; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy3G024273 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy3G024273
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionCell wall protein DAN4-like
Genome locationGy14Chr3:24280146..24280475
RNA-Seq ExpressionCsGy3G024273
SyntenyCsGy3G024273
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056279.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]6.04e-2877.06Show/hide
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KAA0056285.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]2.24e-2673.64Show/hide
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        SR F+NGFFG
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KAE8650786.1 hypothetical protein Csa_017544 [Cucumis sativus]7.94e-3682.05Show/hide
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        GS S ETSR F+NGFFG
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KGN58213.1 hypothetical protein Csa_017497 [Cucumis sativus]1.53e-5098.17Show/hide
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XP_031737565.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]1.00e-3682.2Show/hide
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        +GS S ETSR F+NGFFG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8Q5 Uncharacterized protein7.42e-5198.17Show/hide
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A0A0A0LB81 Uncharacterized protein1.98e-3279.65Show/hide
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         ETSR F+NGFFG
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A0A1S3BPQ2 cell wall protein DAN4-like3.18e-2371.82Show/hide
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        ETSRLFSNGF
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A0A5D3C1H7 Cell wall protein DAN4-like1.09e-2673.64Show/hide
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        SR F+NGFFG
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A0A5D3C1I1 Cell wall protein DAN4-like2.93e-2877.06Show/hide
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Query:  RLFSNGFFG
        RLF+NGFFG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTACCAATCTCTTGCTTTCCTGGCTCTCATCATTGTCGCCGTCACTGGTGCTGTTGCTCAAGGTCCTACCTCCTCCACTCCAGCTCCCACGACCTCCTCCACTCC
AGCTCCCACGACCTCCTCTTCCTCTTCTTCATCTTCACTCGACTCAACCACCACCACCACCACCACGTCCTCAGGTTCCTCTATCGATTCTCCATCAATCTCAGCAGCTC
CAGGATTATCACCCGATTCCTCTGCTCAATCACCAACGACCGCAACATCTCCCTCCGGTTCTCCTTCTATTGAGACTTCTCGCTTGTTTTCAAATGGTTTTTTTGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CAGGATTATCACCCGATTCCTCTGCTCAATCACCAACGACCGCAACATCTCCCTCCGGTTCTCCTTCTATTGAGACTTCTCGCTTGTTTTCAAATGGTTTTTTTGGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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