CuGenDBv2

Gene ID	CsGy2G024720
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome location	Gy14Chr2:32400139..32400991
RNA-Seq Expression	CsGy2G024720
Synteny	CsGy2G024720
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7015908.1 hypothetical protein SDJN02_21012, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

5.01e-101

81.12

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XP_008441227.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485423 [Cucumis melo]

2.27e-116

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        FGFQDWRKSNRQN QRDPFFDAFLECSKEPTNAA VDAELWSG SNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT  SSFDLLNQR+GG
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XP_011649907.1 uncharacterized protein LOC105434677 [Cucumis sativus]

6.42e-132

100

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XP_023549797.1 putative protein TPRXL [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.34e-100

79.5

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        MFQSSRR+HSFSS+SSS+     S SSSSSSSRGS YFP++SPFSAAATP+R+FSG+IPFSWEHLPGIPKKQSPARLRR SASPL+S LPLPPNS+T  S
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XP_038885392.1 uncharacterized protein LOC120075791 [Benincasa hispida]

2.11e-119

92.89

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        FQDWRKSNRQN+QRDPFFDAFLECSKEP+ AAAVDAELWSGG  SNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT RSSFDLLNQR+GG
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LQP3 Uncharacterized protein

2.56e-94

98.57

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        S +HLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFGFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDR
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        FGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
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A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC103485423

1.10e-116

92.89

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A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein

1.10e-116

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A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC111456137

1.30e-97

80.4

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        MFQSSRRT SFSS+S S+S SSSSSSSRGSYYFPDDSP SAA TPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKKQSPARLR  SASPL+S LPLPP STT  SSKRFG
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        F DWRKSNRQN+QRDPFFDAF+ECSKEP+ A A +    AELW+ GSNGKA++RSLSDRFGFLN  SSCKRTCGVSESIVY PR  RSSFDLLN R GG
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A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC111487739

7.26e-97

79.4

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Query:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVD----AELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        F DWRKSNRQN+QRDPFFDAF+ECSKEP+ A A +    AELW+ GSNGKA++RSLSDRFGFLN YSSCKRTC VSESIVY PR  RSSFDLLN R+GG
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G22680.1 unknown protein

7.7e-21

43.01

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        +RR++S  FSS  + ++  S SSSS  S  F  +SP    ATP+      IPFSWE LPG PK+ S  R        LS+ LPLPP+ +  S + R    
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Query:  DWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
          +K+    A RDPF  A +ECSK     A  D E  +GG + K + +S S   G LNLYSSC+R C VSESIVYLP++  +S+D L+  T G
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AT1G71970.1 unknown protein

4.4e-24

40.58

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Query:  FQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPP--NSTTPSSSKRF
        F +     S  S SSS+S SS SS S  S  FP DSP ++ ATP+R     +PFSWE LPG PK  S     R +    +  LPLPP  N + P++ K+ 
Subjt:  FQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPP--NSTTPSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNR-QNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAEL------------WSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTER-SS
           +  K N      +DPF  A LECSK+    +  D ++             SGGS+      S+ DRFG +NLY SC+RTC V+ESIVYLPR  + +S
Subjt:  GFQDWRKSNR-QNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAEL------------WSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTER-SS

Query:  FDLLNQR
        +D L  R
Subjt:  FDLLNQR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCTCTTCCGCTTCTTCTTCTAATTCCCTTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTCCCCGAT
GATTCTCCTTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCCGGAATCCCCAAAAAACAGTCTCCGGCC
AGGCTCCGACGAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCTTCTTTCCTTCCTTTACCTCCCAATTCCACCACCCCATCCTCTTCCAAACGCTTCGGGTTTCAAGACTGGAGG
AAATCGAACCGCCAAAATGCACAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCAACGCTGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGT
GGCGGTAGCAATGGTAAGGCGATTACAAGAAGTCTGAGCGATCGTTTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGGACATGCGGCGTTTCGGAATCCATC
GTTTACCTTCCTAGAACGGAAAGGAGTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGCACCGGCGGTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TGGGATTCCCAAATTTCTCTGAAAAAGAGAATGTGAAGAATCAAAGAGAAAAGAAAAAGAAAGTGAATACAATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCT
CTTCCGCTTCTTCTTCTAATTCCCTTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTCCCCGATGATTCTCCTTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCC
GATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCCGGAATCCCCAAAAAACAGTCTCCGGCCAGGCTCCGACGAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCTT
CTTTCCTTCCTTTACCTCCCAATTCCACCACCCCATCCTCTTCCAAACGCTTCGGGTTTCAAGACTGGAGGAAATCGAACCGCCAAAATGCACAGCGAGATCCTT
TCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCAACGCTGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGTGGCGGTAGCAATGGTAAGGCGATTACAAGAAGTC
TGAGCGATCGTTTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGGACATGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTTCCTAGAACGGAAAGGAGTTCGTTCG
ATCTGCTTAACCAGCGCACCGGCGGTTGAAGAAGAACAAAAAAAAGAAAAACAAGAGATAAGTTGGTGATTTGATTAAATGTTTGTTTAGTTTAATTAATCTCTT
TGTTTGTGGTGAAATGATTATGATTATGATTATGATTATGAATATGGAATGATGGCTTAATCCCAATTTGGGTTTGTTAATCTGTGATTACTGCGCTGGATTTGT
TTGTGAAATTTAC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFGFQDWR
KSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

CsGy2G024720 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome