; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy4G021780 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy4G021780
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4
Genome locationGy14Chr4:28396042..28396782
RNA-Seq ExpressionCsGy4G021780
SyntenyCsGy4G021780
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039828 - VQ motif-containing protein 33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK20262.1 VQ motif-containing protein 4 [Cucumis melo var. makuwa]5.51e-16399.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L3E4 VQ domain-containing protein9.36e-166100Show/hide
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A0A1S3BTW1 VQ motif-containing protein 46.55e-16499.6Show/hide
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A0A5A7VAR6 VQ motif-containing protein 46.55e-16499.6Show/hide
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A0A5D3D9L9 VQ motif-containing protein 42.67e-16399.19Show/hide
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A0A6J1IMJ9 VQ motif-containing protein 4-like3.36e-14089.88Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 136.4e-2545.55Show/hide
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Q5M750 VQ motif-containing protein 47.2e-4553.91Show/hide
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        + E+GFYLHPSP  TP   DP P+LL LFP TSPRVSGSSS+S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 338.3e-3348.46Show/hide
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        STS+  S  E+  NP P        + S+P   P  + P         SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS      +H   PS      P ++ +
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              +F IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N     F+G  +    +  FSPRN       +LSPS+LDFP L L SPVTP
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        L  NDDP F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 312.8e-1233.51Show/hide
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        TTFVQ DT+ F+ +VQ LTG           PT ++   + P ++              IKTA +K+ + KL+ERR  ++  L I     +F  +G    
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            N  +L+ S +  PS   S ++ +  +P  D  ++     +  EEE+AI E+ FYLHPSP + P   + P+LL+LFP TSP  SG
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 193.1e-4052.74Show/hide
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        E  TNP  S ++S +S+ IN +       ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS   SP  P+ P TPS K                NF IP
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        PIKTA PKK    KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER
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         IA+KG+YLH SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein5.1e-4653.91Show/hide
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        S N+   S++  SN PP  P   +  RS+S NPYPTTFVQADTS+FK VVQMLTGS+E P+        P  H P P S P S              F I
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein8.2e-4453.16Show/hide
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein4.5e-2645.55Show/hide
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        Y TTF++ D S+FK VVQ+LTG    P+ P H P P             PF S     IPPIK    K+Q  SF+L ERRN +K+ L IN   P  SG  
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Query:  AAAGFSPRNVEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPET
                  EIL+P+IL+FP+L LSP TPL  DP +   S S S   S      ++ER+I EKGFYL PSP  TPR  + P+LLSLFP T
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AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.2e-4152.74Show/hide
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        E  TNP  S ++S +S+ IN +       ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS   SP  P+ P TPS K                NF IP
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Query:  PIKTA-PKKQQSFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAAAGFSPRNVEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEER
        PIKTA PKK    KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER
Subjt:  PIKTA-PKKQQSFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAAAGFSPRNVEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEER

Query:  AIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVS
         IA+KG+YLH SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
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AT5G53830.1 VQ motif-containing protein5.9e-3448.46Show/hide
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        STS+  S  E+  NP P        + S+P   P  + P         SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS      +H   PS      P ++ +
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Query:  PFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPN-----FSGSGA----AAGFSPRNVE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTP
              +F IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N     F+G  +    +  FSPRN       +LSPS+LDFP L L SPVTP
Subjt:  PFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPN-----FSGSGA----AAGFSPRNVE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTP

Query:  L--NDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSP
        L  NDDP F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
Subjt:  L--NDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCACTTCATCTTCAACCTCAACAACAAGATCATCCCATGAAAGAGAAACAAACCCTTCTCCTAATACTTCCCCTAACAGTACCACCATCAACTCCAATCCTCC
TCCTCCTCCTCCTAAGCTTCTTCCTAGATCTGATTCAAATCCTTACCCCACAACTTTTGTTCAAGCTGATACTTCCAATTTCAAACATGTTGTTCAAATGCTCACTGGCT
CATCGGAATCTCCCCGGCCACCGCAACACCCACCAACCCCATCTTCAAAACCTTGTTCTGTTCCTCCTTCTTCTCAAGACCCTTTTCAATCTTCCAAAAACTTCCCGATT
CCTCCCATCAAAACCGCCCCTAAGAAACAACAGAGTTTCAAGCTCTACGAACGAAGAAATCACCTCAAGAATAGTCTCATGATCAATACCCTAATCCCCAATTTCTCCGG
TTCTGGTGCGGCAGCGGGTTTTTCTCCTCGCAACGTTGAGATTCTCTCTCCTAGCATCCTTGATTTTCCTTCTCTTGCTCTTAGTCCTGTTACGCCGTTGAATGATGACC
CGTTGTTTGATAAATCGTCGTCGTCGCCGTCGCTTGGGAGCTCGTCGGAGGAAGAGAGAGCGATTGCTGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGATGAATACACCT
AGAGCCGCTGACCCGCCGCAGCTTCTTTCTCTGTTTCCGGAAACTTCGCCTAGGGTTTCTGGATCATCGTCTTCTTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PPIKTAPKKQQSFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAAAGFSPRNVEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTP
RAADPPQLLSLFPETSPRVSGSSSSS