; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy3G043940 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy3G043940
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionprotein SAMBA isoform X1
Genome locationGy14Chr3:40776736..40780089
RNA-Seq ExpressionCsGy3G043940
SyntenyCsGy3G043940
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136197.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucumis sativus]9.18e-6898.18Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKEAS
        SKRQKRKE +
Subjt:  SKRQKRKEAS

XP_008466002.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X1 [Cucumis melo]8.80e-6695.45Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MNTPSPANSS STTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQV LS
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKEAS
        SKR KRKE +
Subjt:  SKRQKRKEAS

XP_022131247.1 protein SAMBA isoform X1 [Momordica charantia]1.63e-6189.81Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQVVLS
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKE
        SKRQKR+E
Subjt:  SKRQKRKE

XP_022963560.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucurbita moschata]1.34e-6087.96Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MNT SPANSS+STT VAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQV++S
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKE
        SKRQKRK+
Subjt:  SKRQKRKE

XP_038888367.1 protein SAMBA isoform X1 [Benincasa hispida]1.46e-6494.44Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MNT SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMS+QGANCHAIPYQVV+S
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKE
        SKRQKRKE
Subjt:  SKRQKRKE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK11 Uncharacterized protein4.06e-52100Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG

A0A1S3CQ80 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X14.26e-6695.45Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MNTPSPANSS STTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQV LS
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKEAS
        SKR KRKE +
Subjt:  SKRQKRKEAS

A0A6J1BQF8 protein SAMBA isoform X17.88e-6289.81Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQVVLS
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKE
        SKRQKR+E
Subjt:  SKRQKRKE

A0A6J1HIC3 protein SAMBA isoform X16.47e-6187.96Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        MNT SPANSS+STT VAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQV++S
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKE
        SKRQKRK+
Subjt:  SKRQKRKE

A0A6J1HU80 protein SAMBA isoform X15.08e-5886.11Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS
        M T SPANSS+STT VAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINL SRQGANCHAIPYQVV+S
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRKE
        SKR KRK+
Subjt:  SKRQKRKE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA8.4e-2263.64Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN  SPA+S VSTTAVA G  S+ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein6.0e-2363.64Show/hide
Query:  MNTPSPANSSVSTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN  SPA+S VSTTAVA G  S+ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNTPSPANSSVSTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATACCCCGTCCCCCGCCAATTCTTCCGTTTCCACCACGGCGGTTGCCGGAAGGTGTAGCACTAACGCCGCATTGTCGCTTGACGATTTTCGCTTTCCCTCCAATTT
AATTTCCGTGCCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAATAAGGAGGTCAAATCCCTAGATGATGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGCTAATTGCCATGCAATTCCCTATCAGGTGGTGCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAAAGAAGCATCA
CGTACGCTGGGTTCGGAAAAATCTTTGCAGCGCCTCTGTGCTGAAGGCTATGCATGGATTCTTACCGTTTTCTCTTGCTGTGCTACGTTAAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACTTAAGAAAGATAGCAAAAATAAATACCAATTATAAATTATAAACCATTAACATTTCAACAAATTTAAATAATGTTGGGATATTTATTTATTAATGTTAAGAGTACGA
CAATTACCACTTTGACCTCACAAAATTTGGGAAATTGTCACAAAGTATTTGAAAATTTTTCCAATTGAGAGCAGAAAATTCAAAGCCCTAATCTTCTCCATTGCTGAATT
CAATGAATACCCCGTCCCCCGCCAATTCTTCCGTTTCCACCACGGCGGTTGCCGGAAGGTGTAGCACTAACGCCGCATTGTCGCTTGACGATTTTCGCTTTCCCTCCAAT
TTAATTTCCGTGCCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAATAAGGAGGTCAAATCCCTAGATGATGATAACTGGATGTT
TGAAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGCTAATTGCCATGCAATTCCCTATCAGGTGGTGCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAAAGAAGCAT
CACGTACGCTGGGTTCGGAAAAATCTTTGCAGCGCCTCTGTGCTGAAGGCTATGCATGGATTCTTACCGTTTTCTCTTGCTGTGCTACGTTAAGGTAACATACTTTAAAT
GTTATCACATGACTGCCAAATTAAATCTGGATAGCCCCGAACGTGATAAAAAATCTCATTTAAATGCTTTTGCCTTTGCCTTTGCCTATTTAAATCATTCACAAGTTGTG
AAATGCTAAAATTTGAACTTTGGGTTGTACAAAAGACAAAACCATGAGTGAGAGTGAATAGAAAAATAAAGGGAAAGGGCAAAGAAAAGCGCTATGGGGTCCACGTAAGG
AATAGATGTAGGACCCACAAGAAACCTAATCATCAATATCCAAAGCATTAGGAAGGAAATCACATCATGCCACGTGGGCCGTACCCACTCCATCAATTCCTTACCCAACA
CTTCACATTTTATTTTTAATTCCCTTTCCTTTACTCTTCTATTAAATTAGATTAAAGTTTTTTCTTTTTTAAATTCTCTCAACTCCACAAATAAATCTCATTTCAAAATT
ATTGTAAATCTAAGTTCAATTTGCCTCTTAAAGTTCTCTAATCTCTATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTPSPANSSVSTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVVLSSKRQKRKEAS
RTLGSEKSLQRLCAEGYAWILTVFSCCATLR