; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy1G013840 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy1G013840
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like
Genome locationGy14Chr1:9452593..9457540
RNA-Seq ExpressionCsGy1G013840
SyntenyCsGy1G013840
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001857 - Ribosomal protein L19
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR038657 - Ribosomal protein L19 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652777.1 hypothetical protein Csa_022701 [Cucumis sativus]5.29e-15288.1Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------
        MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF                      
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------

Query:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
                  LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
Subjt:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS

Query:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

XP_011654048.1 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic isoform X4 [Cucumis sativus]1.54e-162100Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESA
        MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESA
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESA

Query:  LQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESL
        LQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESL
Subjt:  LQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESL

Query:  FPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        FPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  FPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

XP_031743848.1 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]8.25e-15586.81Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------
        MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF                      
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------

Query:  --------------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
                      LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
Subjt:  --------------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK

Query:  RRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        RRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  RRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

XP_031743853.1 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]1.75e-15588.1Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------
        MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF                      
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------

Query:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
                  LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
Subjt:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS

Query:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

XP_031743858.1 50S ribosomal protein L19, chloroplastic isoform X3 [Cucumis sativus]3.44e-16098.34Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----LAETAAPFSSRGIATTSS
        MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF    LAETAAPFSSRGIATTSS
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----LAETAAPFSSRGIATTSS

Query:  MESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVG
        MESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVG
Subjt:  MESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVG

Query:  IESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        IESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  IESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV41 Uncharacterized protein1.07e-15388.1Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------
        MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF                      
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------

Query:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
                  LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
Subjt:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS

Query:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A1S3CHC3 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like isoform X12.24e-14282.96Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------
        MQGFRRINQLVRRQ PDA+FKLIRGYPLNGDA CSCSAPM MENSFTIP LFGKSYGSL GS  RSFS SGNQYPEAF                      
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------

Query:  -----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRI
                   LAE AAPFSSRGIATTSSM SAL GSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKA REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRI
Subjt:  -----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRI

Query:  STLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        STLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  STLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A1S3CHF9 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like isoform X21.53e-14283.27Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------
        MQGFRRINQLVRRQ PDA+FKLIRGYPLNGDA CSCSAPM MENSFTIP LFGKSYGSL GS  RSFS SGNQYPEAF                      
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------

Query:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
                  LAE AAPFSSRGIATTSSM SAL GSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKA REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
Subjt:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS

Query:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A1S3CHY3 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X31.36e-14994.51Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESA
        MQGFRRINQLVRRQ PDA+FKLIRGYPLNGDA CSCSAPM MENSFTIP LFGKSYGSL GS  RSFS SGNQYPEAFLAE AAPFSSRGIATTSSM SA
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESA

Query:  LQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESL
        L GSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKA REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESL
Subjt:  LQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESL

Query:  FPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        FPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  FPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A6J1CB38 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like7.10e-12775.09Show/hide
Query:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------
        MQ FRRINQLVRRQ PDA+FK IRGYPLNGDAGCSCSAPMSMEN FTI   FG  YGSL GSFLRSFS+  NQYPEAF                      
Subjt:  MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAF----------------------

Query:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS
                  LAE A PFSSRGIAT SS+ES  Q SP +   I PRIKFKRLDKTS+HIMQILDKEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR+S
Subjt:  ----------LAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRIS

Query:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        TLKGIVIARRNAGLN+TFR+RR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVL+KKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  TLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P82413 50S ribosomal protein L19, chloroplastic2.6e-3142.03Show/hide
Query:  PMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAP----FSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRH-------I
        P+  +  F I      S  S C S L     S N +   F +  + P    F  R  A  SS   A   +   +  +P   + +  ++  R        I
Subjt:  PMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAP----FSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRH-------I

Query:  MQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYL
        M IL+K+AV   +  R +P I+ G IVQ+++EVPENKRR+S  KGIVI+R+NAG+++T RIRR++AGVG+E +FPLYSPNIKEIKV+  +KVR+A+LYYL
Subjt:  MQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYL

Query:  RDKMNAL
        RDK+  L
Subjt:  RDKMNAL

Q2G8H1 50S ribosomal protein L197.7e-2048.11Show/hide
Query:  HIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR-RISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKL
        +++Q L+ EA+ E KA++EIPD + G  V++ V V E +R R+   +G+ IAR N GL S F +R++  G G+E +FPLYSPNI  I V+ +  VRRAKL
Subjt:  HIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR-RISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKL

Query:  YYLRDK
        YYLR +
Subjt:  YYLRDK

Q2VZV5 50S ribosomal protein L191.2e-2047.17Show/hide
Query:  HIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKL
        +I++ L+KE +E++ A R +P   PG  +++ V+V E N+ R+   +G+ IAR+N GLNS+F +R++  G G+E +FPLYSPNI  I+V+ +  VRRAKL
Subjt:  HIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKL

Query:  YYLRDK
        YYLRD+
Subjt:  YYLRDK

Q8RXX5 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic7.5e-3158.33Show/hide
Query:  IMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYY
        IM +L+K+A+E  +  R +P ++ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG+++T RIRR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYY
Subjt:  IMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYY

Query:  LRDKMNAL
        LRDK+  L
Subjt:  LRDKMNAL

Q8W463 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic7.5e-3147.17Show/hide
Query:  EAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVI
        E F+AE A         T  ++E  ++  P       PRIK          +M IL+++A+E  +  R +P+I+ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV+
Subjt:  EAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVI

Query:  ARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        +R+NAG+++T RIRR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  ARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24240.1 Ribosomal protein L19 family protein6.7e-5976.16Show/hide
Query:  FSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNST
        FSSR  +TT     ++QGSP  D V+P RIKFKRLDKT++HIMQI+DKEAVEEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRR+S +KG+VIARRNAGLNST
Subjt:  FSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNST

Query:  FRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        FRIRR+VAGVG+ES+FPLYSPN++ IKV++KKKVRRAKLYYLR+K+NALKK
Subjt:  FRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT4G11630.1 Ribosomal protein L19 family protein2.1e-6076.82Show/hide
Query:  FSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNST
        ++SR  +TT   +S++QGSP  D V+P RIKFKRLDKT++HIMQI+DKEAVEEV++ REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRR+S +KG+VIARRNAGLNST
Subjt:  FSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNST

Query:  FRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        FRIRR+VAGVG+ES+FPLYSPN++EIKV++KKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
Subjt:  FRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT4G17560.1 Ribosomal protein L19 family protein5.3e-3247.17Show/hide
Query:  EAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVI
        E F+AE A         T  ++E  ++  P       PRIK          +M IL+++A+E  +  R +P+I+ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV+
Subjt:  EAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVI

Query:  ARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        +R+NAG+++T RIRR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  ARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

AT5G11750.1 Ribosomal protein L19 family protein7.9e-6076.97Show/hide
Query:  FSSRGIATT-SSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNS
        +S R  +TT  S++S  QGSP  D V+P RIKFKRLDKT++HIMQI+DKEAVEEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRR+S +KG+VIARRNAGLNS
Subjt:  FSSRGIATT-SSMESALQGSPAVDSVIPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNS

Query:  TFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        TFRIRR+VAGVG+ES+FPLYSPN++EIKV++KKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
Subjt:  TFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT5G47190.1 Ribosomal protein L19 family protein5.3e-3258.33Show/hide
Query:  IMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYY
        IM +L+K+A+E  +  R +P ++ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG+++T RIRR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYY
Subjt:  IMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVRRAKLYY

Query:  LRDKMNAL
        LRDK+  L
Subjt:  LRDKMNAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGTTTTCGCAGAATTAATCAATTGGTACGAAGGCAAATTCCTGATGCTAATTTCAAATTGATTAGAGGTTATCCTCTGAATGGGGATGCTGGCTGTAGCTGCTC
GGCCCCAATGTCGATGGAAAACAGTTTTACTATTCCTTATCTTTTTGGGAAGTCATATGGGTCTTTGTGTGGTTCCTTCTTGAGGTCTTTCTCGAGGTCGGGCAATCAAT
ATCCGGAAGCCTTCTTGGCAGAAACTGCAGCTCCTTTTTCTAGTAGGGGCATTGCTACGACAAGCTCGATGGAATCAGCTCTACAGGGATCCCCTGCAGTTGATTCTGTT
ATACCACCTCGCATCAAATTTAAGAGGCTTGATAAAACCTCAAGACACATAATGCAGATTTTAGATAAGGAAGCTGTTGAGGAGGTAAAAGCACGAAGAGAAATTCCAGA
TATAAAGCCAGGCTATATTGTGCAGCTCAAAGTGGAAGTACCTGAGAACAAGCGACGTATCTCAACATTGAAAGGTATTGTGATAGCCAGACGAAATGCCGGTCTAAACT
CAACTTTTAGAATAAGGAGGGTAGTTGCTGGTGTTGGGATTGAGTCCCTCTTTCCTCTATACTCACCGAACATAAAAGAGATTAAGGTATTGGAGAAGAAGAAAGTGCGC
AGAGCTAAGCTTTACTATCTTAGGGACAAAATGAACGCGCTTAAGAAGCAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTTCGTAAAATCAAAATAACTCTTTCATCATCATCGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCACGCCGTCTCCTCCTCTGTTTCAGCAGATCGGTTTCGCCGCCGCCG
TCGTCTTTCTTACGCTCGTGCTGTCGAGCCCTCTTTTCCAGCGGTTTTGCACTGATTTCTTACTCCTTTGTTGTCACTGCTGGAAATCTAGTGCGAAAATGCAAGGTTTT
CGCAGAATTAATCAATTGGTACGAAGGCAAATTCCTGATGCTAATTTCAAATTGATTAGAGGTTATCCTCTGAATGGGGATGCTGGCTGTAGCTGCTCGGCCCCAATGTC
GATGGAAAACAGTTTTACTATTCCTTATCTTTTTGGGAAGTCATATGGGTCTTTGTGTGGTTCCTTCTTGAGGTCTTTCTCGAGGTCGGGCAATCAATATCCGGAAGCCT
TCTTGGCAGAAACTGCAGCTCCTTTTTCTAGTAGGGGCATTGCTACGACAAGCTCGATGGAATCAGCTCTACAGGGATCCCCTGCAGTTGATTCTGTTATACCACCTCGC
ATCAAATTTAAGAGGCTTGATAAAACCTCAAGACACATAATGCAGATTTTAGATAAGGAAGCTGTTGAGGAGGTAAAAGCACGAAGAGAAATTCCAGATATAAAGCCAGG
CTATATTGTGCAGCTCAAAGTGGAAGTACCTGAGAACAAGCGACGTATCTCAACATTGAAAGGTATTGTGATAGCCAGACGAAATGCCGGTCTAAACTCAACTTTTAGAA
TAAGGAGGGTAGTTGCTGGTGTTGGGATTGAGTCCCTCTTTCCTCTATACTCACCGAACATAAAAGAGATTAAGGTATTGGAGAAGAAGAAAGTGCGCAGAGCTAAGCTT
TACTATCTTAGGGACAAAATGAACGCGCTTAAGAAGCAGTAGCAAGTTTTCTATTCAATGGGATCAGAAGTGTTTCCGTAACATGGTGCGTTTAAATCCTTTTGAGCGAA
AAATCTCACGAGCTTTCATGATTATTTTATCCTGTTTTATGCATGGAGGATCAGCGTGATAAACTAGTGGAGCTAAAATAAGAATAAACAAAAATGACTTCGCATCGATT
GCCTCGAGAAGAAAATGTTCTTTCTTTTGTATGATTAGTTGCTCAAGCAAACCGTGTCATCATTTATCTTTTTGTTGGTCGGTTGCCGGATTTTGCCCCTTCCTTGAAAT
GCCAAAGAGCTTTCTGTTTATAATGTCTGTGGCTGATGAAATCTTCTTTTTGAACTAAGGATATATTTATTACTTTATCATTAACAGGGTTTCCATTCCTTACAAACCTT
CCCCGTGCTGTTCATTTTAAATAGATGAAGTGTAGGGCTCAGGCTGTAAACTGCATTATTGGTCGGCAAATTTGTTGGACGAGTTGTATAATATTCTTAGCAGCTTATCC
TTGGAGAAAATACCTATCTAGTACTGTGTATCTCTTCATTTAACAATTGTGTAGGACCATAGGTTAAAATAATACAATGTCTAATTCTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQGFRRINQLVRRQIPDANFKLIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENSFTIPYLFGKSYGSLCGSFLRSFSRSGNQYPEAFLAETAAPFSSRGIATTSSMESALQGSPAVDSV
IPPRIKFKRLDKTSRHIMQILDKEAVEEVKARREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRISTLKGIVIARRNAGLNSTFRIRRVVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLEKKKVR
RAKLYYLRDKMNALKKQ