; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G018190 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G018190
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionBHLH domain-containing protein
Genome locationGy14Chr2:27977720..27979390
RNA-Seq ExpressionCsGy2G018190
SyntenyCsGy2G018190
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060972.1 transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]7.64e-21592.38Show/hide
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XP_008444519.1 PREDICTED: transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo]1.27e-21392.08Show/hide
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XP_016899947.1 PREDICTED: transcription factor bHLH74 isoform X2 [Cucumis melo]2.61e-16390.67Show/hide
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XP_038885625.1 transcription factor bHLH74-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.64e-16575.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNP9 BHLH domain-containing protein2.33e-23499.71Show/hide
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A0A1S3BA09 transcription factor bHLH49 isoform X16.12e-21492.08Show/hide
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A0A1S4DVD5 transcription factor bHLH74 isoform X21.26e-16390.67Show/hide
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A0A5A7UYJ9 Transcription factor bHLH49 isoform X13.70e-21592.38Show/hide
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        IKCPFSYVQILDDEEMVSPKND KS+PD V+ENQRKFV+GSNSSSPNKNAEDN NV PTEIL+KADKTQKVEHR+SANFNTK DSK+AKGGSQNVQ+PKE
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A0A6P6GAR5 transcription factor bHLH74 isoform X36.30e-5545.63Show/hide
Query:  LENEGVKTISNILHDPSTLSF-------DMFGTGNFSDMVGSFGFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDE-EMVSP----KNDAKSRPD-----CVSENQ
        LEN+G+ + S+++  PS  SF         FG+G+FS+MVGSFG    A+ S IAN  CP  Y    +   E  SP     +D +   D       S  +
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Query:  RKFVLGSNSS-SPNKNAED----NFNVEPTEIL-DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKIS
        RK  L S+S  SPNKNAE     + + E ++++ D  +K  K E   S N   K   K++K  S + +APKENYIHV+ARRG+A N+HSLAERVRREKIS
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Query:  ERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGEN--VNDPRSRIIHTSPHVTFQLY
        ERM+LLQ+LVPGC++ITGK V+LDEIINYVQSLQQQVE LSMKLA+V  E +++ E+IL        S ++L  RG N  +      I  + P+      
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Query:  GTTPTMPRT
        GT PT+P T
Subjt:  GTTPTMPRT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q69WS3 Transcription factor BHLH0945.2e-2545.91Show/hide
Query:  PKNDAKSRPDCVSE--NQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNH
        P++DA    D +S+  +      G      + +A +   ++P +  DK D       R  A  ++   SK A   +   + PK++YIHV+ARRG+A ++H
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Query:  SLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASV
        SLAER RREKISERMK+LQ LVPGC+++ GK  VLDEIINY+QSLQ QVE LSMKL +V
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Q6NKN9 Transcription factor bHLH741.1e-3247.92Show/hide
Query:  NKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITG
        NK A + F  +P    D++ K  K         N +      K  SQ+ +APKENYIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITG
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Query:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP
        K V+LDEIINYVQSLQQQVE LSMKLA+V  E +++ ++IL        + ++L  R  N     +  +  +P   FQ  G  P +  TT+P
Subjt:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP

Q9C670 Transcription factor bHLH761.4e-2555.47Show/hide
Query:  DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQ
        ++ DK QK E   ++N N K +S+K     Q   + K+ YIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC ++TGK V+LDEIINYVQSLQ
Subjt:  DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQ

Query:  QQVELLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSS
         Q+E LSMKL++V   L+ +LE+   LL  ++  SS+
Subjt:  QQVELLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSS

Q9CAA9 Transcription factor bHLH493.8e-2845.76Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
Subjt:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG

Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

Q9SRT2 Transcription factor bHLH626.1e-2650.33Show/hide
Query:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV
        L +  KT+  ++  SA  ++K        D K+ K   +N        P ++YIHV+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
Subjt:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKL+SV   L+ +++A   LL+ + + SS+N++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.1e-3447.92Show/hide
Query:  NKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITG
        NK A + F  +P    D++ K  K         N +      K  SQ+ +APKENYIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITG
Subjt:  NKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITG

Query:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP
        K V+LDEIINYVQSLQQQVE LSMKLA+V  E +++ ++IL        + ++L  R  N     +  +  +P   FQ  G  P +  TT+P
Subjt:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP

AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.7e-2945.76Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
Subjt:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG

Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G68920.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.7e-2945.76Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
Subjt:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG

Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.3e-3040.24Show/hide
Query:  FDMFGTGNFSDMV----------GSF----GFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDAKSR---PDCVSEN--------QRKFVLGSNS---
        F +F  GNFSDMV          G F    G +     S   N+  P + V +   E  V     AK        VSE+        Q+     SN+   
Subjt:  FDMFGTGNFSDMV----------GSF----GFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDAKSR---PDCVSEN--------QRKFVLGSNS---

Query:  --SSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC
          +  N  A  +   + +E     +  +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC
Subjt:  --SSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC

Query:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.3e-2750.33Show/hide
Query:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV
        L +  KT+  ++  SA  ++K        D K+ K   +N        P ++YIHV+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
Subjt:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVE LSMKL+SV   L+ +++A   LL+ + + SS+N++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAACAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGG
ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACATTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAACTGGGAACTTCTCAGATATGGTGGGTTCTTTTGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCATAGCCAGATCGCCAATATTAAGTGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGCAAAGTCTCGACCCGATTGCGTTAGTGAAAATCAAAGAAAATTTGTTCTTGGTTCCAATTCTTCTAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATAACTTTAATGTGGAACCAACTGAGATCCTTGATAAAGCTGACAAAACACAGAAGGTTGAGCATCGATTGAGTGCAAATTTTAACACCAAACCAG
ATAGTAAAAAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAAGCCCCCAAGGAGAATTATATTCATGTTCAAGCGCGAAGGGGGCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
AGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATTAACTA
TGTACAATCACTGCAACAACAGGTGGAGTTGCTATCAATGAAACTCGCAAGTGTCGGACTAGAATCAAGCTTGGAGGCAGAGCAGATTCTACTCACAAATAATTCATACC
TTTCGTCATCGAATGTTCTTTGTAAGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCCTAGATCAAGGATAATTCACACAAGTCCTCATGTCACGTTTCAACTTTATGGAACAACGCCA
ACCATGCCAAGAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAACAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGG
ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACATTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAACTGGGAACTTCTCAGATATGGTGGGTTCTTTTGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCATAGCCAGATCGCCAATATTAAGTGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGCAAAGTCTCGACCCGATTGCGTTAGTGAAAATCAAAGAAAATTTGTTCTTGGTTCCAATTCTTCTAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATAACTTTAATGTGGAACCAACTGAGATCCTTGATAAAGCTGACAAAACACAGAAGGTTGAGCATCGATTGAGTGCAAATTTTAACACCAAACCAG
ATAGTAAAAAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAAGCCCCCAAGGAGAATTATATTCATGTTCAAGCGCGAAGGGGGCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
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ACCATGCCAAGAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGSTSGFQCETMKCSFGVSSSQPLIGVDTSFSSTLGSSSTTPLCELSTASLENEGVKTISNILHDPSTLSFDMFGTGNFSDMVGSFGFLTEADHSQIANIKCPFSYVQI
LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAE
RVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVELLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTP
TMPRTTSPSTF