; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy5G002870 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy5G002870
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionprotein LURP-one-related 4
Genome locationGy14Chr5:1876425..1877537
RNA-Seq ExpressionCsGy5G002870
SyntenyCsGy5G002870
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007612 - LURP-one-related
IPR025659 - Tubby-like, C-terminal
IPR038595 - LURP-one-related superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042775.1 protein LURP-one-related 4 [Cucumis melo var. makuwa]4.32e-13095.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNY3 Uncharacterized protein3.89e-141100Show/hide
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A0A5A7TMZ0 Protein LURP-one-related 42.09e-13095.17Show/hide
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A0A6J1ELI2 protein LURP-one-related 4-like5.38e-12088.89Show/hide
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A0A6J1HYX0 protein LURP-one-related 4-like1.43e-11486.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67XV7 Protein LURP-one-related 32.0e-2737.21Show/hide
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Q8LG32 Protein LURP-one-related 22.0e-2737.21Show/hide
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Q9ZVI6 Protein LURP-one-related 83.3e-1429.76Show/hide
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          + E  + P F  +K     S +++ +      V  ++  L +++G    R   I     N +  AE KRK +   G+  G DV  L   S++E  + M
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        AL  +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53870.1 Protein of unknown function (DUF567)1.4e-2837.21Show/hide
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AT1G53880.1 Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein3.4e-2736.63Show/hide
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        ++
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AT1G53890.1 Protein of unknown function (DUF567)1.4e-2837.21Show/hide
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AT1G63410.1 Protein of unknown function (DUF567)3.5e-4045.85Show/hide
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        MA+V+PQ A+       SSP  S     TE ETFT+WMKSL+Y TNG T+++SNG+I YRV+NYD KCS+EV +MDL G +LFTIRKKK  + G W  YR
Subjt:  MAKVYPQTALSPSPSSSSSPSSSSLCSETETETFTIWMKSLIYHTNGCTIFDSNGDIVYRVDNYDRKCSSEVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR

Query:  WMESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETSLVMALVTVY
           S  S +      ++ RS  R  +     E N   E F +++ D K AF+II+I+G ++A+ K K S NGI LG+DVL+L    +++ SLV+ LVT+ 
Subjt:  WMESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETSLVMALVTVY

Query:  GLIRR
        G +++
Subjt:  GLIRR

AT3G14260.1 Protein of unknown function (DUF567)2.9e-3441.98Show/hide
Query:  MAKVYPQTALSPSPSSSSSPSSSSLCSETETETFTIWMKSLIYHTNGCTIFDSNGDIVYRVDNYDRKCSSEVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR
        M K++P    S +   +SSP  +     TE E+FTIWMKSL+++TNGCT+FDS G+I+YRVDNY+ K   EV+LMDL G VLFT+R++KF +   WEGYR
Subjt:  MAKVYPQTALSPSPSSSSSPSSSSLCSETETETFTIWMKSLIYHTNGCTIFDSNGDIVYRVDNYDRKCSSEVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR

Query:  WMES---ERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETS
           +     +K   F VK        K + S+   +N G  R      + +V     LA  I +  G+++AE KRK S NG+ LGDDVL++   SQ++ S
Subjt:  WMES---ERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETS

Query:  LVMALVTVYGLI
         ++ LV  + LI
Subjt:  LVMALVTVYGLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACAGCGCTGTCGCCGTCGCCGTCGTCCTCGTCGTCTCCATCCTCTTCATCTCTCTGTTCCGAAACAGAAACCGAAACCTTCACTATTTG
GATGAAATCTCTAATTTACCACACAAATGGCTGCACAATCTTTGATTCTAATGGAGACATCGTTTATAGAGTTGATAACTACGACAGAAAATGCAGTAGCGAAGTATTTC
TCATGGATCTCAGAGGCAAAGTTCTCTTCACCATCAGAAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGTGGATGGGAAGGATACCGATGGATGGAATCAGAGAGAAGTAAGAAGCCT
AGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTATAGATCGGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGCGGTTTGTGAAATTAATGTAGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATGGATGG
AAAATTGGCTTTCAGAATAATCAACATCAATGGAGAAGTAGTTGCAGAGGCTAAAAGAAAAGTATCATGGAACGGAATATTGTTGGGAGATGATGTGTTGAGTTTGAATG
CAAATTCTCAGATCGAAACATCTTTGGTTATGGCTTTGGTTACTGTTTATGGATTAATCCGTCGCCAAATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTCCCTATAAATTCTCCTCTTTCTCAATTCTTCCTTCTTCATCAAACTTTCAAACCTTCTTCTCTCTCTCTTACCTTCAATCTCAATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACA
GCGCTGTCGCCGTCGCCGTCGTCCTCGTCGTCTCCATCCTCTTCATCTCTCTGTTCCGAAACAGAAACCGAAACCTTCACTATTTGGATGAAATCTCTAATTTACCACAC
AAATGGCTGCACAATCTTTGATTCTAATGGAGACATCGTTTATAGAGTTGATAACTACGACAGAAAATGCAGTAGCGAAGTATTTCTCATGGATCTCAGAGGCAAAGTTC
TCTTCACCATCAGAAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGTGGATGGGAAGGATACCGATGGATGGAATCAGAGAGAAGTAAGAAGCCTAGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTAT
AGATCGGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGCGGTTTGTGAAATTAATGTAGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATGGATGGAAAATTGGCTTTCAGAATAATCAA
CATCAATGGAGAAGTAGTTGCAGAGGCTAAAAGAAAAGTATCATGGAACGGAATATTGTTGGGAGATGATGTGTTGAGTTTGAATGCAAATTCTCAGATCGAAACATCTT
TGGTTATGGCTTTGGTTACTGTTTATGGATTAATCCGTCGCCAAATGTAAAACTAAATTAGAAGAGCGGAAAGAGAAAGAAAAAAAAGAGTTGATACGAATTTTAGTTTT
GTTTTCTTATTTGGAGGATTTTGTTGTGATGTTGTATAGAACTTTACAGATTTTGGTTTTCTTGTAAAGGATTTAATGTAGATTGTTACGAAGGAATACATATATAAATT
TCATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKVYPQTALSPSPSSSSSPSSSSLCSETETETFTIWMKSLIYHTNGCTIFDSNGDIVYRVDNYDRKCSSEVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYRWMESERSKKP
SFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETSLVMALVTVYGLIRRQM