CuGenDBv2

Gene ID	CsGy3G033480
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Spindle and kinetochore-associated protein 3
Genome location	Gy14Chr3:32473191..32476565
RNA-Seq Expression	CsGy3G033480
Synteny	CsGy3G033480
Gene Ontology terms	GO:0007049 - cell cycle (biological process) GO:0007059 - chromosome segregation (biological process) GO:0000940 - condensed chromosome outer kinetochore (cellular component) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005819 - spindle (cellular component)
InterPro domains	IPR033341 - Spindle and kinetochore-associated protein 3

Homology

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A0A1S3B6I8 Spindle and kinetochore-associated protein 3

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT5G05760.1 syntaxin of plants 31

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        +   ++    +L  L + LK +G +P    DEDD   +  S+PG  F   +S  GL +  + QK      LAK S  F D         +L+ + ++  N
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AT5G06590.1 unknown protein

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        MEE + + SK+L  FCNHLQ++ DA  HS+ RRPIPLDSASSTFI+ LNRR+S    +L+FLESMS  TVSFEELLGH S++YK N+ DLL LQ +L   
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        GYVPE E+DE  D+E +          E S   D      S Q S+      K   ++D LLD+SL+L+N GLSD CLA LAT  N    DP   L    
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           E   G +F  + A     A E   ED    L  ++   P +TL K++++SLPS+MK LASWEDL+ A +K NS L  K +  G  Y   DEI TL L
Subjt:  KFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDH---LTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGK--GKNYILQDEISTLDL

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        G K +++ LLL RMKR+VVET +G ISYRV
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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CGATTCGGCATCATCGACCTTTATACAATCTCTCAACCGCCGTGTGTCGGCTGTTAACGTTGATCTCAACTTTCTTGAATCAATGTCCTTAGAAACTGTATCCTTCGAGG
AGCTTTTAGGTCATGTTAGTGAAGTTTATAAGAAGAACGAAACTGATCTTTTGGAGCTACAGAAGCAGCTCAAGGGTGTTGGATATGTACCAGAGTTTGAGGTTGATGAA
GATGACGAAATTCTTAACAATGTATCAACGCCTGGGTTGCATTTTGAGCTTTCAAGTTCCATGGATGGATTGAACGTACCGTCTTCTTACCAGAAATCAGTCTCCACGAC
AGGACTTGCCAAGCATAGCTTCGAAGATGATATACTACTCGACGACTCTTTAAGCTTACAAAATGCTGGGCTTTCCGATGTTTGTCTTGCCACTCTAGCAACCGAAGGCA
ACTCTACGTTCAGTGACCCATACCAGGATTTGCATACACCAAAAAAATTCTTAGAGAAACCACTTGGCTCAAATTTTCCATGCCAATCTGCAGCACAAACTGTGGGAGCC
CCTGAAGGGGAAGGTGAAGATCACTTGACATTTGAAGAAGCCATTTCACCTCTAATTACGCTATCAAAGGACGATTTTGAAAGCCTCCCATCATATATGAAGGGCCTAGC
ATCATGGGAGGACCTCATCGTGGCTGCTGAGAAAATCAATTCATGCTTGGGGATAAAAGGCAAGGGAAAAAACTATATCCTTCAAGACGAAATTTCAACTTTGGACCTTG
GTCCCAAAGCAAGGTCTTTTCTGCTTCTACTTGTGCGAATGAAGCGAATGGTTGTTGAAACGATTGAGGGTCAAATATCTTATAGAGTTCTATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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AAACTCTAGCGCCCTTTTGCAATCATCTCCAAAACACCAGCGATGCCCTCAAGCATTCCATGGATCGCCGCCCCATTCCTCTCGATTCGGCATCATCGACCTTTATACAA
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Protein sequence

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CsGy3G033480 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome