTCCAAACCAAACTCCAAATTCCCCACCAACCACAATTTTTCTCTCCTACTCCGCTTCGCCGCCGCCATCTCCGCCCTCCTCCTCACCGCTCTAATCATC
AGTCTGATCGTCGGAGTCTACATCCACAACTCCACCCCCGACAACAAATCATCATCTAATAACGCTGCCCACACAATCAGCATCGTCTGCAACGTAACTCGTTACCCTAA
TTCCTGCTTCACCTCAATCTTTTCTCTCAATTCCTCTCCCCAACCCGACCCCGAACTCATTTTAAACCTCTCTCTCCAAGTTTCCCTAAACGAGCTCTCCAATATGTCCC
GATGGCTAAAAAGCGTAGGTGGAGAGGGCGACGGAGGAGCAGCAGCAGCTTTGAAGGACTGCCAGAGCCAAATCGAAGACGCAATTAGCCAAGTCAATGATTCGGTAGCA
GAAATGAGAGGCGGTTCCGGGGAGAAGACGTTGACGGAGAGTAAGATCGGGAACATTCAGACGTGGATGAGCAGTGCGATGACGAATGAGGAAAGCTGTTTGGAGGGAGT
GGAGGAGATGGATGCGACGTCGTTTGAAGAGGTGAAGAGGAGGATGAAAAAGTCCATAGAATACGTAAGCAACAGCTTGGCCATCGTGGCTAACATCCACGTCATTCTTG
ACAAATTTAATATGCCACTTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGTACAATAAATGAAAACTGTGGGTTTATCTTTGACTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTCGCAAACTTGAAAGGAACGAACTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC
TCTAAATTTGAACAGAAACCGATCAATTTGTAAAATCATGGATCAAATCAATGCTCTCAAAGGCTATGGCAAACTCACTCACCTCAACCTCGACCTCGAACATCAAATTC
CCCCACCCCCCTCCAAACCAAACTCCAAATTCCCCACCAACCACAATTTTTCTCTCCTACTCCGCTTCGCCGCCGCCATCTCCGCCCTCCTCCTCACCGCTCTAATCATC
AGTCTGATCGTCGGAGTCTACATCCACAACTCCACCCCCGACAACAAATCATCATCTAATAACGCTGCCCACACAATCAGCATCGTCTGCAACGTAACTCGTTACCCTAA
TTCCTGCTTCACCTCAATCTTTTCTCTCAATTCCTCTCCCCAACCCGACCCCGAACTCATTTTAAACCTCTCTCTCCAAGTTTCCCTAAACGAGCTCTCCAATATGTCCC
GATGGCTAAAAAGCGTAGGTGGAGAGGGCGACGGAGGAGCAGCAGCAGCTTTGAAGGACTGCCAGAGCCAAATCGAAGACGCAATTAGCCAAGTCAATGATTCGGTAGCA
GAAATGAGAGGCGGTTCCGGGGAGAAGACGTTGACGGAGAGTAAGATCGGGAACATTCAGACGTGGATGAGCAGTGCGATGACGAATGAGGAAAGCTGTTTGGAGGGAGT
GGAGGAGATGGATGCGACGTCGTTTGAAGAGGTGAAGAGGAGGATGAAAAAGTCCATAGAATACGTAAGCAACAGCTTGGCCATCGTGGCTAACATCCACGTCATTCTTG
ACAAATTTAATATGCCACTTCACTAATTTTTATTTTTAAAATGTAATCATCATCATCATCATCATGTTCAATACAAATACCCCTTTGTTTGCTTGTTTTTCTTTTAATTT
CCTCAATGAAAAGAAAAAATAAATAATCCTTGTTGATACTTTGGAAATTGTATTTATTTGACAAATTTTAGTCTTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCTINENCGFIFDFPFPFPFPFANLKGTNFLPSFLPSLNLNRNRSICKIMDQINALKGYGKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFAAAISALLLTALII
SLIVGVYIHNSTPDNKSSSNNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVA
EMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH