; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy4G016100 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy4G016100
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionKH domain-containing protein
Genome locationGy14Chr4:20823884..20830374
RNA-Seq ExpressionCsGy4G016100
SyntenyCsGy4G016100
Gene Ontology termsGO:0048024 - regulation of mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004087 - K Homology domain
IPR004088 - K Homology domain, type 1
IPR032377 - STAR protein, homodimerisation region
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily
IPR045071 - KH domain-containing BBP-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK06218.1 KH domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]1.47e-16399.57Show/hide
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XP_004142668.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X2 [Cucumis sativus]2.97e-166100Show/hide
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XP_008463293.1 PREDICTED: KH domain-containing protein At2g38610 [Cucumis melo]1.21e-16599.57Show/hide
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XP_011653733.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X1 [Cucumis sativus]2.07e-16499.57Show/hide
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XP_038882688.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X2 [Benincasa hispida]1.30e-16298.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXW7 KH domain-containing protein1.44e-166100Show/hide
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A0A1S3CIV3 KH domain-containing protein At2g386105.84e-16699.57Show/hide
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A0A5D3C4T5 KH domain-containing protein7.12e-16499.57Show/hide
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A0A6J1EEN1 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X21.53e-16196.57Show/hide
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A0A6J1HRK9 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X28.85e-16196.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WLR1 KH domain-containing protein At4g264801.1e-5953.65Show/hide
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         +  P ER S +     +W ++P S S L VKR +R++IPVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KE+ +RG+PGYEHLNE
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        PLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL PV
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Q75GR5 KH domain-containing protein SPIN11.0e-9471.79Show/hide
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        MSG+YS  FSPAR  SP IR+ P DVDSQYL+ELLAEHQK GPFMQVLPIC +LL+QEI+RVS ++ N GF D DR R RSPSPM+S N  +N S  G S
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         WNGL QERL    G +MDWQ AP SPSS  VK+ILRL++PVD+YPNFNFVGR+LGPRGNSLKRVE +TGCRV+IRGKGSIKDP KE+KLRG+PGYEHL+
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        +PLHILIEA+ PA+++D RLR AQE+IEELLKPV
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Q8GYR4 KH domain-containing protein At3g086201.3e-10578.1Show/hide
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        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLM+NVS  GL
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         GWNGLP ER+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEHL
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        NE LHILIEADLP ++VDI+LRQAQEIIEEL+KPV   Q +I
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Q9FKT4 KH domain-containing protein At5g561401.4e-5953.33Show/hide
Query:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSS
        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
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Query:  TGLSGW-NGLPQER-LSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP
          ++GW +  P ER +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
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        GYEHLNEPLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL P+
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Q9ZVI3 KH domain-containing protein At2g386101.7e-11084.32Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLM+NVS+TG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38610.1 RNA-binding KH domain-containing protein1.2e-11184.32Show/hide
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AT2G38610.2 RNA-binding KH domain-containing protein1.2e-11184.32Show/hide
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Query:  LSGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH
        L GWNGL QERLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYEH
Subjt:  LSGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH

Query:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPV
        LNE LHILIEADLPA++V+IRLRQAQEIIEELLKPV
Subjt:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPV

AT3G08620.1 RNA-binding KH domain-containing protein9.2e-10778.1Show/hide
Query:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGL
        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLM+NVS  GL
Subjt:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGL

Query:  SGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHL
         GWNGLP ER+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEHL
Subjt:  SGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHL

Query:  NEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVVCFQPWI
        NE LHILIEADLP ++VDI+LRQAQEIIEEL+KPV   Q +I
Subjt:  NEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVVCFQPWI

AT4G26480.1 RNA-binding KH domain-containing protein7.6e-6153.65Show/hide
Query:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGW
        S   S NFS    + P      +   +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RL+NQEILRV+ ++ N     L + R   PSP+AS  +  N S   ++GW
Subjt:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGW

Query:  -NGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNE
         +  P ER S +     +W ++P S S L VKR +R++IPVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KE+ +RG+PGYEHLNE
Subjt:  -NGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNE

Query:  PLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPV
        PLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL PV
Subjt:  PLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPV

AT5G56140.1 RNA-binding KH domain-containing protein1.0e-6053.33Show/hide
Query:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSS
        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
Subjt:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSS

Query:  TGLSGW-NGLPQER-LSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP
          ++GW +  P ER +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
Subjt:  TGLSGW-NGLPQER-LSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP

Query:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPV
        GYEHLNEPLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL P+
Subjt:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTGCAAGGACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTCGACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCA
TCAGAAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCGATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTCTGGAATGATGTCCAACCAAGGTTTCTGCGACCTTG
ATAGGCTTCGGCATAGAAGCCCTAGTCCAATGGCTTCTTCAAACCTTATGACTAATGTCAGTAGTACAGGTTTGAGTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGAGATTAAGT
AGAGCCCCTGGGATGACAATGGATTGGCAAAGCGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTGCGTTTGGAAATACCCGTTGATACTTATCCCAATTT
CAATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGCGGCAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACCGGTTGTCGTGTATACATTCGAGGGAAAGGGTCGATAAAGGATCCAG
ACAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGGCTATGAGCACTTGAACGAACCACTGCACATCTTGATTGAGGCAGACTTGCCAGCCAATGTTGTTGATATACGACTCAGA
CAGGCACAAGAAATTATTGAAGAACTGCTCAAACCTGTGGTATGTTTTCAACCTTGGATATGCTTTTGGAATGCTTTAGGCTGGCCAAAATCAAAATTTACATGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTGCAAGGACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTCGACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCA
TCAGAAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCGATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTCTGGAATGATGTCCAACCAAGGTTTCTGCGACCTTG
ATAGGCTTCGGCATAGAAGCCCTAGTCCAATGGCTTCTTCAAACCTTATGACTAATGTCAGTAGTACAGGTTTGAGTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGAGATTAAGT
AGAGCCCCTGGGATGACAATGGATTGGCAAAGCGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTGCGTTTGGAAATACCCGTTGATACTTATCCCAATTT
CAATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGCGGCAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACCGGTTGTCGTGTATACATTCGAGGGAAAGGGTCGATAAAGGATCCAG
ACAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGGCTATGAGCACTTGAACGAACCACTGCACATCTTGATTGAGGCAGACTTGCCAGCCAATGTTGTTGATATACGACTCAGA
CAGGCACAAGAAATTATTGAAGAACTGCTCAAACCTGTGGTATGTTTTCAACCTTGGATATGCTTTTGGAATGCTTTAGGCTGGCCAAAATCAAAATTTACATGCTAAAA
AGAACTTCACTATCAAAATCATCATCTTGTTAATTTTTTTTAACCAAAGTGATTGTTAGGGAGCACTTGAAAGTGTTTCCATATGCACCTTTATATTTCTTCACTCGAGA
GCTTTATAAGTAATTGTGCATTTATTAAAGAAGCTCTTGTGAACTGTATTTTTACCAAAGTGATTGTTAGGGACCACTTGGAATCTCTCGAGAGTGTAGAGAAACTATCG
AAGTTATTTGTCATCACTGTTTGTTGAAGTGTTTAATGTTTTTGCTAAACATACTTATTTTAAATGCGGCCTGATACATACCTTTTTTTTGTTTTATTTTCATACGCATG
TGTCCGGACCAAAGATATGCATAGCTCAACTATTTTCACAAAAAACCCACCTATCCCTAAAAAAATTTAAGTGTCAAGAAAACTTATAGGATATCAAATCTGAGATAGGT
GGCCCATCTATCCCTCTTAGCCCTTTATCATCAACACATGTCCTTTGTTTACCATTAACCCAACCTATGATGGTTTATAACCATTCTACTTGAGTTTTATTCTATTTATG
TAGGTAAAACACACCTGTTTAACTATAACTCATTTACTTGCTTACGAGATTAAAGTTACTTTCAATCTCTCATGGATTTCTTGTATTTCTCATCCTTTTGTGCAGTCGAT
TCAGATTTCCCCTTTTTCTTTTCCCTGAACATGGTGTGTACTAACAAACTTTTGGTTCTTTTGGCATTTGAATAATTCATTTGCAGGATGAGAGTCATGATTACATTAAA
AGGCAGCAGTTACGCGAACTCGCAATGCTAAATTCAAGTTTCAGAGAAGAGAGTCCAGGACCTGGTGGCAGTGTCTCTCCTTTCAACTCAAGTGGTATGAAACGTGCCAA
AACAGGTCGGTAAGTGCGCAATATCATTCCATACCCTAAACAATTTCTACCCCAGTCCAAATTTCGGTCACTTATATACTGAAGTGAATCATGATCGACCATGTGACATA
GCTACGAGAAAGGGGAGGCTAACTTCAGTTCCAGGCGAGCCTTCTGTTGGCTTTTTCTTTGTGTTCCCTTTAATATTCTTGACAGAAAGACTGGAAAAAAGTTGAAAAAA
AGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAACAGAGGGTAAAAAGGAAAAAAAATTGTTAGTATTAGTAGGGATGGTTTTTCAAGTTGGGTGTAGGTTTGAATAGGTCAGTTTTTC
CAACAAAGTTAATATATTCATTGGATTTATTCTTGTGCTAGTGACTGCTGAGGAGTGTGTAGTTTTATTGCATTATTGATGCAAAAACCTTAGGAAGTGATGATGATGTA
ATACTATTTGATATTTGTTAGGTGTATGCAATGTCAATGTCAATTATATTTTTGGACTGATATATGAAAGAACAGTGCAAAAACTCATACAAAAGTGCTTGCTCAGTTTG
TGTTTGCTTTTCGAGATTCAGAATATGATTCTCCTTTCTGTCTTTTCATTTCCTGAAAAGTTGAAAACTTATGCCTTTGACTATTATTACAACATGTCTTGCATAGATGT
TTTCTAATTTTTCGACGCTTAGGAGGGTAAGCGGGTTGGCTTGGATGGATGAACTTGCAAAGGTAACATGAATCAATATCGACCAACTTGTATCTTCATTAATTTTATCC
CTCTTTCTTGTGGCCATCTCCATCATGTCCTGCACGATGTCGAAGGACCTGGTGTTACTAACGTCAACCATTCATGGCTCCTCCCTCCCCTCCGCAGTCTCTCATTTCTT
TATTTTTTGCTATTTTTTCCTCCTCTATCTTCTCCTACTTAACAAGAATCCCAACATGTGATATGAAAATGGCCGAAAGGAGAGGCCCCTTGGTTTTGGATTATTTCCAG
ATTGGGTTGTGCAACAACAAGAGAAAGGGGAAAGAACGAAGAAGATCAAATGTTAAAGAAGAGAGAGAGTGAGTAAAGAGGGCCAACAATGATGACAAATGGTGGTGACA
ATCATGGATGAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGWNGLPQERLS
RAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLR
QAQEIIEELLKPVVCFQPWICFWNALGWPKSKFTC