; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G024540 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G024540
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionDUF2062 domain-containing protein
Genome locationGy14Chr2:32294705..32299024
RNA-Seq ExpressionCsGy2G024540
SyntenyCsGy2G024540
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037033.1 E3 ubiquitin-protein ligase [Cucumis melo var. makuwa]3.34e-9698.62Show/hide
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XP_038886058.1 uncharacterized protein LOC120076335 [Benincasa hispida]3.26e-8295.42Show/hide
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A0A0A0LSU8 DUF2062 domain-containing protein4.95e-8699.24Show/hide
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A0A1S3B2V5 uncharacterized protein LOC1034854041.65e-8497.71Show/hide
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A0A5A7T257 E3 ubiquitin-protein ligase1.62e-9698.62Show/hide
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No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33490.1 unknown protein4.5e-5076.19Show/hide
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AT4G10140.1 unknown protein6.5e-4976.23Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGCAGCTCTAGGCATAACATTGGGATTATTTCCTATATGCGGGGTCACTGTTTTCTTATGCGGGTTTGCAATTGCGTTTCTTGGATCTCTTTGTCATGCTCCAACAGTGA
TGCTTGCTAACTTTATTGCTACTCCCATAGAATTGAGTTTGGTGGTGCCTTTTTTGCGCTTTGGTGAAGCCATTTCTGGGGGACCTCGTTTCCCCTTTACACCTGATGCT
TTGAAAAAAGTTTTTACTGGTGAAGCTTCGCATGAAGTACTTTTGAGTATTGCTCACTTGGTAAGGTTTCTTCTAGATTCTTTTATCAGCGCTGTTCATGCAGGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAAAAAAACCCGGAGTATTTATGAAGCGTGGCGTTGGCAATGCTAAACTAATCAGATCGTCCCTATTCTGGTCGGCGGTGGTCCTCCGAACAGAAATCAGTAGAAATA
ATCGATCTTCTCCGGACTTTCGAGAAGGGGAAGGAATAATATTCTTGCAAGAGAGAGGTTATTGTTCAACCGAATCCAGTTAAAGAGTGATCTACACAAACAAAGGAAAT
TCTATATTTCGTTCGATTCATTTTTTGTTCCGATCGAGGCTCCGGGCGGAGACAAAGCTTTTTTTAATTTTCAAATTTGTTGGAGGTGAAGATGGCAACAGTAGGACATG
CCCGTTCGACCAGTTGGTTTAACCAGAAAATCGTCGATCCTCTCCTCCAAATCCTTCAAAGGGGCGCCGAGCCGAAGCAACTGGCATTCTCTGCAGCTCTAGGCATAACA
TTGGGATTATTTCCTATATGCGGGGTCACTGTTTTCTTATGCGGGTTTGCAATTGCGTTTCTTGGATCTCTTTGTCATGCTCCAACAGTGATGCTTGCTAACTTTATTGC
TACTCCCATAGAATTGAGTTTGGTGGTGCCTTTTTTGCGCTTTGGTGAAGCCATTTCTGGGGGACCTCGTTTCCCCTTTACACCTGATGCTTTGAAAAAAGTTTTTACTG
GTGAAGCTTCGCATGAAGTACTTTTGAGTATTGCTCACTTGGTAAGGTTTCTTCTAGATTCTTTTATCAGCGCTGTTCATGCAGGGTGACCAATTATCATTGTTACTTTT
TTTTGTCTTTCCGTAGGATTAGACTATAAGATCTGATCACCTATTAGTTGCAGTTCTCAAGATCAAATACTTCAATTAATGAACTGAATTGGTTTGAGAAGCTAGACGAT
TTTATTATAACAGATCCATTTTAGAGTGTTGTTATCAGCTGGGTACACAATAAGGGGGTCATCTCAGGTTTTATTGACACTAAATCTTCACTTGCGATAACTCATTTTTA
TGTATTTGAGCTCTTTAAGGAGTATGTGAGGATTGTGAAAGATTTCTCTGAGTTTGAGAGGTTAGACTTCGGTTCTGTTGATGCAAACATATTCACAAAAACTTAGTAGA
CCGATCAAATGTGTGGCAGATTAATTTGTACAAGATGAGAGAGAAAGATAGAGGGAGGGGGGAGGGATATGATATATACTTGTAGAAGAGAGGACAAAGGTTCATGTAAA
CTGAGATTCGAAGTTGCTTTGATGCAAATATTAGTCATGAATGGTCTCAGCGTGTTAGAAGAGGGTGACAAGTAGCAGCTCTTACGGTCTTAACTCACTTGGAATACACA
CACATTAGAGTGAATGGACAACTTGTGTCTCTTCACATAAAAGAAAGACAAACTAGTGTAGTGAAATGAACACTTTCATTATGGGAAAGACAATAGATTTGTCAAGAACT
GAAGATGCGCCAAGTGTATAGTTCATTTCACTCATTGGAATGGTCTGTATGGCATTCAACAACGGCAAAATGGAAAGATGCGTGAACTTGCTTATCTTCTCCTATTGGGG
ATTTCTCTCACTCTGCTCTTGAAACCTCGAACTGCTTTCTGTATGTTTACCATTGCCATTTGTGTTCTGTTTATCTCGTTTCCTTTTTTCCCCAGTAATCTTGCTTTAGG
GTTTAAAATGAACATTGTTTAATTTTACACATTTAAACACATTCTTCATCGTATTAAAATTGATTTTGAAGGAACAAAAGCATCTTTGGAATGATTTTTGCTCATTATAT
TTACTATGTTGTGTCATCACATACATCAATTGCTTGTTATTAGCTAGCCCCAACCAAGTCTATATCTCTCAACATTTTCAGTTCTAATATGAAAATGTTAGTTTGTATGT
TGCCATTTTGAGTTGCTTCGTTCACATTAACAAACTGGATGAAAGAAAGCTTTGGATCAAAATTGGCAGTTGTTGGGATGGCTTGTTGCTGCACCCTTTATTCTGGGCAT
TGGATATTTGTTGTTTTTACCATGTTTCAAGATTTTGGTGCGCAAGTTCAGCACTGTTGCTTCAAGCCCAAAGAAGCCTCCTCATTCACACACAGACATCAAACTGAAGG
TGAGAGATGTCTGATTTTAAGGATCTCAGAAATGGTGCATTTCCTGGAAACTTGGGTGACTCACAATTAACATGGTAACCTTCCTTTGTATGTATCACAAACCGTTCGCA
TTACTCTACTCGTTAGATGCCTGTTATCTGTTTTCAGTTGCTTCGCTTTGTAATGGTACGATTACAATTTTAACGTTCGATCAAACTATCATGAAAGCTGGACTGGCTAC
TATTACAGAATGATTCTAATGCAAGGCTATTATTTTTTCTTAGTACAATTGAAATGGGTAGAGAGGATTCAAACTCCAAATATCATGGCTGGTTACTAACACACTCATGT
GTGAATGTATGAATGGAATTGTACTCGTTTTGACATGACATTATATTATTGAAATCCCTAGTATTATTATGTTCATTGTATTATTGTATTGAATGTGTAACCTACCTTCA
CCAATAGACCTTTGAAATGTCAAGTTTTGAAATTGAAGGGGGTGTAATTGAGGTGTTAGATGAACTTTAGATGGACCACAACGGTAATGTTTCCTTTTCAACATCCTAAT
GGAGTTTGGTGATACATCAAAGAAAATGCTTTAAATTTTATTGTAAACATTGTTGAATGCCCTTTTTCCCACTTGGTTCTGATTCGACGTTTCAGATGGTTCCTTCTAAT
TAGAAATGTCAAATTCGGCTCAACTCACCATTATTTATATTTGTACTTCCAGAGACCCTTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATVGHARSTSWFNQKIVDPLLQILQRGAEPKQLAFSAALGITLGLFPICGVTVFLCGFAIAFLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISGGPRFPFTPDA
LKKVFTGEASHEVLLSIAHLVRFLLDSFISAVHAG