; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G016680 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G016680
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionSerine/arginine-rich splicing factor SC35-like
Genome locationGy14Chr2:27019474..27024068
RNA-Seq ExpressionCsGy2G016680
SyntenyCsGy2G016680
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016607 - nuclear speck (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa]2.61e-9896.55Show/hide
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KAG7029626.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.30e-9990.81Show/hide
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XP_008445340.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo]5.90e-9796.51Show/hide
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XP_011649457.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X2 [Cucumis sativus]6.53e-10199.42Show/hide
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XP_031736561.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X1 [Cucumis sativus]3.09e-9896.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein3.16e-10199.42Show/hide
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A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like2.86e-9796.51Show/hide
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A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like1.26e-9896.55Show/hide
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A0A6J1HFJ8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X24.90e-9191.33Show/hide
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A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X21.72e-9191.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 24.7e-0443.06Show/hide
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Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC351.0e-1950.26Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC357.4e-2150.26Show/hide
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AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC357.4e-2150.26Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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AGGGGAAGAGATGATGATGATCGACGTAGTGCTAGCCACTCTGATAGAAGCATGTCGCCCACCCGACATTCCCCTGATACTCGGAGAAGCATATCTCCACGTAAGACACC
GCCATCTAGGGCTAGAAGCGACGATGAACACTCACCAAAGGGAGATAATGGCTCACCAGATGATAAACCAGTTGATTCTCGTAGTCCATCTCCTGCTAGATCCGATGCTG
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ACCATTCGTAAATTTTAGTTAAAGTTAAGGGCTTTCGAAGAAATACACAAAAATGGTTAGAATCTCATTCTTCCACCAGAGACCTAGTTGAGGTTCAGCTCTGAATCCGC
CGCCGTTGTTGTTGTTGCTGGTCACCACTCTCTCCATCGCCGAATCCCATTACCTGCAGTGTGAAAAATGTCGCACTTTGGAAGATCCGGTCCTCCCGATATCAGAGATA
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CCCTTTCTTGCTTCTCAGGTACTACCGCCGATGATCTTTACCCCCTTTTCGATAAGTATGGAAAGGTCGTCGATGTCTTCATCCCCAGAGACCGCAGGACTGGGGATTCG
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TTTCAATTTAACTTTGCTGCTGTTTTTATGGGAAATCAATTTGGGTTTCTACTTTGCTATCTAGGACGAATGTTGGATGGCAGAGAAATTATGGTTCAATTTGCTAAGTA
TGGTCCTAATGCTGAGAAAATTCGTAAAGGGAGAGTAATGGAATCATCTTCGAAGACAAGGGGAAGGTCAAGAAGCCGCAGTCCACGTTCAAGGCACCGTGATGACCATA
GGGATAGGGATTACAGGAGAAGAAGCCGCAGTAGAAGCCGTGAGAGATATGATCGTGATAGACCCCACAGAAGTGAGAGAGAGCGCTATCGCAGTAGGAGTCGTAGTGCT
AGTCCTGACCGTAGTAAAGATCGTAGGAGGGGAAGAGATGATGATGATCGACGTAGTGCTAGCCACTCTGATAGAAGCATGTCGCCCACCCGACATTCCCCTGATACTCG
GAGAAGCATATCTCCACGTAAGACACCGCCATCTAGGGCTAGAAGCGACGATGAACACTCACCAAAGGGAGATAATGGCTCACCAGATGATAAACCAGTTGATTCTCGTA
GTCCATCTCCTGCTAGATCCGATGCTGATGTGAGTTAAACCTACCATGCTTATAGTATTATTACTTGCTGCCAGTGATTTTATTATAAATATATTTCTGTTCTGTCTAGT
GACAAGCAAAAATATACCTGCAGGAGTGATATACATGCCATTAGAGATAATTTATGGAGCTAAGACATTGGATGTTAGAAATTGTCTAAGCATATTTATAATGGGAACAA
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