; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G002530 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G002530
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationGy14Chr2:1693177..1693785
RNA-Seq ExpressionCsGy2G002530
SyntenyCsGy2G002530
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063558.1 putative serine-rich protein C215.13-like protein [Cucumis melo var. makuwa]1.13e-12699Show/hide
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KAG6586344.1 hypothetical protein SDJN03_19077, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.13e-10386.07Show/hide
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XP_016902457.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496492 [Cucumis melo]6.55e-12698.51Show/hide
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XP_031737100.1 uncharacterized protein LOC101209679 [Cucumis sativus]7.08e-12899.5Show/hide
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XP_038890503.1 uncharacterized protein LOC120080038 [Benincasa hispida]1.98e-11391.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL69 Uncharacterized protein3.43e-12899.5Show/hide
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A0A1S4E2K6 uncharacterized protein LOC1034964923.17e-12698.51Show/hide
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A0A5A7V7K3 Putative serine-rich protein C215.13-like protein5.48e-12799Show/hide
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A0A6J1FCB9 uncharacterized protein LOC1114441078.91e-10385.57Show/hide
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A0A6J1HLP3 uncharacterized protein LOC1114656734.42e-10386.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein1.6e-0550Show/hide
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related1.2e-4052.47Show/hide
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          +RR  ++P+ SRLSIM+KADE
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related5.6e-1434.91Show/hide
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                 TKR C+CSPTTHPGSFRCS H+ +  +     + S                 LN R+ A+ NSL +IG VE +  +R+LAA L +PSS   
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related3.1e-4151.15Show/hide
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        +VSS++    +++      ++R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ +RR 
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related3.1e-4151.15Show/hide
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        T+R + ++ LRS SPSGRF G         + SSS FASSTS+  S  +T+FF           RS SP+RVNL  S  ++  S R+S+D R+ SPNRS+
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        +VSS++    +++      ++R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ +RR 
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGTCTTCATAAAGGTATAATTTCGCAACCTCCTGCTCTGTACTCGCCGAGTAGGTTGAATGCTCGTAGATCGGC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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