; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G012490 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G012490
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationGy14Chr2:12393573..12398242
RNA-Seq ExpressionCsGy2G012490
SyntenyCsGy2G012490
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
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No hits found
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AT4G39140.1 RING/U-box superfamily protein1.9e-9949.33Show/hide
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AT4G39140.2 RING/U-box superfamily protein1.9e-9949.33Show/hide
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AT4G39140.3 RING/U-box superfamily protein1.9e-9949.33Show/hide
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AT4G39140.4 RING/U-box superfamily protein1.9e-9949.33Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGGATGGAAGTCCACTTGAACATCTGCGTAGACGCGGATGGCAAAAGTCCCCACCGCCGGAAGGTACAACTAATCATTTGAGAACTCCTAGCTCAGGTCAATCAAATTCT
AGGAATCTATCGACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCATATAAGTCTCCTGCAAAATTGTCACTTTCATTGCCTTCAACTTC
ATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTCGTCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCTGGGCATCACCTGTTGCGTCAAGTGT
CTGACAGCCGAATCCGAGGATTAAAATCACCAAGCAGCTATTTAGCTTCAGAAGATAGACCAAGGCTTCCCTCTTGGAGCAACGAATCGGTCCGGGACTCACATGGAGGG
TCTTCAGATTGTTGGTCTGTGCATGCTTTCTCTGAACTCATGGCCACTTCTCATAGAGAAAGGTGGTCTTTTGATAGTGACTCGTTTGGCTTCAACGGTGAGAAAATAGC
CAGATCTAATAGTCAGATCTCAACTTCCTCAGTCGATTTGCAAACTTGCGGAGTTTGCTCAAAGCTGCTGACCGAGAAATCCTCATGGAGTAGCCAAAGGATTATTGCGA
ACAATGAACTTTCTGTTGCTGCTGTCCTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCTGATTGCTTGGAGAGTATGACGCCCGAGATTCACAAGTACGATCCTGCTTGTCCTGTT
TGTACCTTCGGGGAGAAGCATACTCAAAAGTTGTCTGAAAAGGCGCTCAAAGCCGAAATAGACTGGAAAAGTCTATACAAGAGATCCAAAAAGTGTATTGCAGATAGCGA
TTTTGATGGCGATTTTGCTGCAAACGACCCTTTCAAAAACAATGCACGTCTGGAAAGGGGATCAAAATTGTCAGCCAGTTCTAGCATGAGAAGCTCCTCAGGAAAGCCGT
TCTTGAAACGCCACTTCTCCTTCGGCTCAAAGGGATCTTCCAGAGTGATGTCTGATAATCCCCCAACAAGAAGGAAAGGATTCTTCTGGGCAAAATCCAGCAAAGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCACTCTTTCTCCCAAGATTCCCCTATTGCCCTAACGTCCTTAATTCTACCGTTTAGAACAACCCCTCCCTTCCCTTCCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTTCACTCC
TTTCTGTATTGTGAAGAAAACCCAGCGCTTCACCCTTTCCCCTTCATTTCTCCCTCTAAAACCCTCTCTCTTTCTCTCCCTCTCTCTCCTCTTTTCAGCTTCAGTTCTAC
CTCTCTGAAAGACAGAATACAGTTAGGTGTTTTCTTGAGAGGCATGGTGCTGGGGTTATTCTCAGAGTTCTAATTTGGACTGCTTCAGCAACTTTTCTGGCGCAGTTATA
AAACTCAAGATCTTGGTCTTTCGCCGGCATGGGATCTGCGTGTTGCGTTGCTGCTAGGGACAAGACTATAGTAAGTGGATCTGGAAGTGAAACCTTATGTAGGAATATTA
GGTATTCGCCCAGTTGGAGCTTTCGATGGGATAATCGTGGACGGGTAGCTGGTGAAGAGACTTCAATAAATTGGTTTTCTGATAGTGTTGGCCGCAATGATAGAGCGGAA
CTGAAGTGTGAGTCAGCATATGCATCAGAGGATGGAAGTCCACTTGAACATCTGCGTAGACGCGGATGGCAAAAGTCCCCACCGCCGGAAGGTACAACTAATCATTTGAG
AACTCCTAGCTCAGGTCAATCAAATTCTAGGAATCTATCGACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCATATAAGTCTCCTGCAA
AATTGTCACTTTCATTGCCTTCAACTTCATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTCGTCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCT
CCTGGGCATCACCTGTTGCGTCAAGTGTCTGACAGCCGAATCCGAGGATTAAAATCACCAAGCAGCTATTTAGCTTCAGAAGATAGACCAAGGCTTCCCTCTTGGAGCAA
CGAATCGGTCCGGGACTCACATGGAGGGTCTTCAGATTGTTGGTCTGTGCATGCTTTCTCTGAACTCATGGCCACTTCTCATAGAGAAAGGTGGTCTTTTGATAGTGACT
CGTTTGGCTTCAACGGTGAGAAAATAGCCAGATCTAATAGTCAGATCTCAACTTCCTCAGTCGATTTGCAAACTTGCGGAGTTTGCTCAAAGCTGCTGACCGAGAAATCC
TCATGGAGTAGCCAAAGGATTATTGCGAACAATGAACTTTCTGTTGCTGCTGTCCTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCTGATTGCTTGGAGAGTATGACGCCCGAGAT
TCACAAGTACGATCCTGCTTGTCCTGTTTGTACCTTCGGGGAGAAGCATACTCAAAAGTTGTCTGAAAAGGCGCTCAAAGCCGAAATAGACTGGAAAAGTCTATACAAGA
GATCCAAAAAGTGTATTGCAGATAGCGATTTTGATGGCGATTTTGCTGCAAACGACCCTTTCAAAAACAATGCACGTCTGGAAAGGGGATCAAAATTGTCAGCCAGTTCT
AGCATGAGAAGCTCCTCAGGAAAGCCGTTCTTGAAACGCCACTTCTCCTTCGGCTCAAAGGGATCTTCCAGAGTGATGTCTGATAATCCCCCAACAAGAAGGAAAGGATT
CTTCTGGGCAAAATCCAGCAAAGTATGATAGATTCTAACGGTCCCTCCACGTCATGTCAGGAAGTTGTGTTTCGTGAAACAAGGGAACCATCGACTTCTGTGCCTCGTCA
ATGGAAACGTGGCCATAAGAAATACAGTTGTGTTCCCACGTCCATTGCAGCCATTGAAATGTGCTGCTCACTCAAAACCCAGGTGCCTTCCACAAAATTGTTTGTAGTCT
TGAAAAGTTTCATGAAACAAGGAATTGTCAGTCAACTTCATAACTCCAATTTAAAATGTCTGTATACATATCAAAGATATGATATATAAATGTTATTTGAGTTGAAATTC
TTTGTTATGGGTTCTTGTTTGTACACACTCAGCATTTGTGTAAAACAGATTCCAATTCTATTGCTGTCTCTATCATCTGTGAGTGTGGGTAGCAGCATACTCCCATTTTT
ATTTCTCGTCACAAGCATGTTACTAAAACATAACATATGTTTACAATTTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSACCVAARDKTIVSGSGSETLCRNIRYSPSWSFRWDNRGRVAGEETSINWFSDSVGRNDRAELKCESAYASEDGSPLEHLRRRGWQKSPPPEGTTNHLRTPSSGQSNS
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