; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G002930 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G002930
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionHistone H1-like
Genome locationGy14Chr2:1938681..1940050
RNA-Seq ExpressionCsGy2G002930
SyntenyCsGy2G002930
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063593.1 histone H1-like [Cucumis melo var. makuwa]1.41e-13092.51Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.25e-11485.82Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAA   PV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPKAVAKPK    AKSK VAKPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_004139246.1 histone H1 [Cucumis sativus]3.89e-14699.62Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
        HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAA PVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA

Query:  EKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_008456174.1 PREDICTED: histone H1-like [Cucumis melo]2.33e-12992.13Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAK KPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata]6.43e-11485.45Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAA   PV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPKAVAKPK  + AKSK VAKPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLA4 H15 domain-containing protein9.29e-12891.25Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
        HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAA PVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA

Query:  EKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKKVAPKPKPAAKAAKVA                      AKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A1S3C278 histone H1-like1.13e-12992.13Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAK KPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A5D3D4H1 Histone H1-like6.84e-13192.51Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1G2W2 histone H1-like3.11e-11485.45Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAA   PV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPKAVAKPK  + AKSK VAKPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1KEC3 histone H1-like3.42e-11183.96Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  A VA P ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAA   PV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPK VAKPK    AKSK V KPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSR SPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H12.8e-3150.19Show/hide
Query:  VAQPAENDSKAKKAAASKASKAK--KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVK
        + +P   + +  KA   K  KAK  KP  A K R+  +HP + +MI +AIVSLKE+ GSSQYAI KF EEK KQLP+NF+KLLL +LKK VA+ KL+KVK
Subjt:  VAQPAENDSKAKKAAASKASKAK--KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVK

Query:  NSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS-KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KTVAKPKT-AAKTKAAEKVKKVA
         S+KL +A                AKKP  +K KA   K AA AKS KAK AAKPK KAV KPK  + AK+      K  AKPKT AAKTK      K  
Subjt:  NSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS-KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KTVAKPKT-AAKTKAAEKVKKVA

Query:  PKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
         KPK   K AKVAKT  +T+PGK+ A   K  AKKV  K  K K+VKSP +KV  ++
Subjt:  PKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK

P23444 Histone H14.4e-3252.08Show/hide
Query:  ADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLK
        A  V  + AP    A  A  D+ A  AA + A+KAKK +  KK R+SPTH P+ +M+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK +LP NFRKLL V LK
Subjt:  ADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLK

Query:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAE
        KLVA  KL KVKNSYKL SA     K  AA   P T  K           K  A AK KAKT AK KP    KP  KPK V K KT AKPK  AK  A  
Subjt:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAE

Query:  KVKKVAPKPKPAAK---AAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K K    KPKP AK    AK AKT ++ +PGK+ APA KA    +KK  T   P RK  +RK KK
Subjt:  KVKKVAPKPKPAAK---AAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P26569 Histone H1.25.2e-3349.82Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS     AA   P    KK  +   K      AAVA +KAK AA    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAAK 
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT

Query:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K     A  K K VA KPK   + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P37218 Histone H17.0e-3850.72Show/hide
Query:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE
        + +  AA      E +  AK   A K +KAKKP+  +K  ++PTHPP+ +MI +AIV+LKERTGSSQ+AITKF EEK K LPSNF+KLLL  LKK VA+E
Subjt:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE

Query:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAK---------------KPVSSKLKAASIKKAAVAK--SKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK
        KLVKVKNSYKLPS     A A  A   P  AK               KP +    AA  K AA AK  +KAK AAK KP A AKP  K   K+   AKPK
Subjt:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAK---------------KPVSSKLKAASIKKAAVAK--SKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK

Query:  TAAKTKAAEKVKKVAPKPKPAAK--AAKVAKTLSRTSPGKRAAP-ATKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
         A K KAA    K A KP   AK   AKVAKT +RT+P ++AAP AT AKK   KK   K VKSPA+K   ++ +K
Subjt:  TAAKTKAAEKVKKVAPKPKPAAK--AAKVAKTLSRTSPGKRAAP-ATKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK

Q9M5W4 Histone H13.6e-3455.34Show/hide
Query:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAK---KAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPT--HPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLK
        ++D P +A   P   + K+K   KAAA K  K KK    AKK +S  T  HP F +MIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHKQLPSNFRKLLL HLK
Subjt:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAK---KAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPT--HPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLK

Query:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKV
        KLVA+ KLVKVKNS+KLPSAR        AA  P  AKKP   K K A+  K       AK  AKPK K  AK   KT A +KTVAK   AAK KA    
Subjt:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKV

Query:  KKVAPKPKP-AAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARK
         K A KPK  AAK AKVAKT +  SPGK+       K V  KK KTVKSPA K
Subjt:  KKVAPKPKP-AAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein5.5e-3047.94Show/hide
Query:  SDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE
        +DAP    A   +  +K +K    K  K KK  + A K R+  +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP  FRKLLL++LK+LVA+ 
Subjt:  SDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE

Query:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTKAAEKVKKV
        KLVKVK S+KLPSA      +A A++P   A+K   +K K A++   AV K+K K AA  K K     KPKT A  K  AK K       T AA K K V
Subjt:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTKAAEKVKKV

Query:  APKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK
          KPK  A+ AK AKT   TSP K+A  ATK        KK   K   KPKTVKSPA++  +R VKK
Subjt:  APKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G18050.1 histone H1-37.0e-0936.84Show/hide
Query:  KKPSGAKKAR--SSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAP
        KK   AKK R   + THPP+ QMI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +          
Subjt:  KKPSGAKKAR--SSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAP

Query:  PVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA
         +T ++   +K K    +   + K    ++ +PK K V+  K +   K K   +PK+   +   +K  K +
Subjt:  PVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA

AT2G18050.2 histone H1-31.8e-0434.9Show/hide
Query:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAV
        MI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +           +T ++   +K K    +   +
Subjt:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAV

Query:  AKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA
         K    ++ +PK K V+  K +   K K   +PK+   +   +K  K +
Subjt:  AKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein3.7e-3449.82Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS     AA   P    KK  +   K      AAVA +KAK AA    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAAK 
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT

Query:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K     A  K K VA KPK   + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein2.1e-2147.03Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS    A    A PV  K  V +K KA+  + +       K AA  K  AV K  P   AKS  V  P   A T+ A
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA

Query:  EK
        +K
Subjt:  EK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCCGCCGCTGATTCCGTCATCATCTCCGATGCTCCCGCTGCAGCGGTGGCCCAGCCAGCTGAGAACGACTCCAAGGCTAAGAAAGCTGCGGCATCGAAAGCATC
GAAGGCTAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCTAGATCTTCTCCGACTCACCCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCGTTTCTCTGAAGGAGAGAACCGGCT
CGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCACTGAAGAGAAACACAAACAATTGCCTTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTTGTTCATCTCAAAAAACTTGTCGCCGCTGAAAAA
CTCGTTAAGGTTAAGAACTCCTATAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTATTCAAGCAAAAGCCGCAGCAGCAGCAGCACCACCAGTCACCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAA
ACTCAAAGCAGCAAGCATCAAGAAAGCCGCCGTTGCCAAATCGAAAGCCAAAACTGCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTTGCTA
AATCCAAGACCGTCGCGAAACCAAAAACCGCCGCGAAGACGAAGGCAGCTGAGAAGGTTAAGAAGGTTGCCCCGAAGCCTAAACCAGCAGCCAAGGCAGCGAAAGTAGCG
AAAACACTGTCGCGAACTTCGCCAGGAAAGAGAGCCGCACCGGCGACAAAGGCGAAGAAAGTAGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGTCCA
GGCAAGGAAAGTCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTCTCTCTCTAAAATATTTTCCTCTCCCTCTCTTCTAATCGATTCCATTTCCAATAATGTCTTCCGCCGCTGATTCCGTCATCATCTCCGATGCTCCCGCTGCAGCGG
TGGCCCAGCCAGCTGAGAACGACTCCAAGGCTAAGAAAGCTGCGGCATCGAAAGCATCGAAGGCTAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCTAGATCTTCTCCGACTCAC
CCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCGTTTCTCTGAAGGAGAGAACCGGCTCGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCACTGAAGAGAAACACAAACAATTGCC
TTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTTGTTCATCTCAAAAAACTTGTCGCCGCTGAAAAACTCGTTAAGGTTAAGAACTCCTATAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTATTCAAG
CAAAAGCCGCAGCAGCAGCAGCACCACCAGTCACCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAAACTCAAAGCAGCAAGCATCAAGAAAGCCGCCGTTGCCAAATCGAAAGCCAAA
ACTGCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTTGCTAAATCCAAGACCGTCGCGAAACCAAAAACCGCCGCGAAGACGAAGGCAGCTGA
GAAGGTTAAGAAGGTTGCCCCGAAGCCTAAACCAGCAGCCAAGGCAGCGAAAGTAGCGAAAACACTGTCGCGAACTTCGCCAGGAAAGAGAGCCGCACCGGCGACAAAGG
CGAAGAAAGTAGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGTCCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGAATTATGTGTTTAGGGTTTTTGATTAATTTC
TAGGGTTTTCTTATTAATAGTACGTAGCGATGTAAATTAGGGATATGATATGAGAGATGCAACCGTTCGTTGTTATACAATATTTTTATCAAATTTTAGTTTGGTAAATT
CTCAATGGTCTATCTTCAAATCAGTCTTTTCTTTTGAGTGAATTGAATGATCATCTCTTTGCTTCTGGTTTATCGTTAAAGCTTTTTGAGTTTTGCTTCAATGGCGGATT
TCCCGTAATTAAAAGCGTCGTTTTGGTCGTTTATGTACATAAAACGCAAATTTCATAATCAGAACAGTTCACGTGCGTTGCACGCGATTTCGAACCCACGTCGGCACCAC
GTGGCTAATTTTTTGGAACTTCTGATTAAACTTTAATTATTTATTAATTTTGGGTTTCGGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEK
LVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAPPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVA
KTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK