; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy3G024690 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy3G024690
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionVesicle transport protein
Genome locationGy14Chr3:24936134..24941547
RNA-Seq ExpressionCsGy3G024690
SyntenyCsGy3G024690
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0016192 - vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0000139 - Golgi membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007305 - Vesicle transport protein, Got1/SFT2-like
IPR011691 - Vesicle transport protein SFT2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004145710.1 vesicle transport protein SFT2B [Cucumis sativus]6.01e-104100Show/hide
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XP_008441622.1 PREDICTED: vesicle transport protein SFT2B [Cucumis melo]5.27e-9693.17Show/hide
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XP_038880533.1 vesicle transport protein SFT2B [Benincasa hispida]7.18e-9491.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LC39 Vesicle transport protein2.91e-104100Show/hide
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A0A1S3B3W0 Vesicle transport protein2.55e-9693.17Show/hide
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A0A6J1CHR6 Vesicle transport protein1.93e-9189.44Show/hide
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A0A6J1G0G6 Vesicle transport protein3.06e-8887.58Show/hide
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A0A6J1HVF1 Vesicle transport protein3.06e-8887.58Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O95562 Vesicle transport protein SFT2B6.4e-1839.04Show/hide
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        L  +D+ED   L+ V          R+  F  C   G++C +L  ++   P K     AV + FGN+ ++GST FL GP +Q++ MF+  R++AT + L 
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        C  L L  A W HNK L +I  I +  AL WYSLS+IPFAR  V +
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Q5SSN7 Vesicle transport protein SFT2A5.6e-1441.73Show/hide
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        D  SL+   RL  F  C   G+    L   LL     +KL AV +  GN+ A+ ST FL GP +Q++ MF++ R+LAT I L C+V  L  ALW   K L
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         ++  I +  ++ WYSLSYIP+AR  V
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Q5U3Y5 Vesicle transport protein SFT2A2.5e-1442.52Show/hide
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        D  SL+   RL  F  C   G+   IL   LL     +KL AV +  GN+ A+ ST FL GP +Q++ MF++ R+LAT I L C+V  L  ALW   K L
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         ++  I +  ++ WYSLSYIP+AR  V
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Q8VD57 Vesicle transport protein SFT2B2.1e-1637.67Show/hide
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        L  +D+ED   L+ V          R+  F  C   G++C +L  L+   P K     AV +  GN++++GST FL GP +Q++ MF+  R++AT + L 
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        C  L L C+ ++ NK L +I  I +  AL WYSLSYIP+AR  V +
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Q8WV19 Vesicle transport protein SFT2A3.9e-1543.31Show/hide
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        D  SL+   RL  F  C   GV   IL   LL     +KL AV +  GN+ A+ ST FL GP +Q++ MF++ R+LAT + L C +  L  ALW H K L
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         V+  I +  ++ WYSLSYIP+AR  V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G26550.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family2.9e-0527.5Show/hide
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        S+ + + L  FG  L  GV  + ++  +F       P K A+ F  G    +GS   L GP+ Q+  M    R+ +T  ++  +V  +  ++ +H+ IL+
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Query:  VIAIISEICALIWYSLSYIP
        V+  + ++ AL++Y +SY P
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AT5G23550.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family1.3e-3753.02Show/hide
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        DEE S S + ED    C+LT  QR Y F  CL+ G+ C +LS+LVF  P+K  + F  GN++A+GST FL GP++Q+ MM D  RI ATA+YL  +++AL
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         CAL++ NK+LT++AII E   LIWYSLSYIPFAR MVS++ +   DTE
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AT5G24170.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family1.1e-4966.44Show/hide
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        + S L++ SE LC+L+  QR+Y F   L  G++ M LS++VF  P+K A+LF FGNVLA+GST FL GP QQ+ MMFD VR LAT+IY+GCVV+ALICAL
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Query:  WIHNKILTVIAIISEICALIWYSLSYIPFARRMVSQLMIRFCDTEL
         IH+KILTV+AI+ EICALIWYSLSYIPFARRMVS++MIR CDTEL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGAAGCTCAGCGAAGGCGTATTTGTCGATGAAGAGCGTAGTCAGAGCTTGTTGGATGAAGATTCAGAAGACCTATGCTCTCTAACTGCTGTACAGAGACTGTACGC
TTTTGGAGGCTGCTTGACCGGGGGCGTGGTTTGCATGATTTTGTCATTACTTGTTTTTGCTAAGCCACTCAAACTTGCTGTACTTTTTGCATTTGGCAATGTTTTGGCAG
TTGGAAGCACAACTTTCCTATTTGGACCTAGGCAACAAATAAGAATGATGTTTGATTCTGTTCGTATTCTTGCGACAGCTATTTACCTAGGATGTGTTGTTCTAGCTCTT
ATATGTGCTCTCTGGATCCACAATAAGATATTGACAGTGATTGCAATAATAAGCGAGATATGTGCACTAATATGGTATAGTTTGAGCTATATCCCTTTTGCCCGGAGGAT
GGTCTCTCAATTGATGATCCGATTTTGTGATACGGAACTATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTATCATTCATCAATGAAGCAGTTTTGACTAAAAATAATTTTTAATGCAAAATTGTCGAATTGAAAAAAAAAAACCAAAATTAAATGAAATTAGGCATTGAGAAAAAGAA
AGTTGCTTTTTATAGGGGATTTTAGGATTGTTTATGGACGATCAATCACGATTCCCCTGGTCGACACAAGACAACGTGAGCTGAACCCCAATCCTGAATTCCTTTCAAAA
TGTGGAAGCTCAGCGAAGGCGTATTTGTCGATGAAGAGCGTAGTCAGAGCTTGTTGGATGAAGATTCAGAAGACCTATGCTCTCTAACTGCTGTACAGAGACTGTACGCT
TTTGGAGGCTGCTTGACCGGGGGCGTGGTTTGCATGATTTTGTCATTACTTGTTTTTGCTAAGCCACTCAAACTTGCTGTACTTTTTGCATTTGGCAATGTTTTGGCAGT
TGGAAGCACAACTTTCCTATTTGGACCTAGGCAACAAATAAGAATGATGTTTGATTCTGTTCGTATTCTTGCGACAGCTATTTACCTAGGATGTGTTGTTCTAGCTCTTA
TATGTGCTCTCTGGATCCACAATAAGATATTGACAGTGATTGCAATAATAAGCGAGATATGTGCACTAATATGGTATAGTTTGAGCTATATCCCTTTTGCCCGGAGGATG
GTCTCTCAATTGATGATCCGATTTTGTGATACGGAACTATAGACAATGAAACATGCGATAATGATTGACGATTCAATGTTTCAAGATCTGAGATTGTTTTTTGTCTTGGT
TTTTTTTCACATTTTAGTGAGCACAACACCGGTTGGAGATTTGTTTTTTTCTTATTTTTTTTGGTCGAAGTTGAGTTTGTCTACATAAATGTATAATCCAAAAGTCAGTT
CAATGCTTGTGCTAATTTTTTAAATATAATAGCATTCTTTTCAAAATATTACCTCAGGTACCTCTCTTTATATCTCAATGGGAAGTATTTTCCGGGTAAAACAAAGTTAG
AACCTTTAGAAAGGGAGTATGAAGCCCAATCATCATGCTCTGAGCTTTTATCTGCCTGAGTTACTATAGGATATTACAAAAAAACACAAATTGGTAATATTTTACACAAA
TGTATCAAATGGGCCATAATATTACACAATTATAGGCCCAATTTACATATTTGCCCATTAGTCAGTTTTTTCACAAAATATACCTATTATTATTAATATAGAAAATGAGA
GGAAATTGTGCAACATTAAAATAGGAAACTTCTTTACCGTTTTCTCACTTTTCATATTCAACAAAAAGCTTGTCATTTCAACAGTCAAAGAAGTGATTCGAGTTTGGGGA
TTGTTGTGAAGTTGAAGCGTTTGAGCGATCTCGACGGTGAATATTCTCCGACCAGTTAATTTGTTTTCCGACGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWKLSEGVFVDEERSQSLLDEDSEDLCSLTAVQRLYAFGGCLTGGVVCMILSLLVFAKPLKLAVLFAFGNVLAVGSTTFLFGPRQQIRMMFDSVRILATAIYLGCVVLAL
ICALWIHNKILTVIAIISEICALIWYSLSYIPFARRMVSQLMIRFCDTEL