; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy3G024285 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy3G024285
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionmucin-1
Genome locationGy14Chr3:24315392..24316018
RNA-Seq ExpressionCsGy3G024285
SyntenyCsGy3G024285
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066977.1 mucin-1 [Cucumis melo var. makuwa]1.16e-7281.9Show/hide
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KAG6581073.1 hypothetical protein SDJN03_21075, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.43e-3853.21Show/hide
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                      SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPSP  DAAD+P
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         ADGP+ ADGP+ ADGP+ ADG ++ DSPADSP  D  SGT  LKLTSA V G VA    G FAF
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XP_008450043.1 PREDICTED: mucin-1 [Cucumis melo]2.02e-7382.38Show/hide
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        TDSP+DSPA     ADSPAD+ ADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPTA     ADGP AADGPTA       DSPADSPA D+ SSGTDLKLTSA+V G
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        V+A  GF+AF
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XP_022934589.1 mucin-1-like [Cucurbita moschata]1.63e-4156.18Show/hide
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        MASQ+ VLVFALIF+AAVAG FAEAPT +PS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                   +PAG+P  +P  T                 
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          SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPSP  DAAD+P ADGP+ ADGP+
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         ADGP+ ADG ++ DSPADSP  D  SGT  LKLTSA V G VA  G FAF
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XP_031737954.1 classical arabinogalactan protein 11 [Cucumis sativus]5.27e-110100Show/hide
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        ATVGFFAF
Subjt:  ATVGFFAF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDP4 Uncharacterized protein1.13e-8762.28Show/hide
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        DSPSDSPASDSPVADSPADSPADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPTADGPAAADGPTAADGPTAADGP                               
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                                                                                                       VAADS
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        PADSPASDESSGTDLKLTSAMVVGVVATVGFFAF
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A0A1S3BND1 mucin-19.79e-7482.38Show/hide
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A0A5A7VIK3 Mucin-15.63e-7381.9Show/hide
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        V+A  GF+AF
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A0A6J1F318 mucin-1-like7.88e-4256.18Show/hide
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          SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPSP  DAAD+P ADGP+ ADGP+
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         ADGP+ ADG ++ DSPADSP  D  SGT  LKLTSA V G VA  G FAF
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A0A6J1J779 mucin-1-like4.14e-3149.08Show/hide
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        MASQ+VLVFALIF+AAVAG FAEAPT SPS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                                                  
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Query:  ---------SPAGSPKASPETTSPSPAASSPSSSSDAPTSNSPTSSPTSSPSVSPSPATDSPSDSPA-SDSPVADSPADSPADTPTAASPDSDVSSPPSP
                 +PA +P AS E+ SPSPAAS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSP TDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPSP
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          DAAD+P ADGP+  DGPT+             DSPAD+P  D  SGT  LKLTSA V G VA    G FAF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCTCCTGTTGCTGACTCTCCTGCTGACAGTCCTGCAGACACCCCGACTGCTGCTTCACCAGATTCCGATGTCTCTTCTCCTCCATCACCTGATGCCGCTGATGCCCCCAC
TGCTGATGGTCCTGCTGCTGCCGATGGCCCTACTGCCGCCGATGGCCCTACTGCCGCCGATGGCCCTGTTGCCGCCGATTCTCCTGCTGATTCACCCGCCAGTGACGAAA
GCAGCGGTACAGATCTGAAACTCACCTCCGCCATGGTCGTTGGTGTCGTTGCCACTGTTGGATTCTTTGCATTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTCAAACTGTTCTTGTTTTTGCTTTGATCTTCCTTGCCGCTGTTGCCGGAGTTTTTGCGGAGGCACCGACCGAATCTCCTTCAACATCTCCCTCACCTAAAGC
TTCCCCATCGGACTCTGAATCGCCTTCACCGTCTTCTTCTTCTCCTGCAGGCTCTCCAAAGGCCTCACCTGAGACGACATCCCCATCCCCGGCAGCTTCTTCTCCATCTT
CGTCCTCTGATGCTCCAACCAGCAATTCGCCCACCAGCTCTCCAACATCCTCCCCTTCCGTTTCTCCTTCTCCTGCCACTGACTCCCCCTCTGACTCTCCTGCTTCTGAC
TCTCCTGTTGCTGACTCTCCTGCTGACAGTCCTGCAGACACCCCGACTGCTGCTTCACCAGATTCCGATGTCTCTTCTCCTCCATCACCTGATGCCGCTGATGCCCCCAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SPVADSPADSPADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPTADGPAAADGPTAADGPTAADGPVAADSPADSPASDESSGTDLKLTSAMVVGVVATVGFFAF