; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G006180 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G006180
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description40S ribosomal protein S8
Genome locationGy14Chr2:4529245..4531756
RNA-Seq ExpressionCsGy2G006180
SyntenyCsGy2G006180
Gene Ontology termsGO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001047 - Ribosomal protein S8e
IPR018283 - Ribosomal protein S8e, conserved site
IPR022309 - Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055563.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo var. makuwa]2.94e-14999.08Show/hide
Query:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
        ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
Subjt:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI

Query:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
        VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
Subjt:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE

Query:  FYMKKLQRKKGKGAGAA
        FYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  FYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_004148331.1 40S ribosomal protein S8 [Cucumis sativus]3.66e-152100Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_008451649.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo]3.01e-15199.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]2.77e-14796.8Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]1.95e-14796.8Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS KK+EEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQF SGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJA0 40S ribosomal protein S81.77e-152100Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A1S3BRZ4 40S ribosomal protein S81.46e-15199.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5A7UI08 40S ribosomal protein S81.42e-14999.08Show/hide
Query:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
        ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
Subjt:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI

Query:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
        VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
Subjt:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE

Query:  FYMKKLQRKKGKGAGAA
        FYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  FYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S81.46e-15199.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S81.34e-14796.8Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81361 40S ribosomal protein S81.5e-10287.27Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVK-KEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV+IGRKKKT+A+ K   EEG+A TEE KKSNHV  K+EKRQQ R LD HIEEQF  G+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEGK
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVK-KEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK

Query:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S85.7e-10286.88Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKK  A+ KK+ EG   +A TEE KKSNHV RK+EKRQQ R LD HIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S89.8e-10285.52Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKKT A+ K   EG   +A  EE KKSNHV RK+EKR++ R LDPHIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-12.5e-9781.45Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-21.9e-9783.56Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein1.8e-9881.45Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein1.4e-9883.56Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTATTTCCCGTGATTCTATGCACAAAAGGCGTGAAACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACCAA
GTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGAGGGGGTAATGTGAAGTGGCGTGCGTTTAGGCTGGATACTGGAAATTACTCTTGGGGTAGTGAGGCCGTGA
CTAGAAAGACCCGTCTTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAATGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTAGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTT
AAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGCCGGAAGAAGAAGACCTCTGCATCTGTTAAGAAGGAAGAGGAAGGCGATGCTGGCACTGAGGAGGTAAAGAA
GAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGCAAGCTTGACCCACATATTGAAGAACAATTCAGCAGTGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAA
GGCCTGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATCTTGGAGGGCAAAGAGCTCGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGAAACAAACTGAAAGCAAATTAAACCTAACCCTCGCCGCATCAAAACCCCTCTCAGCCCCCTCCATTCTCTCTCTCGACCTTCTCTCGATCGTTCAAGGAATCCTAGA
CTCGTCTTTACTCCGAGAGCCCACGTCTTACCAAGATGGGTATTTCCCGTGATTCTATGCACAAAAGGCGTGAAACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGCGA
AAGTATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACCAAGTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGAGGGGGTAATGTGAAGTGGCGTGCGTTTAGGCTGGA
TACTGGAAATTACTCTTGGGGTAGTGAGGCCGTGACTAGAAAGACCCGTCTTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAATGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTAGTGA
AGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTTAAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGCCGGAAGAAGAAGACCTCTGCATCTGTTAAGAAGGAA
GAGGAAGGCGATGCTGGCACTGAGGAGGTAAAGAAGAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGCAAGCTTGACCCACATATTGAAGAACAATT
CAGCAGTGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAAGGCCTGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATCTTGGAGGGCAAAGAGCTCGAATTCTATATGAAGAAGCTCC
AAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCTTAAATTTTGGTTATGGTTTCAGCCAGTATTTTCCTGTTCACTCCTTTTCTTATGAAGACAACGAGCTGTTGCAGCTAT
TTTGGAACTTTGATTTTGCTGGTAATAGTTTAATTATAGTACCTTTGACCTTTTTTCATGGTAACAACAGTTTGCTTAATTAGCTTGAGTTTAAGTTCAAAATTTTCTAG
TCAATTTATGTAAGCGGGTTGGTTTGGTTGTTTGATCTAGAATTTATAGAAGTACAAATGGATTATAGAGTGATTTAAACTCACACTGCTTCTTTTAAAACCAAATTCGC
TGAATTTCTCACTTTATAATTTTTGTTACGTCTCTGAAAGTTCGAAGTTTCCAATTCTTCTTTATCTACACTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPF
KQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA