; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy2G025240 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy2G025240
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationGy14Chr2:32745905..32748321
RNA-Seq ExpressionCsGy2G025240
SyntenyCsGy2G025240
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056568.1 zinc finger protein 511 [Cucumis melo var. makuwa]2.15e-16890.67Show/hide
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KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.23e-16191.97Show/hide
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XP_004138793.1 zinc finger protein 511 [Cucumis sativus]7.68e-178100Show/hide
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XP_008441334.1 PREDICTED: zinc finger protein 511 [Cucumis melo]2.88e-17397.59Show/hide
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XP_023522582.1 zinc finger protein 511-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.10e-16191.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein3.72e-178100Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5111.39e-17397.59Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5111.04e-16890.67Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5111.47e-15991.16Show/hide
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A0A6J1JHI5 zinc finger protein 5111.21e-15890.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5111.5e-2134.67Show/hide
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        DS FQ  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R  H+V  H + A F F K
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5117.6e-2633.04Show/hide
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        ++P + RF  +  +F  G++ R +  + +     +D++           SE  C I GC     +L+ +E HYN+ H   CS C R +P++RLL +H+ E
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         HDS FQ  +A    MYECLVEGCGLKFK+ K R  HL+  H + A F F K     +   +KT +K+ +      + ++ E +E MD            
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        + +   K   S   PSSI FG+   RG
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Q8NB15 Zinc finger protein 5111.1e-2133.02Show/hide
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        RF  +  FF  G+V+R +  + V + + +  EK ++   A        C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R +P+  LL  H+ E HDS 
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        FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R  H+V  H + A F F K   P K +   +       G R E   ME+ +E +         +       P
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Query:  SSISFGRRHTRG
        S+I FG+   RG
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Q9V574 Protein lethal(2)k102012.1e-1229.63Show/hide
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        D+ +   + SC  C ++ PT+ LL LH++E HD +F A V RG   M+ C +E C +KF + + R  H +  HK  A++ F            K   KQ 
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Query:  SQGREETSKMEVENEIMD-GLISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRGLTFVPRAVQREKVSD
         QG+ + + MEV+  I +   +  V   S    T  S   G+    G T       +E ++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding2.4e-9165.88Show/hide
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        M V++  E  FP W P++RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH         I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RV
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        YPTSRLLS+H+SEAHDSFFQAKV+RGYDMYECLVEGCGLKFK+YK+RH+HL+DKHKF  +FEFFKK   SKK+R+K  R+  S+ + E  K       ME
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Query:  VENE-IMDGLISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRGLTFVPRAVQREKVSDSSTA
        VE++  +DGL+S +S L+TSD+TPS++SFGRRH RGLTFVPR+V REK ++SS+A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTGAATCACAATCAGAGTTCCCGTGCTGGAAGCCTCTCCAACGGAGGTTCGATCCTGATTCTCCCTTTTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGC
CAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTCGCAGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACT
TGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAGAGTTTACCCGACATCACGCCTACTTAGTTTACATGTCTCT
GAGGCGCATGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTATAAAAGCAGACACCA
GCATCTAGTGGACAAGCATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAAAAACAAAGACAGAAAACGTATCGTAAACAAGCCAGTCAAGGAA
GGGAAGAAACCTCCAAAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACTTCGGACTCAACTCCTTCGTCAATCAGCTTTGGC
CGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGAGAAAAAGTGTCAGACTCATCAACAGCTGGAACAAAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACGGGATCGAGCTCCGATTAGGGGATTTCGTCGATTGCGGGCCTTCAAAGTTCAAATTAAATTGAAAAAGTAAGTAAGAACAGATTCTTCCATCTGCAACGGTCCATT
GCACTTCCATGGAAGTTGAATCACAATCAGAGTTCCCGTGCTGGAAGCCTCTCCAACGGAGGTTCGATCCTGATTCTCCCTTTTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAA
ATCTTAGCCAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTCGCAGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGG
TGCACACTTGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAGAGTTTACCCGACATCACGCCTACTTAGTTTAC
ATGTCTCTGAGGCGCATGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTATAAAAGC
AGACACCAGCATCTAGTGGACAAGCATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAAAAACAAAGACAGAAAACGTATCGTAAACAAGCCAG
TCAAGGAAGGGAAGAAACCTCCAAAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACTTCGGACTCAACTCCTTCGTCAATCA
GCTTTGGCCGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGAGAAAAAGTGTCAGACTCATCAACAGCTGGAACAAAGAGATGAAAGTAGTGTATC
TAGACCAAATGATATAGGAAATGGTAGGGGAGATATCGAGTTTCAAGATGGCAGAACTGATTCCTATTTGTCTCAGTGGAGGAATCAATGTCGGTTGAAATGGATGGATG
CCACAATGTTGATAGTCAAAGTTAGCAATGTCTTTAGATGGATTAGTTAGTTTGTTACGTACTTCAAATAGACTGAATATTGATGAAAACATTGTTTGAAATGTTTGAGT
CATAGAGTCTTGGGTAGTAAATCACCTCTTGGGATTAGTTGGACTCTTAATCTTAACCGTGCTTGTGGAGAATTGATGAGGATTGGGAAGGTATTTATTTAGCTTTTCTA
TTCAATTTAAGACATAGAATACCAAGAAACAGAACTTCACTAAGTTGGAAAAGTTTCCATTGAGGGAACCTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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