; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G001780 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G001780
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionDUF4050 family protein
Genome locationGy14Chr2:1213123..1216698
RNA-Seq ExpressionCsGy2G001780
SyntenyCsGy2G001780
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025124 - Domain of unknown function DUF4050


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022999179.1 uncharacterized protein LOC111493640 [Cucurbita maxima]9.49e-9782.61Show/hide
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XP_038889429.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X1 [Benincasa hispida]7.31e-11092.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFZ6 Uncharacterized protein4.14e-118100Show/hide
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A0A1S3CQL1 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X29.78e-11798.76Show/hide
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A0A1S4E5A2 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X16.95e-11494.64Show/hide
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A0A6J1G589 uncharacterized protein LOC1114508503.10e-9581.99Show/hide
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A0A6J1KGB3 uncharacterized protein LOC1114936404.60e-9782.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15350.1 unknown protein5.4e-2042.06Show/hide
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        + PS+SEDFWSTST D+D  +T  S+ +  +S++N   +      N +   ++VN G +LW QTR RWVG   P      N    L+W   T + LL + 
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        K + + IPL++MVDFLV+ WE+EGLY
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AT1G15350.2 unknown protein5.4e-2042.06Show/hide
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AT4G32342.1 unknown protein1.0e-1840.83Show/hide
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        S+DFWSTSTCD+D  +T+QS+ ++       ++         SN ++FVNHG +LW  TR +W   C+  ++        +SW  T + LL T K + + 
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        IPL +MV FLV+ WEEEGLY
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AT5G25360.1 unknown protein2.3e-2642.07Show/hide
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        WI +L  C+G       KP   ++      G  +  R+   PS+SEDFWSTSTC++D       R  S IS TN+ S       + SN ++FVNHG  LW
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         QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL +MVDFLV+ WE+EGLY
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AT5G25360.2 unknown protein2.3e-2642.07Show/hide
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        WI +L  C+G       KP   ++      G  +  R+   PS+SEDFWSTSTC++D       R  S IS TN+ S       + SN ++FVNHG  LW
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Query:  TQTRLRWVGNCVPAKRTKKNHITGLSWYMTKELLLETRKPYHRRIPLSDMVDFLVEEWEEEGLY
         QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL +MVDFLV+ WE+EGLY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGACCCGAGAGAGCTGGTTTTCTGTTTGGATCGATCGACTTCTCTCTTGTTTAGGGAGCATTAAACCTGCACCTGCCATCTCTGGAAATAATCTGAACTCTAGGAT
GCCAAGCATGTCAGAAGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTGGATGAGCTGCTTACGCTTCAATCTCGACAGAATTCATTTATCAGCACAACAAACCATAACTCTA
ACCATGGTGGTGTCATTGACAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGTCTTCGGTGGGTCGGAAATTGTGTGCCTGCT
AAACGAACTAAAAAAAATCACATTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAGCCTTACCATCGACGCATACCTTTATCGGACATGGT
AGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTTAATATTAACTACTAATTAACGGTACGAAATTACTGATTATCAATTGGATCTGTTAAAACTTTCAATGCAAGTCACAATCACAATAATTTCCTATCCAATCCTTCCT
TGTTTATCCGATTCTATCAGAAATTAGGGTTTTTGATTCGATTCCCATTTTCCCTTTCGATTTCGGTATGTTTCTGCGTTTTGATGTTTGTAATCTGATTTTTCGCCGAA
TATGGTGACCCGAGAGAGCTGGTTTTCTGTTTGGATCGATCGACTTCTCTCTTGTTTAGGGAGCATTAAACCTGCACCTGCCATCTCTGGAAATAATCTGAACTCTAGGA
TGCCAAGCATGTCAGAAGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTGGATGAGCTGCTTACGCTTCAATCTCGACAGAATTCATTTATCAGCACAACAAACCATAACTCT
AACCATGGTGGTGTCATTGACAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGTCTTCGGTGGGTCGGAAATTGTGTGCCTGC
TAAACGAACTAAAAAAAATCACATTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAGCCTTACCATCGACGCATACCTTTATCGGACATGG
TAGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAAGCCAGTCAATTTAAAAAACAATCACCTTGTGCATACACTATCCTTGTGACTTTTTTCTTTCGC
GTTTTGGAGTTCAATTCCGTGCCTACCACCTTAACTTGGGATCAGTTCGATACAAGTTTAACATACAAAATGACACCATTGGTTTGCTAACCTTTTCGATATTGCTACAA
TGGAGATCTCTAAGGGGAGGGGCCAATTGTGAAGTAACCCAAAATCAAAGATCTTCCAATTGATCGGCGGGCTAAATGGTAAGCCCCCTCCGACCAATATACTTTATACA
TACATATCAAACTTTCTTCATCATTAGTTTAATATATGAAGAAGCATCAACTTTGCAGTGTGTTTGATGCAATGTTGTTGATGACTGACTTGTTGTAATTGTAATTAATC
TCTCTAAAACAAACTCTTCTTTGTTTGGAATTCCTGATAAAAGTATCGAGATTGATTTTGTGGTGATATTGCTGTCAAATGTGTTGGATGGTAGAGAGAACAGATAATAG
ACAAAATCAAGCCTCCACTGTCTTTTTGTCTGGTGGTTGTGCCATTAAAAAGACTATAAATTTTGAAGGGTTCATGGTTGAAGATGCAAAGATGCCTTTTCAAAATCTTT
TTCACAAGAGAATAGTCACTATTTTAAGGATATGGACCCTACTTTTTGATTAGAAATTTTATCTCCCATTCTGATAATAGAGAATCTAGGTAGGAAGAAATGGAATAATT
TCTTTTTGTTGGCATCAGTGATAATGATCACTAGGAATGTGAACTTGCTGAGTCACAATGAGAGAGAGAAGATGTTTTTTGATTTGATTTTCAATAGTTGATAGATATAT
ATAATATGTGTTGGGATGGATATGTCTTTTAAAAGAAAATACGAAGAATTTGTTAGCCACTTCAAATTCAAGTTTAAACATTGCTTGTCTTGATAATACAACTCATCAAA
TGTGTTTGAAACCGTTAATACCTCGGTGTGAAAATATTTCTAAATGTTCAAAAGTTGCATTAATACTCTCATCTTCTCCAGTCGATGACTTAACAATTATCTATTCAAAC
CTTTTTATCTATTTGTTAGTTCTTTGACCTTTTGTATCTCATCAAAAAAAATTGTACGTGTATAATAATAGTCAAATATGGTATTTGGTAATTTTTCATTTTTTTTATAG
GTTTTTAATGGAAGATTTTGATTTTGAAATTGTTTGAGATACTGTGTATTAACTTGAGGTGTCGAGCATATTTTGTCGTGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVTRESWFSVWIDRLLSCLGSIKPAPAISGNNLNSRMPSMSEDFWSTSTCDLDELLTLQSRQNSFISTTNHNSNHGGVIDNLSNHSDFVNHGFVLWTQTRLRWVGNCVPA
KRTKKNHITGLSWYMTKELLLETRKPYHRRIPLSDMVDFLVEEWEEEGLYY