; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G004550 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G004550
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionF-box protein PP2-B13-like
Genome locationGy14Chr2:3146032..3147935
RNA-Seq ExpressionCsGy2G004550
SyntenyCsGy2G004550
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYJ96495.1 F-box protein PP2-B13-like [Cucumis melo var. makuwa]4.11e-18386.18Show/hide
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XP_011648846.2 F-box protein PP2-B15 [Cucumis sativus]1.16e-21598.68Show/hide
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XP_038890670.1 F-box protein PP2-B13-like [Benincasa hispida]8.23e-15070.97Show/hide
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        IQ IQ+RPK+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJT8 F-box domain-containing protein1.61e-21598.35Show/hide
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A0A0A0LLX5 F-box domain-containing protein4.42e-21397.03Show/hide
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A0A1S3BXK2 F-box protein PP2-B13-like6.94e-18486.51Show/hide
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A0A5A7U3A9 F-box protein PP2-B13-like6.94e-18486.51Show/hide
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A0A5D3BDF0 F-box protein PP2-B13-like1.99e-18386.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80494 F-box protein PP2-B153.1e-5842Show/hide
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        +LPE CV+ ILS TTP+D    A VSS+FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S    +    SK+E +  LC  IL+D G K F++EKLSGK+ Y+LS+
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        R+LSITWS     W+W     S F E V+L    WLEI GKI+T  LSPNT YGAYL+ K++ RAYGL+L+PA+ S+++                N E  
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Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERAT--KFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFT----TQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK
        +   +     N +  +E + YG R +R    + +++H +  E      R+DGW+E+ELGEF T      +D+++ MS  E +G+QLK G+ I GI++RPK
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Q3E6P4 F-box protein At2g022402.9e-5139Show/hide
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        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   A VS  F SA  SD VW +FLP  YE +V+ S +       SK+E +F LC +P+L+++G KSF LEK SGK
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Query:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNN
           MLS++EL ITW S P  W W S P+S F ++ EL  V W EI GK   ++LSP T+Y AY++FK  +R  GL  +P ++ L L              
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Query:  HNNSEAYVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRP
          +S+ +++                   G R  R  +      + ++    + REDGW+E ELGEFF  +   ++  S +E +    KSGL+IQGI+ RP
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Q9C7J9 F-box protein PP2-B133.3e-5541.16Show/hide
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        +LPE CV+ IL+ T+P+DA   + VSS+FR A +SD VW +FLP +Y+ +++ S    +    SK+E +  LC  +L+D   K F++ K SGK+ Y+LSA
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        R++SIT+S      +W +   S F E  EL T   LEI GKI+T +LSPNTKYGAYL+ K++  AYGL+L+PA+ S++          S N  +N +  Y
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        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGWLE+ELGEF T +  D +++MS  E +G+QLK G++I GI++RP
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Q9C7K0 F-box protein VBF8.0e-5440Show/hide
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        R++SIT S     W+W +   S F E  EL     LEI GKI+T++LS NT+YGAYL+ K+++ AYGL+L+PA+ S++          S N   + S  Y
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Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK
        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGW+E+ELGEF T +  D +++M+  E +G+QLK G+LI GI++RPK
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Q9FLU7 Putative F-box protein PP2-B123.6e-4636.61Show/hide
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        LPE+C++ ++S T+P DA +++ VS + RSAA+S+  W RFLP +Y   +            S ++ F R C SP+L+++G  SF +EK SGK  +MLSA
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Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEA
        R+L I W   P  W W S P S F EV  L  V W EI GKI T +LS  T Y AYL+FK  E  ++G E +P ++S +                     
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEA

Query:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK
                       +  + +Y NRR     F+++  Q         REDGWLE+ELGE++   +D+++ MS +ET     K G+++QGI+IRPK
Subjt:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09155.1 phloem protein 2-B152.2e-5942Show/hide
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        +LPE CV+ ILS TTP+D    A VSS+FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S    +    SK+E +  LC  IL+D G K F++EKLSGK+ Y+LS+
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEAY
        R+LSITWS     W+W     S F E V+L    WLEI GKI+T  LSPNT YGAYL+ K++ RAYGL+L+PA+ S+++                N E  
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEAY

Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERAT--KFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFT----TQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK
        +   +     N +  +E + YG R +R    + +++H +  E      R+DGW+E+ELGEF T      +D+++ MS  E +G+QLK G+ I GI++RPK
Subjt:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERAT--KFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFT----TQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK

AT1G56240.1 phloem protein 2-B132.3e-5641.16Show/hide
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        +LPE CV+ IL+ T+P+DA   + VSS+FR A +SD VW +FLP +Y+ +++ S    +    SK+E +  LC  +L+D   K F++ K SGK+ Y+LSA
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEAY
        R++SIT+S      +W +   S F E  EL T   LEI GKI+T +LSPNTKYGAYL+ K++  AYGL+L+PA+ S++          S N  +N +  Y
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEAY

Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRP
        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGWLE+ELGEF T +  D +++MS  E +G+QLK G++I GI++RP
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AT1G56250.1 phloem protein 2-B145.7e-5540Show/hide
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        +LPE C++ IL+ T+P+DA   + VSS+FR A +SD VW +FLP +Y+ +++ S       + SK+E +  LC  +L+D   K F++ K SGK+ Y+LSA
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEAY
        R++SIT S     W+W +   S F E  EL     LEI GKI+T++LS NT+YGAYL+ K+++ AYGL+L+PA+ S++          S N   + S  Y
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEAY

Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK
        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGW+E+ELGEF T +  D +++M+  E +G+QLK G+LI GI++RPK
Subjt:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK

AT2G02240.1 F-box family protein2.0e-5239Show/hide
Query:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK
        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   A VS  F SA  SD VW +FLP  YE +V+ S +       SK+E +F LC +P+L+++G KSF LEK SGK
Subjt:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK

Query:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNN
           MLS++EL ITW S P  W W S P+S F ++ EL  V W EI GK   ++LSP T+Y AY++FK  +R  GL  +P ++ L L              
Subjt:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNN

Query:  HNNSEAYVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRP
          +S+ +++                   G R  R  +      + ++    + REDGW+E ELGEFF  +   ++  S +E +    KSGL+IQGI+ RP
Subjt:  HNNSEAYVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRP

AT5G24560.1 phloem protein 2-B122.6e-4736.61Show/hide
Query:  LPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA
        LPE+C++ ++S T+P DA +++ VS + RSAA+S+  W RFLP +Y   +            S ++ F R C SP+L+++G  SF +EK SGK  +MLSA
Subjt:  LPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEA
        R+L I W   P  W W S P S F EV  L  V W EI GKI T +LS  T Y AYL+FK  E  ++G E +P ++S +                     
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEA

Query:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK
                       +  + +Y NRR     F+++  Q         REDGWLE+ELGE++   +D+++ MS +ET     K G+++QGI+IRPK
Subjt:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACAACTCCCTCCGACGCCGGGAAATTGGCCCTCGTGTCGTCCATGTT
TCGGTCCGCGGCGGAATCCGACGTAGTTTGGGGGAGATTTTTGCCGGAAAACTACGAGGAAATTGTGGCAGCGTCTGAAATGTCCGGTAAGGCTCCGTTGAGATCGAAGA
GAGAGGCTTTCTTCAGACTGTGCTCTCCGATCCTTGTGGACGAGGGTACAAAGAGTTTTGAATTGGAGAAGTTATCAGGGAAGGTTATATATATGTTATCAGCAAGGGAA
TTGAGTATCACATGGAGTTCTGATCCTCTTTGTTGGACTTGGAAATCTCATCCTCAATCAACATTCCCAGAAGTGGTGGAGCTAAGAACAGTGAGTTGGTTAGAGATTAA
TGGGAAAATAAGAACCAAAATGCTATCTCCAAACACAAAATATGGAGCTTATCTTCTGTTCAAGATTTCAGAGAGAGCTTATGGATTAGAATTGATGCCTGCTCAACTTT
CTCTTCAATTATTCCCAATTAATCAACCAAACACAAACAGTTCTAATAATAATCATAATAATTCAGAAGCCTACGTTTGGCTGCACCATAAACATCATGATCAAAATAAC
CAAAGTAATTTGGAGTCTTTGTTATATGGTAATAGAAGGGAAAGAGCCACTAAATTCATACAGAATCATCTTCAGAATAAGGAATTTAGGGTTTTGAATCACAGAGAAGA
TGGGTGGTTGGAGGTCGAACTGGGTGAATTTTTCACAACACAAAATGACCAACAACTCCATATGAGTTTCATGGAAACAGAAGGCTTTCAACTCAAATCTGGTCTTCTTA
TTCAAGGCATTCAAATCAGACCTAAACATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGTAGATAAAAAAAAAAAAGGAAAACAATGGGTATTAATCTCAACATACTTAAACGTTTAATTAAAGACTAAACCAGCGGCTTTAAAATACTCTAAACAAATTAGGAGAA
AGAGAAAGTGTTTGTATATAAAACCCCATCTCCCAATTTCCATTTCTTTCAAACCCCACTCGGCACTCACTTCAAGAGAGGAAATTCGGTGAGAAACAGAGAAAGGGAGA
GATTTATATTTTCATATTTTTGTTTGTGTGTAAAATGGCCGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACAACTCCCTCCG
ACGCCGGGAAATTGGCCCTCGTGTCGTCCATGTTTCGGTCCGCGGCGGAATCCGACGTAGTTTGGGGGAGATTTTTGCCGGAAAACTACGAGGAAATTGTGGCAGCGTCT
GAAATGTCCGGTAAGGCTCCGTTGAGATCGAAGAGAGAGGCTTTCTTCAGACTGTGCTCTCCGATCCTTGTGGACGAGGGTACAAAGAGTTTTGAATTGGAGAAGTTATC
AGGGAAGGTTATATATATGTTATCAGCAAGGGAATTGAGTATCACATGGAGTTCTGATCCTCTTTGTTGGACTTGGAAATCTCATCCTCAATCAACATTCCCAGAAGTGG
TGGAGCTAAGAACAGTGAGTTGGTTAGAGATTAATGGGAAAATAAGAACCAAAATGCTATCTCCAAACACAAAATATGGAGCTTATCTTCTGTTCAAGATTTCAGAGAGA
GCTTATGGATTAGAATTGATGCCTGCTCAACTTTCTCTTCAATTATTCCCAATTAATCAACCAAACACAAACAGTTCTAATAATAATCATAATAATTCAGAAGCCTACGT
TTGGCTGCACCATAAACATCATGATCAAAATAACCAAAGTAATTTGGAGTCTTTGTTATATGGTAATAGAAGGGAAAGAGCCACTAAATTCATACAGAATCATCTTCAGA
ATAAGGAATTTAGGGTTTTGAATCACAGAGAAGATGGGTGGTTGGAGGTCGAACTGGGTGAATTTTTCACAACACAAAATGACCAACAACTCCATATGAGTTTCATGGAA
ACAGAAGGCTTTCAACTCAAATCTGGTCTTCTTATTCAAGGCATTCAAATCAGACCTAAACATTGAGACGAACTCAATTTCCAATCATAAATTACCTTTCTCTCTACAAT
TTGTTGATTTGAAAAAGAAAACAACAAATAATTGTTTGATTATTGATTATTTTATTCGTTAACTAAAATCTACGACCTTGTAATTGAGTTGCTAACGATTTGATACGATC
TGATCTATTTACAATTATGTCTGAAATATGATCAACATTTTTTTTTCTTCTATTTTTATTATTGTAGATTTCAATTGAATGTAATGTAAAAGATAAACACTAAATATATT
GTTGTGTTTACTAATCTAGAAAGTTGGATGGATGATGAATATATGATTTGAAAAGTCTGATGTGAGAGAAATGAAATATGATATAGTCTATTTAGTCAATCATTTGAAAA
TAACATTGGTTAAACTAAGTTAAGCTGAGGTAGGTGTTATGTATATGAGGTTGATGTAGACAATAAAATCATAAAATCTATAGTATTTAATCTAAATATGATGTCAACGT
GTGATATAGTCTTCACTAGATAAACGTGCTCACCCTTTTAGTGTTTCTCTTCTATATATGAAAATAGATATCGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSARE
LSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKMLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNSSNNNHNNSEAYVWLHHKHHDQNN
QSNLESLLYGNRRERATKFIQNHLQNKEFRVLNHREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETEGFQLKSGLLIQGIQIRPKH