; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy1G030090 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy1G030090
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionMitochondrial fission 1 protein
Genome locationGy14Chr1:28282239..28284205
RNA-Seq ExpressionCsGy1G030090
SyntenyCsGy1G030090
Gene Ontology termsGO:0000266 - mitochondrial fission (biological process)
GO:0000422 - autophagy of mitochondrion (biological process)
GO:0016559 - peroxisome fission (biological process)
GO:0005779 - integral component of peroxisomal membrane (cellular component)
GO:0031307 - integral component of mitochondrial outer membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR016543 - Mitochondria fission 1 protein
IPR028061 - Fis1, C-terminal tetratricopeptide repeat


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056029.1 mitochondrial fission 1 protein A [Cucumis melo var. makuwa]7.69e-54100Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

XP_004139057.1 mitochondrial fission 1 protein A [Cucumis sativus]1.02e-53100Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

XP_008450362.1 PREDICTED: mitochondrial fission 1 protein A [Cucumis melo]1.02e-53100Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

XP_038878443.1 mitochondrial fission 1 protein A-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.69e-5297.78Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AA+SGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQA TLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

XP_038878444.1 mitochondrial fission 1 protein A-like isoform X2 [Benincasa hispida]6.52e-5397.78Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AA+SGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQA TLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M2W6 Mitochondrial fission 1 protein4.95e-54100Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

A0A1S3BNG0 Mitochondrial fission 1 protein4.95e-54100Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

A0A5A7URA7 Mitochondrial fission 1 protein3.72e-54100Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

A0A6J1H8P1 Mitochondrial fission 1 protein1.10e-5092.22Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AA+SGDDSPLKMREKLYLL+VGYFRSGDYSRSR+LVE+CLTIAPDWRQA TLKKSIED+ITKDGVIGIGIAATAVGL+AGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

A0A6J1JKZ6 Mitochondrial fission 1 protein1.10e-5092.22Show/hide
Query:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        AA+SGDDSPLKMREKLYLL+VGYFRSGDYSRSR+LVE+CLTIAPDWRQA TLKKSIED+ITKDGVIGIGIAATAVGL+AGGIAAAVSRKK
Subjt:  AAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5AFF7 Mitochondrial fission 1 protein1.0e-0943.59Show/hide
Query:  REKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        RE LY L++G  + GDY+ ++  VE  L I P+ +QA  L K+I+D+IT +G+IGIGIA  A+ +  G I A V + +
Subjt:  REKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

Q6BLG8 Mitochondrial fission 1 protein4.3e-1146.51Show/hide
Query:  DSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIA--ATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        D P   RE LY LA+G ++ GDYS +    +  L   P+ +QA  LKKSI +++T++G+IGIGIA  A AVG+   GI  A+ RKK
Subjt:  DSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIA--ATAVGLLAGGIAAAVSRKK

Q6CFJ0 Mitochondrial fission 1 protein3.6e-1038.1Show/hide
Query:  DSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK
        D+P + RE LY LA+G ++ G+Y+ +R+  +  L I PD  Q+  L++ IED++ K+G+IGI I    + + A  + A +S+KK
Subjt:  DSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSRKK

Q94CK3 Mitochondrial fission 1 protein B1.2e-2461.29Show/hide
Query:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSR
        I+   A +  D S +K+REKLYLLA+GY+RSGD+SRSR+ +E CL + P+  QA  LKK+IEDRI KDGVIG+GIA TAVG++A GIAAA+ R
Subjt:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSR

Q9M1J1 Mitochondrial fission 1 protein A1.7e-2865.31Show/hide
Query:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAAT---AVGLLAGGIAAAVSRKK
        I+   A++     PL+ REKLYLLAVGY+RSG+YSRSR+LV+ C+ +  DWRQA+ LKK+IED+ITKDGVIGIGI AT   AVGL+AGGI AA+SRKK
Subjt:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAAT---AVGLLAGGIAAAVSRKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G57090.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.2e-2965.31Show/hide
Query:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAAT---AVGLLAGGIAAAVSRKK
        I+   A++     PL+ REKLYLLAVGY+RSG+YSRSR+LV+ C+ +  DWRQA+ LKK+IED+ITKDGVIGIGI AT   AVGL+AGGI AA+SRKK
Subjt:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAAT---AVGLLAGGIAAAVSRKK

AT5G12390.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein8.2e-2661.29Show/hide
Query:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSR
        I+   A +  D S +K+REKLYLLA+GY+RSGD+SRSR+ +E CL + P+  QA  LKK+IEDRI KDGVIG+GIA TAVG++A GIAAA+ R
Subjt:  ISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIAAAVSR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTAGCCTATAGTTTGCTATTTGCTTGTCTGATACTCTTCAATATTTTTCTCCTTTTTCTGTTTATTTCTTATTATGCAGCTGCAATATCTGGTGACGACAGCCCACT
GAAGATGAGAGAGAAGCTGTACCTTCTTGCTGTTGGGTATTTCAGAAGTGGTGATTACTCTAGGAGTAGGGAGCTTGTAGAAGAATGCTTAACAATTGCTCCTGACTGGA
GACAGGCAATGACATTGAAGAAATCAATCGAAGATCGGATCACTAAAGATGGTGTGATCGGCATCGGCATTGCGGCGACTGCTGTAGGACTGCTTGCGGGTGGAATTGCT
GCTGCTGTTTCCAGGAAGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGTATTTCAAGGAACTAGACACCCTTTTTTATTATTATTATTTAGTTTCCAAAATGCGATCTTTCAAAGTTGAATGTTAGCCTATAGTTTGCTATTTGCTTGTCTGATA
CTCTTCAATATTTTTCTCCTTTTTCTGTTTATTTCTTATTATGCAGCTGCAATATCTGGTGACGACAGCCCACTGAAGATGAGAGAGAAGCTGTACCTTCTTGCTGTTGG
GTATTTCAGAAGTGGTGATTACTCTAGGAGTAGGGAGCTTGTAGAAGAATGCTTAACAATTGCTCCTGACTGGAGACAGGCAATGACATTGAAGAAATCAATCGAAGATC
GGATCACTAAAGATGGTGTGATCGGCATCGGCATTGCGGCGACTGCTGTAGGACTGCTTGCGGGTGGAATTGCTGCTGCTGTTTCCAGGAAGAAGTGAGTCCCAATTACT
TGGTTTGTACATAAGAAATCAGTCTGATCAAGCCCAGCTTTAGAGTTTCTATACTTGAGAACTTTGAGACGTAGAACGATGCTATTTAGCTATATTACTAATGTTTGTTC
TGTTATATTGATCTATTTCGTATTGTGCTTTACGTACTTTATCCTGCAATTATAGTTTATTTGAGATTATACACATTCTTTTAAATTGATTTGCACCATTGATGCTATAA
AGCACTGCCCCTCCTAAAATGGCCGAGTGTTTGTTGCTGTCGTACGGCGACCTGCCAACAACTTGTCTATCACCCAAAATAATTTGAGTTTAGTGGGTTTCTTTAGGCGC
TTTGTTTTTTGATGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLAYSLLFACLILFNIFLLFLFISYYAAAISGDDSPLKMREKLYLLAVGYFRSGDYSRSRELVEECLTIAPDWRQAMTLKKSIEDRITKDGVIGIGIAATAVGLLAGGIA
AAVSRKK