; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G011700 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G011700
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationGy14Chr2:11693107..11693587
RNA-Seq ExpressionCsGy2G011700
SyntenyCsGy2G011700
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039384.1 hypothetical protein E6C27_scaffold64G001870 [Cucumis melo var. makuwa]2.40e-1955.88Show/hide
Query:  NSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIA-INGDNVPQADDMNHAE
        N  LGIAI Q TN L+H VA VS  NNNQL +AF +SV+  A+A LAT+ASNNVI  + NT +ASL MAA  LAA  S+I  A +NG N  Q DD+N A 
Subjt:  NSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIA-INGDNVPQADDMNHAE

Query:  NE
        ++
Subjt:  NE
KAE8651857.1 hypothetical protein Csa_023625, partial [Cucumis sativus]7.28e-49100Show/hide
Query:  IVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
        IVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
Subjt:  IVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKZ8 Uncharacterized protein6.46e-78100Show/hide
Query:  MDNQSIYLIHLNFFLHFPPNSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVI
        MDNQSIYLIHLNFFLHFPPNSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVI
Subjt:  MDNQSIYLIHLNFFLHFPPNSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVI

Query:  AINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
        AINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
Subjt:  AINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
A0A5A7T7D4 Uncharacterized protein1.16e-1955.88Show/hide
Query:  NSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIA-INGDNVPQADDMNHAE
        N  LGIAI Q TN L+H VA VS  NNNQL +AF +SV+  A+A LAT+ASNNVI  + NT +ASL MAA  LAA  S+I  A +NG N  Q DD+N A 
Subjt:  NSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIA-INGDNVPQADDMNHAE

Query:  NE
        ++
Subjt:  NE
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACAATCAAAGCATCTATTTAATCCATCTTAATTTCTTCCTTCACTTCCCTCCTAATTCATACTTAGGTATAGCAATTGTTCAAGTCACAAACGTCCTTATCCATGT
TGTAGCAATCGTATCTTATGCAAACAACAATCAACTAGGTAATGCTTTTGCATCTGTGAAAACTGGTGCTAATGCTGGGCTTGCCACTAAGGCTTCCAACAATGTAATTG
TTGTTATGTCTAACACCGTCAATGCTTCTCTTGTGATGGCTGCAACATTGCTTGCTGCAACAATTTCCTATATTGTCATAGCAATTAACGGTGATAATGTCCCTCAAGCT
GATGATATGAATCATGCTGAGAATGAAGATGCTACTCTCAAGATGTGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACAATCAAAGCATCTATTTAATCCATCTTAATTTCTTCCTTCACTTCCCTCCTAATTCATACTTAGGTATAGCAATTGTTCAAGTCACAAACGTCCTTATCCATGT
TGTAGCAATCGTATCTTATGCAAACAACAATCAACTAGGTAATGCTTTTGCATCTGTGAAAACTGGTGCTAATGCTGGGCTTGCCACTAAGGCTTCCAACAATGTAATTG
TTGTTATGTCTAACACCGTCAATGCTTCTCTTGTGATGGCTGCAACATTGCTTGCTGCAACAATTTCCTATATTGTCATAGCAATTAACGGTGATAATGTCCCTCAAGCT
GATGATATGAATCATGCTGAGAATGAAGATGCTACTCTCAAGATGTGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDNQSIYLIHLNFFLHFPPNSYLGIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLVMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQA
DDMNHAENEDATLKMC