; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy5G006840 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy5G006840
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionzinc finger protein ZAT12-like
Genome locationGy14Chr5:4623564..4624290
RNA-Seq ExpressionCsGy5G006840
SyntenyCsGy5G006840
Gene Ontology termsGO:0010200 - response to chitin (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050290.1 zinc finger protein ZAT12-like [Cucumis melo var. makuwa]2.00e-10393.87Show/hide
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KAE8647983.1 hypothetical protein Csa_000240 [Cucumis sativus]3.00e-112100Show/hide
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XP_004147699.1 zinc finger protein ZAT12 [Cucumis sativus]1.64e-120100Show/hide
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XP_008461644.1 PREDICTED: zinc finger protein ZAT12-like [Cucumis melo]3.61e-11193.71Show/hide
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XP_038892761.1 zinc finger protein ZAT12-like [Benincasa hispida]2.38e-10087.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLU2 Uncharacterized protein7.93e-121100Show/hide
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A0A1S3CF73 zinc finger protein ZAT12-like1.75e-11193.71Show/hide
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A0A5D3CS99 Zinc finger protein ZAT12-like9.68e-10493.87Show/hide
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A0A6J1GYC8 zinc finger protein ZAT12-like1.05e-9684.57Show/hide
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A0A6J1JZD8 zinc finger protein ZAT12-like2.12e-9684.57Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q42410 Zinc finger protein ZAT121.2e-2645.96Show/hide
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Q42453 Zinc finger protein ZAT77.4e-2444.85Show/hide
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Q9LFG0 Zinc finger protein ZAT182.0e-2140.59Show/hide
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        MKR+R    E      +   LM+LSR+         +S+ S ++ N  FECKTCNR+F SFQALGGHRASHKKP+++       D    +    +   H+
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        C+IC   F  GQALGGHMR+HR T+++ +  ++ +   S      PV  + +    I  LDLNLTP END
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Q9LX85 Zinc finger protein ZAT82.1e-2345.57Show/hide
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        R  E+E +  T A CLMLLSR                  RVF CKTC ++FSSFQALGGHRASHKK  ++     +  GS S        +H C ICG+E
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        F +GQALGGHMRRHR+    +   L+T   RS  P+   V  +KKS+ G R+ CLDL+
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Q9SLD4 Zinc finger protein ZAT111.9e-2743.32Show/hide
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          H+CSIC   F  GQALGGHMRRHR++  +  + +      SP     PV+K+     RIL LDLNLTP END  ++  GK ++ K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28710.1 C2H2-type zinc finger family protein2.3e-3346.93Show/hide
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        M+R R ++E I  MANCL+LLS+          +  + + +RVF CKTCN++F SFQALGGHRASH++   + G    S          KP  HEC ICG
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         EFA+GQALGGHMR+HR  +     R L       P   P  +KKS GG   R+LCLDLNLTP EN+   L+LG ++IF
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AT2G37430.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.3e-2843.32Show/hide
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        MKRER      L++I  +A CLM+L++ +       + H ES TS+      FECKTCN++FSSFQALGGHRASHKKP++        D           
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Query:  KTHECSICGLEFAIGQALGGHMRRHRATTLLNDARLLTNHPRSPPPQQPPVVKKSNGGGRILCLDLNLTPSENDSRFLQLGKKYIFK
          H+CSIC   F  GQALGGHMRRHR++  +  + +      SP     PV+K+     RIL LDLNLTP END  ++  GK ++ K
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AT3G46070.1 C2H2-type zinc finger family protein3.3e-2746.63Show/hide
Query:  SITTMANCLMLLSRNTAPDHHFESSTSSSSPNRVFECKTCNRQFSSFQALGGHRASHKKPRIVGGDGGNSDGSSSQGSP-TKPKT------HECSICGLE
        ++ T A+CLMLLS     D             RVF CKTC R F SFQALGGHRASH K         NSD  S  GSP  KPKT      H C ICGLE
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Query:  FAIGQALGGHMRRHRATTLLNDA-RLLTNHPRSPPPQQPPVVKKSNGGGRILCLDLNLTPSEN
        F +GQALGGHMR+HR       A  +L  H   P       +KKS+ G R+ CLD +LT  E+
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AT3G46090.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.2e-2544.85Show/hide
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        T A CLMLLSR        E         RVF CKTC ++FSSFQALGGHRASHKK  ++     NSD  S  GS +  KT   H C ICG++F +GQAL
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AT5G59820.1 C2H2-type zinc finger family protein8.6e-2845.96Show/hide
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        T ANCLMLLSR        + +       RVF CKTC +QF SFQALGGHRASHKKP        N   SS      K  +H C ICG+EF +GQALGGH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAGAGAGAGAGAGCTCGAGAGCATAACAACCATGGCGAACTGCTTGATGTTACTTTCTCGTAACACTGCGCCAGATCATCATTTCGAATCATCTACTTCTTCATC
TTCTCCCAATCGTGTTTTTGAGTGCAAGACTTGCAATCGGCAGTTTTCGTCGTTTCAGGCGCTTGGAGGACATCGTGCTAGTCACAAGAAGCCGCGGATTGTTGGAGGAG
ATGGTGGAAACTCTGATGGATCTTCATCGCAAGGTTCTCCTACTAAGCCGAAGACGCATGAGTGTAGTATTTGTGGATTAGAGTTTGCGATTGGTCAAGCGCTTGGAGGA
CATATGAGAAGACATAGAGCAACAACGCTGTTGAACGATGCTCGATTACTTACAAATCATCCTAGAAGTCCTCCTCCGCAGCAACCGCCTGTGGTGAAGAAGAGCAACGG
CGGTGGGAGAATTCTGTGTTTGGATCTGAATTTGACTCCGTCTGAGAACGATAGTAGGTTTCTGCAGCTTGGAAAGAAGTACATATTCAAACAGATCTCGAAACAGGTTG
AATATGAGTTTTTGTTTTCCCTTTTCTCTTTTTTGATACTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTTCCGTTTCTAATTTTCTTCACACAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAAATTACATTTTCCAATATTCCTTGCTACCTATCATCATGAAGAGAGAGAGAG
AGCTCGAGAGCATAACAACCATGGCGAACTGCTTGATGTTACTTTCTCGTAACACTGCGCCAGATCATCATTTCGAATCATCTACTTCTTCATCTTCTCCCAATCGTGTT
TTTGAGTGCAAGACTTGCAATCGGCAGTTTTCGTCGTTTCAGGCGCTTGGAGGACATCGTGCTAGTCACAAGAAGCCGCGGATTGTTGGAGGAGATGGTGGAAACTCTGA
TGGATCTTCATCGCAAGGTTCTCCTACTAAGCCGAAGACGCATGAGTGTAGTATTTGTGGATTAGAGTTTGCGATTGGTCAAGCGCTTGGAGGACATATGAGAAGACATA
GAGCAACAACGCTGTTGAACGATGCTCGATTACTTACAAATCATCCTAGAAGTCCTCCTCCGCAGCAACCGCCTGTGGTGAAGAAGAGCAACGGCGGTGGGAGAATTCTG
TGTTTGGATCTGAATTTGACTCCGTCTGAGAACGATAGTAGGTTTCTGCAGCTTGGAAAGAAGTACATATTCAAACAGATCTCGAAACAGGTTGAATATGAGTTTTTGTT
TTCCCTTTTCTCTTTTTTGATACTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKRERELESITTMANCLMLLSRNTAPDHHFESSTSSSSPNRVFECKTCNRQFSSFQALGGHRASHKKPRIVGGDGGNSDGSSSQGSPTKPKTHECSICGLEFAIGQALGG
HMRRHRATTLLNDARLLTNHPRSPPPQQPPVVKKSNGGGRILCLDLNLTPSENDSRFLQLGKKYIFKQISKQVEYEFLFSLFSFLIL