CuGenDBv2

Gene ID	CsGy4G020170
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	40S ribosomal protein S15a
Genome location	Gy14Chr4:27041702..27042282
RNA-Seq Expression	CsGy4G020170
Synteny	CsGy4G020170
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000630 - Ribosomal protein S8 IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAE9451430.1 hypothetical protein C3L33_16699, partial [Rhododendron williamsianum]

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KAF7148267.1 hypothetical protein RHSIM_Rhsim03G0129000 [Rhododendron simsii]

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KAG5557696.1 hypothetical protein RHGRI_007820 [Rhododendron griersonianum]

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XP_004144630.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucumis sativus]

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XP_014518151.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Vigna radiata var. radiata]

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A0A1S3CPB7 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A5A7SSH5 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6A4L076 Uncharacterized protein (Fragment)

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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-1

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Q9SBL9 Wrp15a

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O80646 40S ribosomal protein S15a-3

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P42798 40S ribosomal protein S15a-1

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Q00332 40S ribosomal protein S15a

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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a

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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-4

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AT1G07770.1 ribosomal protein S15A

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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A

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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein

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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D

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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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ATGGTGCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCGCTTAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGAGGGAAGCGTCAGGTCATGATAAGACCGTCTTCTAAAGTTATCATCAAGTT
TCTTCTCGTTATGCAGAAGCACGGATACATTGGGGAGTTTGAGTTCGTTGATGACCATAGATCAGGGAAAATTGTTGTTGAGCTGAATGGGAGACTTAACAAATGTGGTG
TCATAAGTCCCCGTTTTGATGTCGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCTAGGTTGCTACCCTCTAGACAGTTTGGATTCATCGTCTTGACTACATCTGCGGGAATC
ATGGATCACGAAGAGGCCAGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAAGTGCTTGGTTTCTTTTACTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLLVMQKHGYIGEFEFVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLTTSAGI
MDHEEARRKNVGGKVLGFFY

CsGy4G020170 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome