CuGenDBv2

Gene ID	CsGy4G003430
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Unknown protein
Genome location	Gy14Chr4:2145798..2152269
RNA-Seq Expression	CsGy4G003430
Synteny	CsGy4G003430
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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        TSRSHLR+FLSSGLDAFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVK L GIVSRLGNKFSSGYTAPV+RRDRSLGGREVVVGTRRS
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        VVAR+KGMGKKNNLLGLLDSPVLADTMAL D+SSE+SKNGVW GERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
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Query:  RISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
        R SGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLI INGEDGPNF+AGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
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Query:  LKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLTLGLKKVLKVEQRESLMNMFIGICGKDSHSTAAEALGL
        LKICHIIQIFPPE+SSPEMEMLTLGLKK LKVEQRESLMNMFIG+CGKDSHSTAAEALGL
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G43235.1 unknown protein

4.9e-82

43.96

Show/hide

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        FS+P  R         +PR R  RK++ +    T  +    S+SS     D +L   +++ +++  A+  F           + FL S  DAF DL+TLI
Subjt:  FSSPDSRPLFTPVSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSS----SDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFLSSGLDAFDDLRTLI

Query:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKFLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLA
        + DD NR + VSC++ST++FVG +V+L FV  F ++ LV + S L   F S     V+RRDRSLGG+EVVV        R+     K+          +A
Subjt:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKFLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLA

Query:  DTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASV
           A    S+  + + +     LPKWWP ++  ++    ++++YQ EANR+VRA+VDNR SG+D  +DDI+QLR +CRISGV+V+F  +N  DSFYR S+
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Query:  DFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLT
        DFVLN  SR P     + I  ED   FIAGLAE+IG+  + AAR+VSAAVAAR RS+FLQAWAL +Q +HSE+ AEL KIC I +IFPP + S EMEM+ 
Subjt:  DFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLT

Query:  LGLKKVLKVEQRESLMNMFIGI-CGKDSHSTAAEALGLV
         GL+K++K+E+R+SL+  F+G+ C +DS  +AAEALGLV
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Sequences

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CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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CTGATTCGAACCTCCAAACTGTAATTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTCTTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCCCGCTCCCACCTCCGCCAGTTTCTG
TCATCGGGATTGGACGCTTTCGACGATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGACCAAAATCGAACGCTGACCGTCTCTTGTCGTCGTTCCACTGTGGAATTCGTTGGCCA
ATTGGTGCTGTTGAGCTTTGTTGTGGTCTTTGTAGTTAAGTTTTTAGTTGGGATTGTATCTCGTTTGGGTAACAAATTTAGTTCTGGGTATACGGCCCCTGTAATGAGAA
GGGACCGGAGCCTTGGTGGACGAGAGGTTGTTGTTGGGACTAGGAGGAGTGTTGTAGCGCGAAATAAAGGTATGGGGAAGAAAAATAATCTTTTAGGGTTATTGGACAGT
CCCGTGTTAGCGGACACAATGGCTCTGAATGATGTTTCAAGTGAAATTTCGAAGAACGGGGTTTGGGGTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTTCCCCG
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TTCAATTGCGTGAAATATGCAGGATATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACAGAAAATATGCGTGATTCATTTTATCGAGCATCTGTGGACTTTGTTTTAAATATCTAT
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GATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCTAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAATGCTGAGTTGTTGAAGATCT
GTCACATTATACAGATATTCCCTCCTGAGAAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAAGTCTTGAAGGTAGAACAGAGAGAATCATTAATGAAT
ATGTTTATTGGTATTTGTGGTAAAGATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTGGTGCTTCCTACAAATATGGGGAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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TTTAGGTGTGGAAAAACGGAGCTTCCAATTCTTTTGCTCTACATGGACTAATGGACACCACAGCAACCACACTCTGCCTCTTCCTTCCATATCCATTCACTTCCCGTCGC
CATAACCTCCATTTCAACCGCCGCTTCTCCTCGCCGGACTCCCGACCACTCTTCACCCCTGTCTCCTGCTTCAAACCACGTCGTCGTACTCGCCGGAAAAACAGCCTCAC
CAAACTCCGCACCACCACCCACCATCCCTTCGACTCCTCATCCTCTTCCTCTGATTCGAACCTCCAAACTGTAATTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTC
TTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCCCGCTCCCACCTCCGCCAGTTTCTGTCATCGGGATTGGACGCTTTCGACGATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGACCAAAAT
CGAACGCTGACCGTCTCTTGTCGTCGTTCCACTGTGGAATTCGTTGGCCAATTGGTGCTGTTGAGCTTTGTTGTGGTCTTTGTAGTTAAGTTTTTAGTTGGGATTGTATC
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GTTTGGGGTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTTCCCCGACGGAATGCTACGGCGAATAGGCAAGAGTATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTCCGAGC
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TGCGTGATTCATTTTATCGAGCATCTGTGGACTTTGTTTTAAATATCTATAGCAGGACTCCCATTTACCCACACTTAATTTTTATTAATGGTGAGGATGGTCCAAATTTT
ATTGCTGGGCTTGCTGAGGACATTGGCATTGAGAATGTCCGTGCTGCCAGGATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCTAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCT
AGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAATGCTGAGTTGTTGAAGATCTGTCACATTATACAGATATTCCCTCCTGAGAAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTC
TAGGCTTGAAGAAAGTCTTGAAGGTAGAACAGAGAGAATCATTAATGAATATGTTTATTGGTATTTGTGGTAAAGATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTG
GTGCTTCCTACAAATATGGGGAATTGATATCATCAAAGCTTCGGTCCTGAAGATGTCCATATACTTTTTAAGTAGGCTTCTAACTCCTGAAATTTTCTTCTAAGAGCCCA
ATCTTATAAATCTTAACTTTGTATAAAGTATCGTGATCAAGTTTAGCGTTAATTCATTGATTGGCTCATTCATCCGATTATTAATTAATGTGTAATTTGATTCTTTGAAT
AAAAGAATTATGAAATTAGATGCTGAAAGTTTTTTAGAATCATATTGTAAGCAGTAAGTAATAAAACTAGAATCATGTTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDTTATTLCLFLPYPFTSRRHNLHFNRRFSSPDSRPLFTPVSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSSSDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFL
SSGLDAFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKFLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARNKGMGKKNNLLGLLDS
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MFIGICGKDSHSTAAEALGLVLPTNMGN

CsGy4G003430 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome