; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G009760 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G009760
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationGy14Chr2:9290745..9292036
RNA-Seq ExpressionCsGy2G009760
SyntenyCsGy2G009760
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646596.1 hypothetical protein Csa_004903, partial [Cucumis sativus]6.07e-2241.9Show/hide
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KGN61523.1 hypothetical protein Csa_006491 [Cucumis sativus]2.91e-94100Show/hide
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XP_031736681.1 uncharacterized protein LOC116402062 [Cucumis sativus]2.30e-4260.63Show/hide
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XP_031743987.1 uncharacterized protein LOC116404759 [Cucumis sativus]8.67e-2138.58Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K902 Uncharacterized protein9.33e-2238.58Show/hide
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A0A0A0KB76 Uncharacterized protein2.96e-4166.36Show/hide
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           FEPS
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A0A0A0LIE0 Uncharacterized protein1.41e-94100Show/hide
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A0A1S3CL88 uncharacterized protein LOC1035022509.65e-2139.37Show/hide
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A0A5D3DZ07 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein1.39e-1939.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCTCAATCAAGGTTGACAACCTTGATCCTTTTTTAGATGCAACCTCTCTATTCACCGAATTTATCAACGATGAAATCTGCCTCAAGTTCTCACCATCGACGTTTTC
AATGATTGCTCGATATCAATGCCCGACCTTCTTTGCAATGTTGTTCATGCCACATCCATTATTCGTTGAATACTCCGTTGATCGAAATCATATTTCAAGGATTTCTCTCC
GATGCTTCCGGAATGCTTTGTTGGAAGGTCAAAGCTATTCCTCAATGAGTATCCATCTTCGAGAACCCCAAAATACCATACTCTTTAAATTTGAGCCTTCAATTTTGATT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ACTTCAAGAGGTTCACAAATCACATTCTCTGCGGTTCCACGTGAGGAGATAATTATTAGGGAAGAGGTATGTTTTGTGAAATTTGTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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