CuGenDBv2

Gene ID	CsGy3G030890
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	60S ribosomal protein L12
Genome location	Gy14Chr3:30750816..30751316
RNA-Seq Expression	CsGy3G030890
Synteny	CsGy3G030890
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137822.1 60S ribosomal protein L12-1 [Cucumis sativus]

2.62e-110

100

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_004143249.1 60S ribosomal protein L12-1 [Cucumis sativus]

7.51e-110

99.4

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

3.06e-109

98.8

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQVV+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

1.25e-108

97.59

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQVV+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

8.77e-109

98.19

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQVV+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KF33 Uncharacterized protein

3.64e-110

99.4

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A0A0LAX8 Uncharacterized protein

1.27e-110

100

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A1S3BLM0 60S ribosomal protein L12-1

3.64e-110

99.4

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A5D3DNF2 60S ribosomal protein L12

3.64e-110

99.4

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

1.48e-109

98.8

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQVV+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

1.5e-78

89.76

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQVV+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        H+G+ISLDDVIEIA++M+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

4.7e-64

72.29

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DP++V  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKLT+QNRQA VSVVPSA+ALVIKALKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P D+Q+EI +G++EIPQ+
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

P50883 60S ribosomal protein L12-1

6.1e-80

89.16

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

1.0e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

1.4e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

4.3e-81

89.16

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

9.7e-81

88.55

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

7.4e-81

88.55

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTCCGAAGTTGGACCCTAGTCAGGTCGTTGAAGTCTTCGTTCGCGTCACCGGAGGTGAGGTCGGAGCCGCTAGTTCTCTCGCTCCCAAGATCGGTCCTCTCGGTCT
TTCCCCTAAGAAGATTGGAGAAGACATTGCTAAAGAGACCGCCAAGGAATGGAAAGGTCTTAGGGTTACTGTAAAGCTCACCGTCCAAAATCGTCAGGCGAAGGTCTCCG
TTGTTCCTTCTGCGGCGGCTTTGGTAATTAAGGCTTTGAAGGAGCCGGAACGTGACAGGAAGAAAACTAAGAACATCAAGCATAATGGGAATATTTCTCTTGATGATGTG
ATTGAGATTGCTAGGGTTATGCGGCCCAGGTCGATGGCTAAGGATCTCTCTGGCTCCGTCAAGGAGATTCTTGGTACTTGTGTGTCTGTTGGCTGTACTGTCGATGGCAA
GGACCCGAAGGATCTTCAACAGGAGATTTCTGATGGCGATGTTGAAATCCCCCAAGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKLDPSQVVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIKHNGNISLDDV
IEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

CsGy3G030890 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome