; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy3G032570 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy3G032570
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationGy14Chr3:31817177..31819461
RNA-Seq ExpressionCsGy3G032570
SyntenyCsGy3G032570
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7028120.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.08e-8596.35Show/hide
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XP_004149195.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]2.70e-8497.01Show/hide
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XP_038903510.1 40S ribosomal protein S14-2-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.53e-8599.24Show/hide
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XP_038903512.1 40S ribosomal protein S14-2-like isoform X2 [Benincasa hispida]7.74e-8496.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP6 Uncharacterized protein1.31e-8497.01Show/hide
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A0A1S3B682 40S ribosomal protein S14-21.31e-8497.01Show/hide
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A0A5D3DNR5 40S ribosomal protein S14-2-like1.31e-8497.01Show/hide
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A0A6J1F6L2 40S ribosomal protein S14-21.31e-8497.01Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-21.31e-8497.01Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S147.2e-6291.79Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S141.2e-6191.67Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-34.2e-6288.81Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-21.9e-6289.55Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-11.6e-6188.06Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein1.1e-6288.06Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein1.3e-6389.55Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein3.0e-6388.81Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S115.2e-0729.32Show/hide
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        SR+ TR    + V   P         GV H+ ASFN+T + VTD+ GR       G    +  R   +P+AA  AA +  +   + G+    +++     
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           K PG G  +ALRA+ RSG+ +  +   +P+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGAGAAGGAAGACTAGAGAGCCTAAGGAGGAAACCGTCACTCTTGGCCCTGCTGTTCGTGAAGGAGAGCATGTCTTTGGTGTTGCTCACATTTTTGCTTCGTTTAA
TGACACTTTCATTCATGTGACCGATCTGTCTGGTCGGGAAACACTTGTTCGCATCACTGGTGGTATGAAGGTGAAAGCTGATAGAGATGAATCATCGCCTTATGCTGCCA
TGCTTGCTGCACAAGACGTTTCTCAAAGATGCAAGGAACTTGGCATCACTGCTTTACACATAAAGCTTCGGGCTACTGGTGGAAATAAAACCAAGACTCCTGGACCTGGT
GCTCAGTCAGCTCTTAGAGCCCTTGCACGTTCGGGCATGAGGATCGGTCGTATAGGTACATATTCACCTATATTCTTGCTTTCAATATTTACAAGAATTGCTAGATTTTC
AGTAAGAAAGCAGAGCTTCTCCAGTTATGTTTGTGCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGTCAATTTTACCCTAAAATTAATACATGAAGATTCCTTATGCCCTCGTTGGAGGGCTTAGGGCAAATTCATAATTTGTGCATATTTAGAGGGTTGGACGATGAAAATAA
CTTTTCCTCCGCCCCCATTCTGAAAACCCTAACTAATAAAGATAAAAGTATCGTCTCCCAGTTGTGGCGGAGGCAGCCTAGCAGGTCGAAGGTTCAAGCCAAGTCTCTGA
AGCCCTAACTTCATTTGCAAAGTCCGGCCATATACTCTCCACCATGTCGAGAAGGAAGACTAGAGAGCCTAAGGAGGAAACCGTCACTCTTGGCCCTGCTGTTCGTGAAG
GAGAGCATGTCTTTGGTGTTGCTCACATTTTTGCTTCGTTTAATGACACTTTCATTCATGTGACCGATCTGTCTGGTCGGGAAACACTTGTTCGCATCACTGGTGGTATG
AAGGTGAAAGCTGATAGAGATGAATCATCGCCTTATGCTGCCATGCTTGCTGCACAAGACGTTTCTCAAAGATGCAAGGAACTTGGCATCACTGCTTTACACATAAAGCT
TCGGGCTACTGGTGGAAATAAAACCAAGACTCCTGGACCTGGTGCTCAGTCAGCTCTTAGAGCCCTTGCACGTTCGGGCATGAGGATCGGTCGTATAGGTACATATTCAC
CTATATTCTTGCTTTCAATATTTACAAGAATTGCTAGATTTTCAGTAAGAAAGCAGAGCTTCTCCAGTTATGTTTGTGCATAGAGTTGTGTTATCGACTTATAAATGTTC
TGCCCATATTCATTGTAAATAAAAATGACATTAGGCCATTCTTAACGCATGTTAGGGAGTGAACTTCATACTCCCAAAATAGGTTCTAAACGATTTAGAAAATGATGAGT
GATTAAACCATTTCGGTGGGATTTTCACAATGTATTATACTTTAACTTTTCAAGGTCTAATTGTTTCATTAACTTAATTTGTTGGTTTTCTCAGAGGATGTAACTCCGAT
ACCTACTGACAGCACACGAAGAAAGGGTGGAAGGAGAGGAAGAAGACTGTGATTCATAGCCATCTTCAAAATGGGTGTGCACTTGTTGCTGCTCGAATATTGAGTTCTAT
AGTTTTAGACAAGGTAGCATGTTCAATCGACAGTCCACTGTTTTGGTTTTTGGTATTTATCAAGATTTTTGCTGTGTTTTGATTTAAATCATTTAGTCAATTGAGTATGA
TACTTTCTTTTTCTTGGCTGCATTTTATAATTAATATTAATGTGTGGAACTCATTGAATATAGCATATAAGTCTAATGACTGATGGTATCATGTGTTAATTTTCTATACT
TGACGGAAAAAATAATTATTAACTCACTTTTTCATATGATTTGAAATTTCACTTTTATTTTATTTTATTACGACAATTGCATTTTCTTTTCAAGAAAACAACATTTTATG
TGCTTTCAATAAAAGATATGTTTATGTTTTGTTGTTATTTGTATAAATTTTAAAATGTAAAAGGAATTCAAAATAGATTATTAGATTGTTGAAATTTATACGTGGAAATT
AGTCTAATTTAGTAAATATTCAATCTTCATTGTTAAACGTATTATCTTATCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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