| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA8547639.1 hypothetical protein F0562_004068 [Nyssa sinensis] | 4.43e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAB1227682.1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 [Morella rubra] | 4.43e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_004137538.1 sm-like protein LSM8 [Cucumis sativus] | 4.43e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_022155134.1 sm-like protein LSM8 [Momordica charantia] | 4.43e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_042494798.1 sm-like protein LSM8 [Macadamia integrifolia] | 6.30e-43 | 98.61 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
G+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LT86 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.15e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A1S3ATI1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.15e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6A1WQX6 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.15e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1GT46 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.15e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1K221 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.15e-43 | 100 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O95777 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 65.28 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q3ZCE0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 65.28 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q5RCP3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 65.28 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q6ZWM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 65.28 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q8VYI0 Sm-like protein LSM8 | 2.4e-31 | 87.5 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G19120.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 8.4e-08 | 46.3 | Show/hide |
Query: MQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
+ G+L+ FDQ N +L+E++ERV + + LGLYIIRG+N+ ++GELD E
Subjt: MQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
| AT1G65700.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-32 | 87.5 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.2 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-32 | 87.5 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.3 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 3.1e-26 | 54.78 | Show/hide |
Query: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNL
GVLKGFDQATNIILDESHERV+STK EGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++L
Subjt: GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNL
Query: DLSKLRAHPLKPVIH
D SKLRAHPLKPV+H
Subjt: DLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT3G14080.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 7.1e-07 | 44.44 | Show/hide |
Query: MQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
+ G L+ FDQ N +L+ + ERV E + LGLY+IRG+N+ ++GELD E
Subjt: MQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
