; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G004400 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G004400
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationGy14Chr2:3058270..3058635
RNA-Seq ExpressionCsGy2G004400
SyntenyCsGy2G004400
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048028.1 Rapid ALkalinization Factor [Cucumis melo var. makuwa]4.06e-8196.69Show/hide
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KGN60987.2 hypothetical protein Csa_021272 [Cucumis sativus]3.25e-82100Show/hide
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XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]4.56e-7891.74Show/hide
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XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]2.64e-7790.91Show/hide
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XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]4.06e-8195.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein4.28e-85100Show/hide
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A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor1.96e-8196.69Show/hide
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A0A6J1DA82 protein RALF-like 331.14e-7387.6Show/hide
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A0A6J1FH12 protein RALF-like 332.21e-7891.74Show/hide
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A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.28e-7790.91Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 335.0e-3169.7Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor3.6e-2958.97Show/hide
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        P+  ++C  +   F        A  G   +  W+ P +S   CKGSI EC    EEFE DSE NRRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGA
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.4e-2866.32Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 221.5e-2756.03Show/hide
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        N+   + + A + ++ S   +T   G  +    A   +  S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GA
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        QANPYSRGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.5e-3062.07Show/hide
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        T FL    + ++F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.0e-3162.07Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 194.2e-1755.42Show/hide
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        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+NNVPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGC+ IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 221.1e-2856.03Show/hide
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        N+   + + A + ++ S   +T   G  +    A   +  S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GA
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        QANPYSRGC+ ITRCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 239.7e-3066.32Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 333.6e-3269.7Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAGTCTTGCATGGATTCCTAATCAATCTACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGGGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCAA
CTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTACGAAGGAACAACGTGCCGTGCTCAAGACGTGGTGCATCTTATTACAATTGTCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGC
CGTGGATGCAACGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTCTTATCTTCAGCTGTTCCTCAACCACCGTCCACGCCGGTCTAGGGATCCAACA
CAGTCTTGCATGGATTCCTAATCAATCTACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGGGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCAA
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CGTGGATGCAACGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMAGFNSPTFFLICAAVFLIFSCSSTTVHAGLGIQHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNNVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
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