; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy4G024243 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy4G024243
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionThreonyl-tRNA synthetase
Genome locationGy14Chr4:30032542..30033293
RNA-Seq ExpressionCsGy4G024243
SyntenyCsGy4G024243
Gene Ontology termsGO:0006435 - threonyl-tRNA aminoacylation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0004829 - threonine-tRNA ligase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002320 - Threonine-tRNA ligase, class IIa
IPR018163 - Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649928.1 hypothetical protein Csa_012436 [Cucumis sativus]5.95e-40100Show/hide
Query:  MAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        MAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
Subjt:  MAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

KAG6589116.1 Threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.75e-3492.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

KAG7011877.1 Threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.79e-3492.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

XP_004144536.1 threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 [Cucumis sativus]1.79e-3492.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

XP_022847786.1 threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2-like isoform X1 [Olea europaea var. sylvestris]6.94e-3584.51Show/hide
Query:  LQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        +QCAHVMAMAVQKL+PDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPL DKDL +IKKEM+RII  NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  LQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K179 Threonyl-tRNA synthetase8.69e-3592.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

A0A0A0L0Y5 Uncharacterized protein2.76e-63100Show/hide
Query:  MYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        MYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
Subjt:  MYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

A0A6J1EKH5 Threonyl-tRNA synthetase8.69e-3592.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

A0A6J1GM45 Threonyl-tRNA synthetase8.69e-3592.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

A0A6J1JP39 Threonyl-tRNA synthetase8.69e-3592.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4IFC5 Threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 22.3e-2884.06Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWI+NGF YDFD+EPL DKDL +IKKEM+RIIS NLPL+REEVSR++A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

Q31JY3 Threonine--tRNA ligase3.4e-1968.12Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        +HVMAMAVQKLFP A+VTIGPW E GF YDFD  EP  + DL  IKKEM +II   LP+VREEVSR++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

Q55806 Threonine--tRNA ligase1.5e-1965.22Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        +HVMAMAVQKLFP A+VTIGPW E GF YDFD+ EP  + DL  IKKEM +II+  LP++REE+SR++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

Q5N1X6 Threonine--tRNA ligase3.4e-1968.12Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        +HVMAMAVQKLFP A+VTIGPW E GF YDFD  EP  + DL  IKKEM +II   LP+VREEVSR++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

Q8DGW0 Threonine--tRNA ligase1.2e-1965.22Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFD-IEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        +H++AMAVQKLFP A+VTIGPWIENGF YDFD  EP  +KDL  I+KEM +II   LP++REEV+R++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFD-IEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04842.1 threonyl-tRNA synthetase, putative / threonine--tRNA ligase, putative1.7e-2984.06Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWI+NGF YDFD+EPL DKDL +IKKEM+RIIS NLPL+REEVSR++A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACCATAAATTACACTCTCTTACCTCACCATTCTTTCGAACTACTTTCCCAGGTTTCCAGCCTCTTCAGTGTGCTCATGTAATGGCCATGGCTGTTCAGAAGCTCTT
TCCAGATGCTAAAGTGACAATTGGACCATGGATTGAAAATGGGTTTTGCTATGATTTTGATATAGAGCCCTTGGGAGATAAAGATTTGATGAAAATCAAGAAGGAGATGG
AACGCATTATCAGCACAAACTTACCACTTGTAAGAGAAGAAGTTTCAAGGGATAAAGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACCATAAATTACACTCTCTTACCTCACCATTCTTTCGAACTACTTTCCCAGGTTTCCAGCCTCTTCAGTGTGCTCATGTAATGGCCATGGCTGTTCAGAAGCTCTT
TCCAGATGCTAAAGTGACAATTGGACCATGGATTGAAAATGGGTTTTGCTATGATTTTGATATAGAGCCCTTGGGAGATAAAGATTTGATGAAAATCAAGAAGGAGATGG
AACGCATTATCAGCACAAACTTACCACTTGTAAGAGAAGAAGTTTCAAGGGATAAAGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISTNLPLVREEVSRDKA