; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy1G032110 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy1G032110
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationGy14Chr1:31325287..31330554
RNA-Seq ExpressionCsGy1G032110
SyntenyCsGy1G032110
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
GO:0043531 - ADP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR002182 - NB-ARC
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142576.2 polygalacturonase [Cucumis sativus]1.04e-27398.96Show/hide
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XP_008460791.1 PREDICTED: polygalacturonase-like [Cucumis melo]4.77e-24086.2Show/hide
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XP_023531182.1 polygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.01e-22078.39Show/hide
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        LG SGYWILFIKV+ VSF GG+ID KG +YWAC++S K+CPPGARS+TFNWANNI LSGLTS+NS+Q+H+ INSCNNV+VKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQ
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        SST+VTITG+TI+TGDDCISIGDGTKNLFM+ IKCGPGHGVSIGSLGKE +E GV+NVTL+NAVFTKSDNGVRIKTW  P NGFV+HV+FQNIVM NVKN
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XP_031736043.1 polygalacturonase-like [Cucumis sativus]2.97e-27398.96Show/hide
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XP_038876456.1 polygalacturonase-like [Benincasa hispida]1.47e-23884.86Show/hide
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        ILIDQNYCPN+Q C LQSSGVKI+DVTYK+I+GTSATS+A+TFDCSSS+PCSDI+L+DIKLTYKNK  TSSCKN+ GSSIG++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M0F3 Uncharacterized protein5.03e-27498.96Show/hide
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A0A1S3CD98 polygalacturonase-like2.31e-24086.2Show/hide
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A0A5A7VB33 Polygalacturonase-like2.31e-24086.2Show/hide
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A0A6J1EIK0 polygalacturonase-like7.56e-21877.6Show/hide
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A0A6J1JKS6 polygalacturonase-like5.33e-21877.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22818 Probable polygalacturonase At2g438601.9e-10051.79Show/hide
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        NV+S+GAKPDG  DST++FL AW  AC+S+  +TI VPKGRFL+  + F G  CK   ++  + G++VAP D+R +  S +WI F  V  VS  GG +D 
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Query:  KGTAYWACKNS-PKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGSTIKTGDDCISIGDG
        +GT+ W CKN+   NCP GA+S+ F+ +NNI +SGLTSINSQ+ H+VI++ NNV +  VK+ A + SPNTDGIHV+SS +V IT S I TGDDCISIG G
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Query:  TKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKI
        + N+F+  I+CGPGHG+SIGSLG+   E GV+NVT+ N  F  ++NGVRIKTW   SN F R+++FQ+I M  VKNPI+IDQ+YC  H+ C  Q SGVK+
Subjt:  TKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKI

Query:  NDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT
        ++V Y+ I GTS T  AV  DCS   PC+ I ++D+ L   ++   +SC N  GS+  +V  T
Subjt:  NDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT

O23147 Polygalacturonase ADPG16.9e-7945.53Show/hide
Query:  AANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGR-FLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYWILFIKVDGVSFVGGS
        A+  +V +FGAK DGKTD TQ+F KAW  ACS++  +T  VPKG+ +LL    FRGPCK+   F + GTL A        D  +W++   V+ +S  GGS
Subjt:  AANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGR-FLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYWILFIKVDGVSFVGGS

Query:  ---IDGKGTAYW--ACK-NSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGSTIKTGD
           I+G G  +W  +CK +  K C     ++T     N+ +  L   N+QQ  + I  CN V V NV+I AP  SPNTDGIH+ ++ N+ ++ S I TGD
Subjt:  ---IDGKGTAYW--ACK-NSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGSTIKTGD

Query:  DCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQNYCPNHQSCS
        DCISI DGT+NL + D+ CGPGHG+SIGSLG + ++  V  + +  A F++SDNGVRIKT+   S G  +++ FQNI M NVKNPI+IDQ+YC +   C 
Subjt:  DCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQNYCPNHQSCS

Query:  LQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLVS
         Q S V++ +V YK+I GTSAT  A+T +CS   PC  I LE++K+    K  T+SCKN    + G VS
Subjt:  LQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLVS

P48979 Polygalacturonase8.6e-11453.66Show/hide
Query:  SLVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNK-VTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGY
        SL  I  F +   I++   YNV S GAK DGKTDST++FL AW  AC+S     I VP G F L  + F GPCKN  +TF + GTLVAP DYR +G++  
Subjt:  SLVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNK-VTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGY

Query:  WILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKN-SPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNV
        WI F  V+GV+  GG +DG+GTA WACK    ++CP GA ++ F+ +NNI++SGL S+NSQ  H+VIN   NV ++ V++     SPNTDGIHVQ S+ V
Subjt:  WILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKN-SPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNV

Query:  TITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILID
        TI  S I TGDDC+SIG GT NL++  + CGPGHG+SIGSLGKE  E GV+NVT+    F+ + NG+RIK+W  PS GF R+++FQ+  M+NV+NPI+ID
Subjt:  TITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILID

Query:  QNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT
        Q+YCP+++ C  Q SGV+I+DVTY+ I GTSAT  AV FDCS   PC +IKLED+KLTYKN+   SSC +  G++ G+V  T
Subjt:  QNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT

Q39766 Polygalacturonase5.1e-8244.85Show/hide
Query:  VISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYWILFIKVDGVSFVGGSI-DGKG
        V  FGAK DGKTD ++ FL AW  AC+S T ST+ +PKG +LL+ +   GPCK  +   + GT+ AP D  A  D   W+ F  V+     GG I DG+G
Subjt:  VISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYWILFIKVDGVSFVGGSI-DGKG

Query:  TAYWACKNSPKNCPPGAR---SITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGSTIKTGDDCISIGDG
        +  +  KN+ +N    ++   +I F++  N ++  +TS +S+  H+ + +C N+ ++ +KI APD+SPNTDGIH+  S  V I  S IKTGDDCISIGDG
Subjt:  TAYWACKNSPKNCPPGAR---SITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGSTIKTGDDCISIGDG

Query:  TKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKI
        TKN+ + +I CGPGHG+SIGSLGK  NE  VE + + N   T + NG RIKTWP    G V  + F++I M NV +PILIDQ YCP ++    + S VK+
Subjt:  TKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKI

Query:  NDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKN-KTTTSSCKNIGGSSIG
        +++++K+I GTSA  EA+ F CS SSPC +++L DI + +   +  TS C N+   +IG
Subjt:  NDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKN-KTTTSSCKNIGGSSIG

Q39786 Polygalacturonase7.4e-8143.55Show/hide
Query:  VFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYWIL
        V ++ F    ++ + A   V  FGAK DGKTD ++ FL AW  AC+S T ST+ +PKG +LL+ +   GPCK  +   + GT+ AP D  A  D   W+ 
Subjt:  VFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYWIL

Query:  FIKVDGVSFVGGSI-DGKGTAYWACKNSPKNCPPGAR---SITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNV
        F  V+     GG I DG+G+  +  KN+ +N    ++   +I F++  N ++  +TS +S+  H+ + +C N+ ++ +KI APD+SPNTDGIH+  S  V
Subjt:  FIKVDGVSFVGGSI-DGKGTAYWACKNSPKNCPPGAR---SITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNV

Query:  TITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILID
         I  S IKTGDDCISIGDGTKN+ + +I CGPGHG+SIGSLGK  NE  VE + + N   T + NG RIKTWP    G V  + F++I M NV +PILID
Subjt:  TITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILID

Query:  QNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKN-KTTTSSCKNI
        Q YCP ++    + S VK++++++K+I GTSA  EA+ F CS SSPC +++L DI + +   +  TS C N+
Subjt:  QNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKN-KTTTSSCKNI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05650.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.7e-12857.73Show/hide
Query:  TKS-LVFIVFFHL--FIQISTAAN--YNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRA
        TKS + F + F L  FI +S++A+  +NV+SFGAKPDG TDST +FLKAW  AC S+  +T+ VP G FLL  ITF GPCK+K+TF + GT+VAP DYR 
Subjt:  TKS-LVFIVFFHL--FIQISTAAN--YNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRA

Query:  LGDSGYWILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQ
         G+SG WILF KV+  S VGG+ D +G+ +W+C+ S +NCPPG RSI+FN A ++I+SG+ S+NSQ +H+ +N C NV V+N++++AP  SPNTDG  VQ
Subjt:  LGDSGYWILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQ

Query:  SSTNVTITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKN
         ST VT+TGST++TGDDC++IG GT+N  +S + CGPGHGVSIGSL K+ NE+GVENVT+ ++VFT S NGVRIK+W  PS GFVR+V FQN++M NV+N
Subjt:  SSTNVTITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKN

Query:  PILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTY-KNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT
        PI+IDQNYCP++Q C  + SGVKI  VTYK+I+GTSAT EA+   CS S+PC+ I L+DIKLTY K    TS C N  G ++G++  T
Subjt:  PILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTY-KNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT

AT1G05660.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.6e-13159.32Show/hide
Query:  SLVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYW
        SL+F +   + + IS +  +NV+SFGAKPDG TDST +FLKAW  AC S++ +T+ VPKG FLL  ITF GPCK+K+TF + GT++AP DYR  G+SG+W
Subjt:  SLVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGYW

Query:  ILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTI
        ILF KV+  S VGG+ D +   +W+C+ S +NCPPG RSI+FN A ++I+SG+ S+NSQ TH+ +N C NVVV+NVK++AP  SPNTDG HVQ ST VT 
Subjt:  ILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTI

Query:  TGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQN
        TGST++TGDDC++IG GT+NL ++ + CGPGHGVSIGSL KE  E+GVENVT+ ++VFT S NGVRIK+W  PSNGFVR V FQ++VM NV+NPI+IDQN
Subjt:  TGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQN

Query:  YCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTY-KNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT
        YCP H+ C  + SGVKI+ VTYK+I+GTSAT EA+   CS SSPC+ I L+DIKLTY K    TS C N  G S+G++  T
Subjt:  YCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTY-KNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLT

AT2G43870.1 Pectin lyase-like superfamily protein9.8e-12156.65Show/hide
Query:  LVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRG-PCKNK-VTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGY
        LV  VFF  FI   +A +YNV+SFGAKPDGKTD+T++F+  W +AC+SS   TI VPKGRFLL  +TF G  CK K VTF ++GTLVAP DYR +G+  Y
Subjt:  LVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRG-PCKNK-VTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGY

Query:  WILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVT
        WI F  +DG++  GG +D +G + W CK S KNCP GA +I F  ++N+++SGLTS+NSQ  HVVIN CNNV ++ VK++A   SPNTDGIHVQSS++V+
Subjt:  WILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVT

Query:  ITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQ
        I  + I TGDDC+SIG GT  L++ ++ CGPGHG+SIGSLGK++ E+GV+NVT+    FT +DNGVRIK+W  PS+GF +++ FQ+ VM NV+NPI+IDQ
Subjt:  ITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQ

Query:  NYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIG
        NYCP+H  C  Q SG+KI+DV +  I GTSAT   V  DCSS  PC+ I+LED+KLTY+NK   S+C + GG   G
Subjt:  NYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIG

AT2G43890.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.4e-14661.4Show/hide
Query:  MANPTKSLVFIVFFHLFIQI---STAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDY
        M N     V ++FF  F+ +   + A+NYNV+SFGAKPDG+TDST++FL AW +AC S+   T+ VP+G FLL P+ FRGPC++++TF + GT+VAP DY
Subjt:  MANPTKSLVFIVFFHLFIQI---STAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDY

Query:  RALGDSGYWILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIH
        R LG+SGYWILF+KV+ +S +GG++D +G ++WAC+ S K+CP GARS+TFNWAN++++SGLTSINSQ TH+VINSCNNV+V+ VK++APDQSPNTDG+H
Subjt:  RALGDSGYWILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIH

Query:  VQSSTNVTITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINV
        VQ S  VT+T  T  TGDDCISIG GT+NL+MS + CGPGHG+SIGSLG++ANE GVEN+TLIN+VF+ SDNGVRIKTW   S GFVR+V+FQN++M NV
Subjt:  VQSSTNVTITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINV

Query:  KNPILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLV
        +NPI++DQNYCP++Q C  Q SGVKI+ V Y++I+GTS T +A+TFDCS S+PC  I+L DIKLT+  ++ TS+CKNI G   G+V
Subjt:  KNPILIDQNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLV

AT3G59850.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.3e-12055.7Show/hide
Query:  SLVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRG-PCKNK-VTFLLNGTLVAPLDYRALGDSG
        SL+ ++ F L +  S+A  YN++S+GAKPDGKTDST++F   W  AC+S    TI VPKGRFLL  I F G  CK K VTF + GTLVAP DYR +G   
Subjt:  SLVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRG-PCKNK-VTFLLNGTLVAPLDYRALGDSG

Query:  YWILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNV
        YWILF  +DG+S  GG +D +G + W+CK S KNCP GA SI F  + N+++SGLTS+NSQ  HV IN C+NV +  VK+ A   SPNTDGIHVQSS+ V
Subjt:  YWILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNV

Query:  TITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILID
        +I  S I TGDDC+SIG GT  L++ ++ CGPGHG+SIGSLGKE+ E GV+N+T+  A FT ++NGVRIK+W  PSNGF +++ FQ+ VM NV+NPI+ID
Subjt:  TITGSTIKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILID

Query:  QNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIG
        QNYCP +++C  Q SG+KI+DV +  I GTSAT   V  DCSS  PC+ I+++D+KLTY+NK  T+ C + GGS  G
Subjt:  QNYCPNHQSCSLQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAACCCAACCAAAAGTCTAGTCTTCATCGTCTTCTTCCATTTGTTCATTCAAATCTCAACTGCTGCCAACTACAATGTGATATCATTTGGTGCAAAACCC
GATGGAAAAACGGACTCGACCCAATCATTTCTTAAGGCGTGGACGTCTGCATGTAGCTCCTCCACACGATCCACCATCAACGTCCCTAAGGGAAGGTTCTTGCTC
ACACCCATCACGTTTAGAGGTCCATGTAAGAACAAAGTTACATTTTTGTTGAACGGAACACTTGTTGCACCTCTTGACTATCGTGCCCTTGGAGATTCTGGGTAT
TGGATTTTGTTCATCAAAGTCGATGGAGTTTCTTTCGTCGGTGGCAGTATTGATGGAAAAGGCACTGCCTATTGGGCTTGCAAGAACTCTCCAAAAAACTGTCCT
CCAGGAGCTAGGTCAATAACGTTCAATTGGGCGAACAACATAATACTTAGTGGGTTAACATCAATCAATAGTCAACAAACTCATGTTGTGATCAATAGCTGCAAC
AATGTGGTGGTGAAGAATGTGAAGATAATGGCTCCAGACCAAAGCCCCAATACTGATGGTATTCATGTGCAATCCTCCACTAACGTAACCATCACTGGAAGTACC
ATTAAAACTGGAGATGATTGCATTTCTATTGGTGATGGAACAAAGAATTTGTTTATGAGTGATATCAAATGTGGGCCTGGCCATGGCGTAAGCATCGGAAGCTTA
GGAAAAGAGGCCAACGAAAACGGAGTTGAAAATGTAACATTGATAAATGCAGTGTTCACGAAATCTGATAATGGTGTTAGGATAAAGACATGGCCTACACCTAGC
AATGGTTTCGTTAGACATGTTATCTTTCAAAATATCGTCATGATCAATGTTAAAAATCCTATCTTAATCGATCAAAATTATTGTCCCAACCACCAAAGTTGTTCT
CTCCAGAGTTCTGGAGTGAAGATTAATGATGTGACATACAAAAGTATTGAAGGAACATCCGCAACGTCAGAAGCTGTAACATTTGATTGTAGTTCCAGTAGTCCG
TGCAGTGATATAAAATTGGAAGACATAAAGCTTACGTACAAAAACAAGACAACAACTTCATCATGCAAGAACATTGGTGGATCGAGTATCGGACTTGTGTCTCTC
ACGAAAAAGAGACATGAGCCCAACCTTCAACTCGATACGTTGCAAAGTATGCTTCTAGAGAAAATTGATAGAAAAAAATATTTGCTTGTCATGGATGATTGGACT
AGTCTTAAAGAGTTTCTTATCGATGGAGCTAAGGGAAGTAAAATTTTGATCACAACTCGTACTCATCAAGTTGCACATACTTCTGACACAGTTTTGTTCCATCAT
TTGAGTGAACTAGACAAGGACAATTCTAGGAAGTTGTTTAGAAAAATTGCATTATCCAACGAATCAGAGGTGCTTGAAAATTTAAATTTGGTGGTAATCGGTAAG
GAGATTGTGACAAAAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCAACCCAACCAAAAGTCTAGTCTTCATCGTCTTCTTCCATTTGTTCATTCAAATCTCAACTGCTGCCAACTACAATGTGATATCATTTGGTGCAAAACCC
GATGGAAAAACGGACTCGACCCAATCATTTCTTAAGGCGTGGACGTCTGCATGTAGCTCCTCCACACGATCCACCATCAACGTCCCTAAGGGAAGGTTCTTGCTC
ACACCCATCACGTTTAGAGGTCCATGTAAGAACAAAGTTACATTTTTGTTGAACGGAACACTTGTTGCACCTCTTGACTATCGTGCCCTTGGAGATTCTGGGTAT
TGGATTTTGTTCATCAAAGTCGATGGAGTTTCTTTCGTCGGTGGCAGTATTGATGGAAAAGGCACTGCCTATTGGGCTTGCAAGAACTCTCCAAAAAACTGTCCT
CCAGGAGCTAGGTCAATAACGTTCAATTGGGCGAACAACATAATACTTAGTGGGTTAACATCAATCAATAGTCAACAAACTCATGTTGTGATCAATAGCTGCAAC
AATGTGGTGGTGAAGAATGTGAAGATAATGGCTCCAGACCAAAGCCCCAATACTGATGGTATTCATGTGCAATCCTCCACTAACGTAACCATCACTGGAAGTACC
ATTAAAACTGGAGATGATTGCATTTCTATTGGTGATGGAACAAAGAATTTGTTTATGAGTGATATCAAATGTGGGCCTGGCCATGGCGTAAGCATCGGAAGCTTA
GGAAAAGAGGCCAACGAAAACGGAGTTGAAAATGTAACATTGATAAATGCAGTGTTCACGAAATCTGATAATGGTGTTAGGATAAAGACATGGCCTACACCTAGC
AATGGTTTCGTTAGACATGTTATCTTTCAAAATATCGTCATGATCAATGTTAAAAATCCTATCTTAATCGATCAAAATTATTGTCCCAACCACCAAAGTTGTTCT
CTCCAGAGTTCTGGAGTGAAGATTAATGATGTGACATACAAAAGTATTGAAGGAACATCCGCAACGTCAGAAGCTGTAACATTTGATTGTAGTTCCAGTAGTCCG
TGCAGTGATATAAAATTGGAAGACATAAAGCTTACGTACAAAAACAAGACAACAACTTCATCATGCAAGAACATTGGTGGATCGAGTATCGGACTTGTGTCTCTC
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AGTCTTAAAGAGTTTCTTATCGATGGAGCTAAGGGAAGTAAAATTTTGATCACAACTCGTACTCATCAAGTTGCACATACTTCTGACACAGTTTTGTTCCATCAT
TTGAGTGAACTAGACAAGGACAATTCTAGGAAGTTGTTTAGAAAAATTGCATTATCCAACGAATCAGAGGTGCTTGAAAATTTAAATTTGGTGGTAATCGGTAAG
GAGATTGTGACAAAAGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MANPTKSLVFIVFFHLFIQISTAANYNVISFGAKPDGKTDSTQSFLKAWTSACSSSTRSTINVPKGRFLLTPITFRGPCKNKVTFLLNGTLVAPLDYRALGDSGY
WILFIKVDGVSFVGGSIDGKGTAYWACKNSPKNCPPGARSITFNWANNIILSGLTSINSQQTHVVINSCNNVVVKNVKIMAPDQSPNTDGIHVQSSTNVTITGST
IKTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEANENGVENVTLINAVFTKSDNGVRIKTWPTPSNGFVRHVIFQNIVMINVKNPILIDQNYCPNHQSCS
LQSSGVKINDVTYKSIEGTSATSEAVTFDCSSSSPCSDIKLEDIKLTYKNKTTTSSCKNIGGSSIGLVSLTKKRHEPNLQLDTLQSMLLEKIDRKKYLLVMDDWT
SLKEFLIDGAKGSKILITTRTHQVAHTSDTVLFHHLSELDKDNSRKLFRKIALSNESEVLENLNLVVIGKEIVTKV