; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G021840 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G021840
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description40S ribosomal protein S5-like
Genome locationGy14Chr2:30373827..30375932
RNA-Seq ExpressionCsGy2G021840
SyntenyCsGy2G021840
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000235 - Ribosomal protein S5/S7
IPR005716 - Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal
IPR020606 - Ribosomal protein S7, conserved site
IPR023798 - Ribosomal protein S7 domain
IPR036823 - Ribosomal protein S7 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004151715.3 40S ribosomal protein S5 [Cucumis sativus]2.17e-140100Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_008447164.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S5-like isoform X1 [Cucumis melo]5.21e-14098.07Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_008447165.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S5-like isoform X2 [Cucumis melo]3.27e-14098.07Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_038888890.1 40S ribosomal protein S5-like isoform X1 [Benincasa hispida]3.80e-14098.55Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_038888891.1 40S ribosomal protein S5-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.30e-14098.55Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BGS8 40S ribosomal protein S5-like isoform X21.58e-14098.07Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A1S3BGS9 40S ribosomal protein S5-like isoform X12.52e-14098.07Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A1S3C3S7 40S ribosomal protein S5-like5.78e-14098.55Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A5A7SN17 40S ribosomal protein S5-like isoform X11.11e-14098.55Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A5D3D3Q1 40S ribosomal protein S5-like isoform X21.58e-14098.07Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65731 40S ribosomal protein S5 (Fragment)2.4e-9793.68Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVD
        +VKLFNRW+FDDVQ++D+SL+DY+GV P+KHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTD NP+QVIVD
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIK+IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P46782 40S ribosomal protein S52.5e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P51427 40S ribosomal protein S5-21.5e-9687.44Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        A +VD  + Q LT   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNP+QVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Q5E988 40S ribosomal protein S52.5e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

Q9ZUT9 40S ribosomal protein S5-11.4e-9787.44Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        + E+D  + Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNP+QVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37270.1 ribosomal protein 5B9.8e-9987.44Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        + E+D  + Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNP+QVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT2G37270.2 ribosomal protein 5B9.8e-9987.44Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        + E+D  + Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNP+QVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.1 ribosomal protein 5A1.1e-9787.44Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        A +VD  + Q LT   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNP+QVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.2 ribosomal protein 5A1.1e-9787.44Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        A +VD  + Q LT   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNP+QVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

ATCG01240.1 ribosomal protein S73.6e-0835.29Show/hide
Query:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT
        RL N L+     +GKK +A +II  A++ I   T+ NP+ V+  A+    P     A R+G  G   +  ++I   +    AI  L   +R+   RN   
Subjt:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPVQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT

Query:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        +A  L+ EL++AAKGS +  AI+KK+E  R+A+ANR
Subjt:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGTTGAAGTTGATGTGGTTAACCAGGAACTGACCCTGCCTCATCACGATGTGAAGCTGTTCAACCGGTGGACCTTTGATGATGTCCAAGTGAATGACATCTCTCT
GGTTGATTACGTTGGTGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACACTGCCGGGAGGTACTCTGTCAAGCGCTTTAGAAAAGCTCAGTGCCCAATTGTTGAGA
GGCTCACAAATTCTCTGATGATGCACGGAAGAAACAACGGGAAGAAACTCATGGCTGTCAGGATTATTAAGCATGCAATGGAGATTATTCATCTTCTAACCGATCTCAAC
CCAGTTCAAGTCATTGTCGATGCGGTTGTTAACAGTGGACCACGTGAAGATGCCACTCGAATCGGCTCAGCTGGTGTTGTTAGGCGTCAAGCTGTGGATATATCCCCTTT
GCGACGTGTTAATCAGGCAATCTATCTTCTTACAACAGGTGCTCGTGAGGCCGCTTTCAGAAACATCAAAACAATTGCAGAATGCTTGGCGGATGAACTTATTAATGCAG
CAAAGGGATCATCCAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCTAAGGCAAATCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGTAGGTTAAAAATTTCCCTTTCCTCGCGCGTGCCTTCTCCGTTTCTTTTGATAGCGCCGCATCTCCTCTCATCTCCTTCCTCTCCTCGCCTTCGTCTCCTGTCTCCGC
GGTTCGTCCGTCTCCTCCCTCTCCTCTCTTCCGACGGTGATCTCAAATCAGGAACAATGGCCGTTGAAGTTGATGTGGTTAACCAGGAACTGACCCTGCCTCATCACGAT
GTGAAGCTGTTCAACCGGTGGACCTTTGATGATGTCCAAGTGAATGACATCTCTCTGGTTGATTACGTTGGTGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACAC
TGCCGGGAGGTACTCTGTCAAGCGCTTTAGAAAAGCTCAGTGCCCAATTGTTGAGAGGCTCACAAATTCTCTGATGATGCACGGAAGAAACAACGGGAAGAAACTCATGG
CTGTCAGGATTATTAAGCATGCAATGGAGATTATTCATCTTCTAACCGATCTCAACCCAGTTCAAGTCATTGTCGATGCGGTTGTTAACAGTGGACCACGTGAAGATGCC
ACTCGAATCGGCTCAGCTGGTGTTGTTAGGCGTCAAGCTGTGGATATATCCCCTTTGCGACGTGTTAATCAGGCAATCTATCTTCTTACAACAGGTGCTCGTGAGGCCGC
TTTCAGAAACATCAAAACAATTGCAGAATGCTTGGCGGATGAACTTATTAATGCAGCAAAGGGATCATCCAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAG
TTGCTAAGGCAAATCGTTGAGAGGTTATTTTTTGTGTTACGGCAAGAGTTTTCTGTTATTTTTCTTGTCTGTTTTACACTCTTAAAATGAACGCTATAGTCTAAATCTAC
CGGTTTTGAATTTCTTATTTGGACAAATCATGTCTACTACTTGACTTTAAAGTTTTGGTATAATGTCATTTCATCAAAACAGCCAAATGCATGTGTTTCTTGAAATGGTG
TCATTGTAACTTTATCTTTCTTAATTTAGTCTATGTAGTTAGTTTTTTCTAAGGCTAAAATGTATGTTGTGTTTTGATATTGTCTTTATAACTAAACTGTTTGCTCGTTG
CCCCACTTCATCTGTGGATTCTTTTGAAAATATGAGTTGGGCTTGTTGGTCGAACCAAAAAAAAATATTCAACCAGAGACTCAATCCAAATAGTTTGAGTTTTGAGTTAT
CAGATTGTTCGAGCACTCATTTCTTAGCGTCAAAGTGCTATTATGGAACCCATTAAACAGCAGCAAGAAAAAAAAAAGGTGCTATAAGGTTTATGGATAAAAAGCAACGA
AGAATATTGAAGCTTCAAAAGACCATAGGACTTCAATCTTACGACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVEVDVVNQELTLPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLN
PVQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR