CuGenDBv2

Gene ID	CsGy1G005900
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Protein of unknown function (DUF1118)
Genome location	Gy14Chr1:3848251..3849227
RNA-Seq Expression	CsGy1G005900
Synteny	CsGy1G005900
Gene Ontology terms	GO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process) GO:0010196 - nonphotochemical quenching (biological process) GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0090391 - granum assembly (biological process) GO:0009515 - granal stacked thylakoid (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009500 - Protein of unknown function DUF1118

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137438.1 uncharacterized protein LOC101204037 [Cucumis sativus]

1.05e-122

100

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_008451074.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492437 [Cucumis melo]

2.03e-120

98.48

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_022137623.1 uncharacterized protein LOC111009021 [Momordica charantia]

9.46e-104

88.61

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEVTSFCSSS R  SF+YSYP  T SR   P     L + SMA EKPLPSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQ AVALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

XP_023520287.1 uncharacterized protein LOC111783600 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.87e-102

88.89

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGS-KKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL
        MEVTSFC SS RAASF+YSYPS T SR K+ L L SMA +KP PSAAKTV S KK+N+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGS-KKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL

Query:  LSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        LSAAEKAGLSLSSIEKLG LSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPE+SVWEI LQ AVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  LSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_038893804.1 uncharacterized protein LOC120082623 [Benincasa hispida]

1.02e-108

91.37

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEV+SFCSSS RAASF++SYPS T SR KR LHLHSMA EKP PSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPR+SISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVW+I LQV+VALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LQ98 Uncharacterized protein

5.08e-123

100

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A1S3BQ40 uncharacterized protein LOC103492437

9.82e-121

98.48

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A5D3BGQ3 Uncharacterized protein

9.82e-121

98.48

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A6J1CAU4 uncharacterized protein LOC111009021

4.58e-104

88.61

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEVTSFCSSS R  SF+YSYP  T SR   P     L + SMA EKPLPSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQ AVALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

A0A6J1K230 uncharacterized protein LOC111490350

5.09e-101

84.65

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEV S  SS+ RAASFIYSYP  T S+ + P     LH+H+MA EKP  SA KT+GSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRP-----LHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPED+VWEIVLQ A ALVS++GGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G74730.1 Protein of unknown function (DUF1118)

3.6e-10

38.84

Show/hide

Query:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATD-PGT-PGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVS
        + +  ++E+ K+LS  EK+GLLS AE  GL+LSS+EKL + SKAE+LG+LS   +  GT P  L S +L  L      V L+P+DS   +V Q  +A   
Subjt:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATD-PGT-PGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVS

Query:  IVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
         + G      S ++  LQ ++
Subjt:  IVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

AT5G08050.1 Protein of unknown function (DUF1118)

7.8e-45

63.47

Show/hide

Query:  LHLHSMATEKPLPSAA-KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSA
        L +HSMA +KP PSAA +T+ SKK   T                  P +KLLTRVEQLKLL+KAEKAGLLS AEK+G SLS+IE+LGLL+KAEE GVLSA
Subjt:  LHLHSMATEKPLPSAA-KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSA

Query:  ATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        AT+P TPG L +LSLGLLLLGP   Y+VPED  WE+V+QV VAL+S++GGSAAFAAS  VSNLQ+S+
Subjt:  ATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGTCACTTCTTTCTGTAGCAGCAGCACCAGAGCAGCTTCCTTCATCTACTCATATCCTTCCACAACCACTTCAAGAAGAAAACGCCCTCTTCATCTTCAT
TCCATGGCTACCGAGAAACCTCTCCCCTCCGCCGCTAAAACCGTCGGCTCCAAGAAGATCAACACCACGGTGTTCCCTCTCGGCGAGAAAGGCCCAAGGAGTAGC
ATCTCGCTCTCGACTTCACCGCCGATTAAGCTACTGACGAGGGTGGAGCAATTGAAGTTACTAAGCAAGGCGGAGAAGGCTGGGTTGCTATCTGCGGCGGAGAAG
GCCGGGTTGTCTTTGTCTTCGATTGAGAAATTAGGACTTCTGTCGAAGGCTGAGGAATTGGGGGTTTTATCGGCAGCGACAGATCCAGGAACTCCCGGTGCGTTG
CTGAGTTTAAGCTTAGGGCTGTTGTTATTAGGGCCTTCATGTGTGTATTTGGTGCCGGAAGATAGTGTTTGGGAAATCGTGTTGCAGGTGGCAGTGGCTCTGGTC
TCCATCGTCGGCGGTTCCGCAGCTTTTGCCGCGTCGAATTTGGTCTCGAATTTGCAAAGATCGAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCATCATACATTTCCATGGTGCGGGCCTCTGCAATTCTCTCCTTCATCGGATTCATCCCTAACCATCGCCATTCTTCACTCTCCACACACTCACTAACTCTCTTC
TAGCTATGGAGGTCACTTCTTTCTGTAGCAGCAGCACCAGAGCAGCTTCCTTCATCTACTCATATCCTTCCACAACCACTTCAAGAAGAAAACGCCCTCTTCATC
TTCATTCCATGGCTACCGAGAAACCTCTCCCCTCCGCCGCTAAAACCGTCGGCTCCAAGAAGATCAACACCACGGTGTTCCCTCTCGGCGAGAAAGGCCCAAGGA
GTAGCATCTCGCTCTCGACTTCACCGCCGATTAAGCTACTGACGAGGGTGGAGCAATTGAAGTTACTAAGCAAGGCGGAGAAGGCTGGGTTGCTATCTGCGGCGG
AGAAGGCCGGGTTGTCTTTGTCTTCGATTGAGAAATTAGGACTTCTGTCGAAGGCTGAGGAATTGGGGGTTTTATCGGCAGCGACAGATCCAGGAACTCCCGGTG
CGTTGCTGAGTTTAAGCTTAGGGCTGTTGTTATTAGGGCCTTCATGTGTGTATTTGGTGCCGGAAGATAGTGTTTGGGAAATCGTGTTGCAGGTGGCAGTGGCTC
TGGTCTCCATCGTCGGCGGTTCCGCAGCTTTTGCCGCGTCGAATTTGGTCTCGAATTTGCAAAGATCGAATTGAAATTCAGTGTTGGAATTTGTTAATGGCAGCC
ATGAAAGTTGTAGTTATCAGCTTTCCTTCTCCTTCCATGTCGTCGTTTTGTATGCTGTAATTATTGAATTTCATCATTTCCCGGCGAGTTAAAATGGCGATATTT
GAACGGCAAATCTTATGCTCTCAATTTTACACCTTATGCCGATTCAAAATTAAATATTGAAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEK
AGLSLSSIEKLGLLSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

CsGy1G005900 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome