; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy3G031380 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy3G031380
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionaquaporin TIP1-1-like
Genome locationGy14Chr3:31003919..31006274
RNA-Seq ExpressionCsGy3G031380
SyntenyCsGy3G031380
Gene Ontology termsGO:0006833 - water transport (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0015250 - water channel activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000425 - Major intrinsic protein
IPR022357 - Major intrinsic protein, conserved site
IPR023271 - Aquaporin-like
IPR034294 - Aquaporin transporter


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001380717.1 aquaporin TIP1-2 [Cucumis melo]8.24e-17598.81Show/hide
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XP_022934068.1 aquaporin TIP1-1-like [Cucurbita moschata]2.39e-15889.72Show/hide
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XP_038903008.1 aquaporin TIP1-1-like [Benincasa hispida]7.27e-16994.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LB57 Tonoplast intrinsic protein2.41e-176100Show/hide
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A0A1S3B724 aquaporin TIP1-1-like3.99e-17598.81Show/hide
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A0A6J1F6L9 aquaporin TIP1-1-like1.16e-15889.72Show/hide
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A0A6J1IY97 aquaporin TIP1-1-like6.98e-16090.12Show/hide
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A0A6P5YRQ3 aquaporin TIP1-1-like2.54e-13476.28Show/hide
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        T+LRGI+YWIAQLLG+ VA LLLKF    +++  F  ++GVG+W AFVFEIVMTFGLVYTVYATA+DPK+G +GVIAP+AIGLIVGANIL GG F GASM
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64964 Aquaporin TIP1-12.7e-9569.57Show/hide
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        T+ RG+LYW+AQLLG+ VA  LL+F     A TG     GV +WEA V EIVMTFGLVYTVYATA+DPK+G +G IAPIAIG IVGANILVGG F GASM
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P25818 Aquaporin TIP1-11.1e-10174.39Show/hide
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        PAV+SW+W NHW+YWAGPL+GGG+AG++YE+FFI  THE LPT +Y
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P42067 Probable aquaporin TIP-type3.9e-9471.14Show/hide
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        Y IAQLLG++V + LL FV    ++  F  + GVG+  A V EIVMTFGLVYTVYATA+DPK+G +G+IAPIAIG IVGANILVGG FTGASMNPAV+FG
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        PAV+SWSW+NHW+YWAGPLIGGG+AG+VYE+ FI  THE LPT +Y
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P50156 Probable aquaporin TIP1-17.1e-9671.54Show/hide
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        IAVG  +E  HP ALKAALAEFISTLIFVFAGQGSG+AFSKLT    TTPAGL+ A++AH FALFV VS  ANISGGH+NPAVTFGA +GGNIT+ RG+L
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        YWIAQLLG+ VA  LL+F    +A TG     GV +WEA V EIVMTFGLVYTVYATA+DPK+G +G IAPIAIG IVGANILVGG F GASMNPAV+FG
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        PA++SWSW + W+YW GPLIGGGLAG++YE+ FI  THE LPT +Y
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Q9FY14 Probable aquaporin TIP-type1.4e-9671.95Show/hide
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        IAVG P+EATHP  LKA LAEFIST IFVFAG GSG+A++KLT++   TPAGL+ ASIAH FALFV VS  ANISGGH+NPAVTFGA +GGNIT+LRGI+
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        Y IAQLLG++VA+ LL FV    ++  F  + GVG+  A V EIVMTFGLVYTVYATA+DPK+G +G+IAPIAIG IVGANILVGG FTGASMNPAV+FG
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        PAV+SWSW+NHW+YWAGPLIGGG+AG+VYE+ FI  THE LPT +Y
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17810.1 beta-tonoplast intrinsic protein8.9e-7858.26Show/hide
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        GR +EATHP +++A LAEF+ST +FVFAG+GS LA  KL      H    TP GLV+ ++AH  ALF  VS A N+SGGH+NPAVTF AL+GG I+++R 
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Query:  ILYWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASMNPAVA
        I YW+AQL+GA++A LLL+     +   GF   +GV      + EI++TF LVY VY+TAIDPKRG +G+IAP+AIGLIVGANILVGGPF GASMNPA A
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Query:  FGPAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGFTHEP
        FGPA++ W W+NHWIYW GP IGG LA ++YE   I   +EP
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AT1G73190.1 Aquaporin-like superfamily protein5.8e-7756.03Show/hide
Query:  GRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKL-----THNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNITILRG
        GR +EATHP +++A LAEF+ST +FVFA +GS L+  KL      H    TP GL++ ++AH FALF  VS A N+SGGH+NPAVTFGAL+GG +T +R 
Subjt:  GRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKL-----THNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNITILRG

Query:  ILYWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASMNPAVA
        I YWIAQLLGA++A LLL+     +   GF   +GVG     V EI++TFGLVY VY+T IDPKRG +G+IAP+AIGLIVGANILVGGPF+GASMNPA A
Subjt:  ILYWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASMNPAVA

Query:  FGPAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGF---------THEPLPTAEY
        FGPA++ W W +HWIYW GP IG  LA ++YE   I            H+PL   +Y
Subjt:  FGPAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGF---------THEPLPTAEY

AT2G36830.1 gamma tonoplast intrinsic protein8.0e-10374.39Show/hide
Query:  IAVGRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKLTHNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNITILRGIL
        IA+GRP+EAT P ALKAALAEFISTLIFV AG GSG+AF+KLT N  TTP+GLV A++AH F LFV VS  ANISGGH+NPAVTFGA +GGNIT+LRGIL
Subjt:  IAVGRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKLTHNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNITILRGIL

Query:  YWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASMNPAVAFG
        YWIAQLLG+VVA L+LKF    +A+  F  +AGVG+  AFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPK G +G IAPIAIG IVGANIL GG F+GASMNPAVAFG
Subjt:  YWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASMNPAVAFG

Query:  PAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGFTHEPLPTAEY
        PAV+SW+W NHW+YWAGPL+GGG+AG++YE+FFI  THE LPT +Y
Subjt:  PAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGFTHEPLPTAEY

AT3G26520.1 tonoplast intrinsic protein 21.8e-9470.47Show/hide
Query:  MPFQRIVIAVGRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKLTHNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNI
        MP + I I  G  EE  HP AL+AALAEFISTLIFVFAG GSG+AF+K+T N  TTP+GLV A++AH F LFV VS  ANISGGH+NPAVTFG LLGGNI
Subjt:  MPFQRIVIAVGRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKLTHNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNI

Query:  TILRGILYWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASM
        T+LRGILYWIAQLLG+V A  LL F      I  F  +AGVG   A VFEIVMTFGLVYTVYATA+DPK G +G IAPIAIG IVGANIL GG F+GASM
Subjt:  TILRGILYWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASM

Query:  NPAVAFGPAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIG-FTHEPLPTAEY
        NPAVAFGPAV+SW+W NHW+YWAGPLIGGGLAGI+Y+  FI    HE LPT +Y
Subjt:  NPAVAFGPAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIG-FTHEPLPTAEY

AT4G01470.1 tonoplast intrinsic protein 1;33.7e-9266.93Show/hide
Query:  MPFQRIVIAVGRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKLTHNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNI
        MP  R  IA+G P EA+ P A++AA AEF S +IFVFAGQGSG+A+ KLT + P TPAGLV AS++H FALFV VS  AN+SGGH+NPAVTFGA +GGNI
Subjt:  MPFQRIVIAVGRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKLTHNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNI

Query:  TILRGILYWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASM
        T+LR ILYWIAQLLGAVVA LLLK     +    F  + GV  W A VFEIVMTFGLVYTVYATA+DPK+G++G+IAP+AIGLIVGANILVGG F GASM
Subjt:  TILRGILYWIAQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASM

Query:  NPAVAFGPAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGFT-HEPLPTAEY
        NPAV+FGPAV+SW W NHW+YW GP IG  +A IVY+  FIG   HEPLP+ ++
Subjt:  NPAVAFGPAVISWSWANHWIYWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGFT-HEPLPTAEY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCGTTTCAAAGGATAGTTATCGCCGTCGGTCGGCCGGAGGAGGCCACCCATCCCGCTGCCCTGAAGGCCGCTTTGGCCGAGTTTATTTCTACTCTTATCTTCGTTTT
CGCCGGCCAAGGTTCCGGTCTCGCTTTCTCTAAGCTCACCCATAATTCACCTACAACTCCTGCTGGCCTCGTCATCGCCTCCATAGCTCATGGCTTTGCCCTTTTTGTCG
GTGTCTCCACCGCCGCAAACATCTCCGGCGGACACCTTAACCCCGCCGTGACTTTCGGAGCTTTGCTCGGCGGTAACATCACTATCCTTCGCGGCATTCTTTATTGGATC
GCTCAGCTCCTCGGCGCCGTCGTCGCTAACTTGTTGCTCAAGTTCGTGATCGTCGACGTGGCAATTACGGGATTCTTGCCAACAGCAGGGGTTGGAATATGGGAAGCATT
TGTATTCGAGATTGTAATGACATTCGGTTTAGTCTACACTGTCTACGCCACCGCCATTGATCCCAAAAGAGGTGAGGTGGGAGTCATTGCACCCATCGCCATCGGTTTAA
TCGTGGGCGCTAACATTTTGGTGGGCGGCCCATTCACCGGTGCCTCCATGAACCCTGCCGTCGCCTTCGGACCTGCCGTCATCTCGTGGTCTTGGGCTAACCATTGGATC
TACTGGGCTGGCCCTCTCATCGGCGGCGGGTTAGCTGGCATTGTGTACGAACTCTTCTTCATTGGGTTCACCCACGAGCCTCTTCCCACTGCAGAGTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGAGAATCGGATTCGTCATATCCACAAAACAAAAAAAATATCACTTCCACTCTTAAAACTCAAACCATGCCGTTTCAAAGGATAGTTATCGCCGTCGGTCGGCCGGAGGA
GGCCACCCATCCCGCTGCCCTGAAGGCCGCTTTGGCCGAGTTTATTTCTACTCTTATCTTCGTTTTCGCCGGCCAAGGTTCCGGTCTCGCTTTCTCTAAGCTCACCCATA
ATTCACCTACAACTCCTGCTGGCCTCGTCATCGCCTCCATAGCTCATGGCTTTGCCCTTTTTGTCGGTGTCTCCACCGCCGCAAACATCTCCGGCGGACACCTTAACCCC
GCCGTGACTTTCGGAGCTTTGCTCGGCGGTAACATCACTATCCTTCGCGGCATTCTTTATTGGATCGCTCAGCTCCTCGGCGCCGTCGTCGCTAACTTGTTGCTCAAGTT
CGTGATCGTCGACGTGGCAATTACGGGATTCTTGCCAACAGCAGGGGTTGGAATATGGGAAGCATTTGTATTCGAGATTGTAATGACATTCGGTTTAGTCTACACTGTCT
ACGCCACCGCCATTGATCCCAAAAGAGGTGAGGTGGGAGTCATTGCACCCATCGCCATCGGTTTAATCGTGGGCGCTAACATTTTGGTGGGCGGCCCATTCACCGGTGCC
TCCATGAACCCTGCCGTCGCCTTCGGACCTGCCGTCATCTCGTGGTCTTGGGCTAACCATTGGATCTACTGGGCTGGCCCTCTCATCGGCGGCGGGTTAGCTGGCATTGT
GTACGAACTCTTCTTCATTGGGTTCACCCACGAGCCTCTTCCCACTGCAGAGTACTGAAAAACTGTATTATTGATCTGTTGTAGTCATTATAACCCCTTGTCTGTCTCTT
CTTTGTTCTACTTTTCTTTTCATTAATCTGTCTTCGTCTTCAACATTTCAATGTTATATCTATTTGAATATGTGGTATTAAATTGATGTGTTTTAATTTATTAATAATGT
GATCTACAGATTCCTTATATATCCAATTCAGTAGAGTTCAGAAATCCATTATTTCCTCGTTCAATTCCTCTAATTCCTGAATTGGCGTAAACACCCTTTTAAGAGTAGCA
CTTAGAAGTTAGAAGGAGATGAAGAAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPFQRIVIAVGRPEEATHPAALKAALAEFISTLIFVFAGQGSGLAFSKLTHNSPTTPAGLVIASIAHGFALFVGVSTAANISGGHLNPAVTFGALLGGNITILRGILYWI
AQLLGAVVANLLLKFVIVDVAITGFLPTAGVGIWEAFVFEIVMTFGLVYTVYATAIDPKRGEVGVIAPIAIGLIVGANILVGGPFTGASMNPAVAFGPAVISWSWANHWI
YWAGPLIGGGLAGIVYELFFIGFTHEPLPTAEY